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晋江市妇幼保健院前身为晋江县防疫站妇幼股，1985年1月创建妇幼保健所。位于晋江市青阳街道相府路12号。1998年4月撤所建院，1999年9月，通过“一级甲等”妇幼保健院评审。1993年9月，医院门诊大楼落成并投入使用，2001年8月，医院病房综合楼落成投入使用。至2007年底，医院共有办公室、党务科、财务科、总务科、医教科、护理部、人事科、保卫科等职能科室以及婚姻保健科、妇女保健科、儿童保健科、医技科、健康教育科、妇产科、儿科、生殖健康科等8个一级业务科室，医技科设有放射科、检验科、B超科、心电图室、手术室、药房、供应室、治疗室等。 市妇幼保健院占地面积2365平方米，1989年建筑面积3170平方米，其中业务用房（门诊楼）2480平方米，生活用房690平方米。2001年，建筑面积7870平方米，病房综合楼4700平方米。检验水平不断发展。1987年开展常规检验项目，先后购置血球计数仪、血凝仪、尿11项检查仪；2003年购置日立7080全自动生化仪，2004购置美国PE荧光定量PCR检测系统。2005年3月，市妇幼保健院开始筹建临床基因扩增实验室，2007年1月，临床基因扩增实验室顺利通过卫生部临床检验中心专家组现场技术验收，成为福建省首家通过临床基因扩增实验室验收的县级妇幼保健院。仪器设备不断升级，先后购置贝克2101型B超、西门子G50彩超、VIZ-YDY数码电子阴道镜、500mAX光机、心电监护仪、胎心监护仪、新生儿呼吸机、新生儿抢救台、拓普康眼科全自动电脑验光仪及角膜曲率测量仪、儿童弱视矫治仪、牙科用X光机、红外线乳腺检查、治疗仪、微波红外线治疗仪、固有荧光诊断仪（宫颈癌早期筛查）、脐血流仪等。 1984年11月，市妇幼保健院核定人员编制15人；1999年1月，编制增至53人，实有在编工作人员41人，其中卫生技术人员39人（副高职称2人，中级职称9人）；2007年5月，编制增至80人，实有在编工作人员72人，其中卫生技术人员66人（正高级职称1人，副高级职称4人，中级职称17人）。 1996年4月，晋江市荣获全国社区康复先进市，1996年11月，市妇幼保健院被评为“全国妇幼卫生工作先进单位”；2003年2月，荣获全国“巾帼文明示范岗”称号。2000年，开展顺产分娩及一般子宫下段剖宫产术，2003年，开展腹膜外剖宫产、子宫肌瘤、产科危、急、重病人抢救等难度较大的手术，现为全市高危孕产妇接诊单位，妇产科业务相当二级综合医院水平。2005年7月起，启动“降低孕产妇死亡率项目”工作，2008年1月，通过省级验收；2005年11月，全面启动艾滋病母婴阻断传播实施项目。 1998年，市妇幼保健院门诊量4.38万人次，住院552人次；2002年门诊量7.4万人次，住院1288人次2007年门诊14.9万人次，住院3175人次。