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建国后，成吉思汗在蒙古建立了分封制度。他将开国功臣95人授为千户长，木华黎、博尔术、纳牙阿、豁尔赤四人授为万户长，给予封地，贵族世袭。其封地不按原来血缘关系的部落、氏族划分，而按地域划分。区内牧民被编为十、百、千、万户，由千户长、万户长率领，实行军政合一的体制。凡15岁以上，70岁以下的男子皆为士兵。设左、中、右三军。为了加强成吉思汗的地位和权力，组织了一支万人的“怯薛”军，即护卫军。这是一支主要从贵族子弟中选拔的身强力壮、战斗力很强的精锐部队，由大汗直接掌握。平时保卫大汗，战时随大汗出征。
  蒙古汗国相继颁布了《大札撒》，即法令和法典，设断事官，创立了蒙古文字。