至2005年底,牡丹区工商分局共设20个工商行政管理所,其中副科级建制所11个,正股级所9个。
东城工商所:副科级设置,位于丹阳路,人员编制17人,实有人员97人,辖区面积12平方公里,有现代科技市场、九州商场、汇丰农贸城、中原科技商城、王胡同干鲜水果市场、汽车配件城、高平路农贸市场9处市场,个体户2050户,国有、集体、私营企业815户。
南城工商所:副科级设置,位于长江路西端,人员编制18人,实有人员76人。辖区面积12.5平方公里,14个社区居委会,有南关菜市场、定陶路农贸市场、中山路农贸市场3处市场,个体户1080户,私营企业200户。
西城工商所:副科级设置,位于八一西街西端路北,人员编制16人,实有人员73人,辖区30平方公里,管辖27个行政村6个社区,有鲁西南蔬菜批发市场、西城蔬菜市场、杜庄农贸市场、杨店农贸市场、杜庄杨家庙农贸市场5处市场,个体户800户,私营企业50户。
北城工商所:副科级设置,位于牡丹区康庄西路北关巷街134号,人员编制9人,实有人员63人,辖区有段海农贸市场1处,个体户862户,私营企业93户。康庄工商所:副科级设置,位于康庄乐园服装市场内,共有人员48人,辖区有两处专业市场,即康庄乐园服装大市场、鲁西南五金建材大市场,商户1500户。
何楼工商所:副科级设置,位于何楼办事处刘民路东侧,人员编制13人,实有人员29人,辖区78平方公里,43个行政村,7万余人。有何楼、金堤2处农贸市场,个体户281户,私营企业16户。
马岭岗工商所:副科级设置,位于马岭岗镇,人员编制12人,实有20人,辖区面积40平方公里,有马岭岗、二郎庙、解安集、通古4处农贸市场,个体工商户320户,私营企业16户。
黄罡工商所:副科级设置,位于黄罡镇,人员编制10人,实有人员16人,辖区面积97平方公里,有黄罡、侯集2处农贸市场,个体户300户,私营企业10户。
李村工商所:副科级设置,人员编制12人,实有人员17人,辖区101.4平方公里,有李村、杨镇集、李庄集3处农贸市场,个体户210户,私营企业7户。
沙土工商所:副科级设置,有人员19人,辖区160平方公里,有沙土、新兴、芦村、赵庄、五道街、铁佛李、康集7处农贸市场,个体工商户430户,企业80家。
安兴工商所:副科级设置,位于胡集镇南端220国道东侧,人员编制12人,实有人员24人,辖区面积83.6平方公里,有安兴、胡集、前屯、徐庄、龙凤5处农贸市场,个体户233户,私营企业17户。
高庄工商所:股级设置,位于高庄镇,人员编制8人,实有人员9人,管辖34个行政村近6万人,辖区80平方公里,有高庄、李集、天庙、白虎4处农贸市场,个体户160户,私营企业4户。
小留工商所:股级设置,位于小留镇菏鄄路东侧,人员编制7人,实有人员
20名,有小留、马村2处农贸市场,个体工商户180户,私营企业16户。
吴店工商所:股级设置,位于吴店镇菏鄄路东侧,人员编制6人,实有人员15人,辖区面积57平方公里,32个行政村,5万人口,有吴店、刘寨2处农贸市场,个体户178户,私营企业10户。
王浩屯工商所:股级设置,位于王浩屯镇,人员编制13人,实有人员11人,辖区54平方公里,有王浩屯农贸市场1处,个体户160户,私营企业7户。
黄集工商所:股级设置,位于220国道西侧黄集镇,人员编制6人,实有人员15人,管辖35个行政村,辖区86平方公里,有黄集、李捌老、安陵3处农贸市场,个体户130户,私营企业14户。都司工商所:股级设置,位于202国道东侧,人员编制7人,实有人员11人,辖区面积42平方公里,有都司、唐李庙、西马海3处农贸市场,个体户110户,私营企业21户。
皇镇工商所:股级设置,位于皇镇乡,人员编制13人,实有12人,辖区面积47平方公里,有皇镇、夹河赵2处农贸市场,个体工商户250户,私营、集体企业共计39户。
赵楼工商所:股级设置,位于牡丹乡,人员编制6人,实有人员16人,辖区面积42平方公里,有赵楼、李集、庞王3处农贸市场,个体户210户,私营企业26户。
吕陵工商所:股级设置,人员编制13人,实有人员13人,辖区面积111.4平方公里,有吕陵、贾坊2处农贸市场,个体户206户,私营企业11户。