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贞观十六年（642年），年仅45岁的唐太宗已过早地衰老了，他毫不隐讳地对臣下们说：“朕年将50，已觉衰怠。”此后，太子谋反，魏王被黜，辅国大臣相继谢世，使唐太宗在精神上受到严重的刺激，这无疑加速了他的“衰怠”。贞观十九年（645年）辽东之役的归途中，他患了痈疮，直到次年二月，“疾未全平，欲专保养”，所以他让太子李治去处理“军国机务”。不幸的是，唐太宗这时开始服食金石之药了。他曾嘲笑秦皇、汉武相信方士的长寿之术，而他自己也终于落入这个窠臼。贞观二十一年（647年）三月，他患了“风疾”。这时，他变得烦躁畏热，因而命人在骊山绝顶修建翠微宫。这大概跟他继续服金石之药有关系。唐太宗一病半年多，虽于同年十一月“疾愈”，但体力大减，只能“三日一视朝”。第二年，唐太宗又派人从天竺访得方士罗迩娑婆寐，因误食了这个异国骗子的“延年之药”使病情急剧恶化。
  贞观二十三年（649年）三月，唐太宗带着沉重的病体，十分勉强地来到显道门，宣布了他的最后一道敕令。五月，大概是丹药毒性大发，唐太宗腹泻不止，名医为之束手。弥留之际，他向太子李治、长孙无忌、褚遂良一一交代了后事。接着，他便永远告别了他统治了23年的唐王朝。