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一、市属卫生机构（医疗、疾控、妇幼保健）
  （一）晋江市医院
  晋江市医院建于1936年，其前身是晋江县卫生院，1956年更名晋江县医院，1988年3月，医院整体搬迁至晋江县青阳镇新大街南路。1992年，更名为晋江市医院。1991年，与第三军区大学附属第一医院共建医疗联合体；1993年、1995年，分别与湘潭市第一医院、福建医科大学附属第一医院建立协作关系。医院整体综合实力不断壮大，临床科室方面：1998年，临床科室增至7个病区；2002年，临床科室增至13个，设11个病区；2007年，临床科室增至14个，设12个病区。医技科室方面：2000年，成立体检科；2004年5月，建立核磁共振室；2006年，成立血透室、高压氧室。至2007年，共有医技科室16个：药剂科、放射科、CT室、磁共振室、放疗科、超声科、检验科、病理科、功能检查室、内镜室、碎石室、高压氧室、血液透析室、手术室、供应室、体检科。1998年8月，福建省卫生厅批准晋江市医院为二级甲等综合性医院，授予“爱婴医院”资质；1999年，分别与福建医科大学、福建医科大学莆田分校签订“实习医院”“教学医院”协议；2006年，接管龙湖镇卫生院，改设为晋江市医院晋南分院；2007年11月，市医院成为泉州医学高等专科学校教学医院。
  1988—2007年重要建设有：1988年门诊楼“爱国楼”落成，5层3028平方米；1988年建成投入使用的医技楼，5层3767平方米；1993年建成投入使用的内科楼，5层3260平方米；1994年建成投入使用的华侨楼，5层1347平方米；2002年11月建成投入使用的病房综合大楼，12层15521平方米；2003年10月建成投入使用的医学培训中心，6层4072平方米；2005年建成投入使用的晋江市应急救治中心楼，6层2881平方米；2005年建成的高压氧舱楼，3层750平方米。至2007年，市医院业务用房总面积为37000平方米。
  市医院1991年编制床位310张，1993年编制床位数400张，1996年编制数床位450张，2007年编制床位数650张。
  1991年，医院职工242人，其中卫技人员207人。2000年，医院职工327人，其中卫技人员286人；高级职称23人，中级职称67人。2007年，医院职工630人，其中卫技人员489人，高级职称39人；中级职称139人。
  1991年，医院门诊量9.23万人次，出院病人1.76万人次。2000年，门诊量13.40万人次，出院病人1.19万人次。2007年，门诊量38.35万人次，出院病人2.22万人次。
  （二）晋江市安海医院
  晋江市安海医院系1957年由爱国归侨倪端仪首倡，广大侨胞、港澳同胞集资创建，同年6月正式启用。医院位于晋江市安海镇海八中路92号。建院初期属侨办公助集体所有制医院，1984年9月经县政府批准按全民所有制管理。1995年，通过全国“爱婴医院”达标评估。2002年，确认为“二级乙等”综合医院。1998—2007年，市、镇两级财政共拨款1390万元，社会捐款（含设备款）人民币836.02万元，港币100万元，用于大楼建设及购置设备。2000年3月，外科拆分为外科、骨科。2005年5月，开设专家门诊，6月，开设胃镜室、院前急救站（120急救中心），7月与中国人民解放军175医院、南京军区骨科研究所协作成立骨科诊疗中心，9月，内科拆分为内一科（神经内科、呼吸内科、内分泌科）、内二科（心血管内科、消化内科、血液科），10月，成立康复医学科，11月，成立体检站，12月，开设五官科病房。2006年3月，成立社区医疗综合服务部，4月，成立手外科，7月，成立神经外科。2007年4月，神经外科开设ICU病房（重症加强护理病房），5月，开设彩超检查室，10月，开设高压氧治疗室，12月，开设碎石治疗室。至2007年，医院开设内一科、内二科、外科、神经外科、骨科、手外科、小儿科、妇产科、五官科、急诊科、中医科、皮肤科、痔疮科、康复医学科等20多个一级临床科室和10多个医技科室。
  医院占地面积27195.85平方米，总建筑面积33397平方米。其中，业务用房22502平方米。包括五层门诊综合大楼6600平方米，七层综合病房大楼15902平方米，四层“恒安楼”1625平方米，二层“四化楼”1198平方米。
  1988年，病床编制200张，在编工作人员176人。1993年，病床编制200张，在编工作人员194人。1997年，病床编制360张，实际开放200张，实有在编工作人员209人，其中高级职称2人、中级职称42人。2007年，编制床位475张，实际开放475张，职工总数500余人，其中正式职工292人、离退休职工109人，高级职称26人、中级职称62人，硕士研究生6人、副教授12人、讲师18人，国家级医学会委员1人、省级医学会委员6人。
  1988年，医院门诊量4225人次，出院病人3982人次。1993年，门诊量46363人次，出院病人4277人次。1997年门诊量58769人次，出院病人4959人次。2007年，门诊量和出院病人分别增至212009人次、18746人次。
  （三）晋江市医院晋南分院
  晋江市医院晋南分院前身为龙湖镇卫生院，始建于1958年9月，位于晋江市龙湖镇前港新村路口（龙湖镇中山街南路18号），设有衙口分院。1996年，旅港乡贤施子清、洪祖杭慷慨捐资380万元筹建晋南医院，即现门诊楼。门诊楼于2002年竣工，同年龙湖镇卫生院正式搬迁，并改名晋南医院。2002年11月，被确定为“一级甲等”医院。2006年2月17日，晋江市委、市政府决定在原龙湖镇卫生院的基础上，正式组建晋江市医院晋南分院，由晋江市医院管辖，并列为晋江市2006年为民办实事项目之一。按二级综合医院的标准建设，履行公立非营利性医疗机构的职能，并承担原龙湖镇卫生院责任区域内预防保健、爱国卫生、健康教育等公共卫生工作职责。晋江市医院于2006年6月5日正式接管。2007年1月21日，启动120晋南分中心。业务科室随业务扩展不断增加。至2007年末，共设科室30余个。设有内儿科、外科、妇产科3个病区；临床科室10个：内儿科、外科、妇产科、口腔科、五官科、中西医结合科、皮肤科、肛肠外科、理疗科、肠道门诊等；医技功能科室8个：手术室、药房、检验科、放射科、胃镜室、脑彩超室、B超室、心电图室，以及防疫组和120急救分中心。
  1988年，龙湖乡卫生院全院占地面积3500平方米，建筑面积2400平方米，其中业务用房1500平方米，生活用房900平方米，设有病床45张。2000年，床位数增至60张。2002年，龙湖镇卫生院迁入晋南医院，占地面积2.66公顷，建筑面积5420平方米，设有门诊大楼、住院护理部业务用房等。至2007年，医院床位数增至75张，服务半径由原龙湖镇扩至晋江市晋南地区（龙湖、深沪、金井、英林四个乡镇及永和镇部分区域），同时，完成2.8公顷土地扩征工作，用于筹建病房综合大楼。2007年12月8日，新病房综合大楼奠基，为晋南分院一期建设的主要项目，计划投资5500万元，建筑面积16580平方米，设计病床305张。
  1997年，卫生院在编人员数36人，其中卫技人员32人，固定资产42万元。2006年，晋江市医院接管时，在编人员34人，临时人员20人。2007年，职工总数增至71人，在编人员43人，其中卫技术人员40人，固定资产增至997万元。
  2007年，医院门诊量65349万人次，出院人数3519万人次，床位使用率101.24%。业务总收入1267.98万元。
  （四）晋江市中医院
  晋江市中医院前身是晋江县中医门诊部。1984年12月，正式成立晋江县中医院，1992年晋江撤县设市，更名为晋江市中医院，原址位于晋江市青阳新大街南路33号。1996年，医院与32525部队签订土地换建协议，位于青阳沟头山的原部队135医院及营地成为晋江市中医院的新院址，即为晋江市梅岭街道泉安中路1105号（沟头山）。1997年2月，医院在青阳新大街33号旧院址保留开诊的基础上，在新院址正式挂牌开诊，1999年被确认为国家“二级甲等”中医院。医院科室设置：2004年4月增设普外科，2005年10月设立手外科。至2007年，医院共有骨伤科、手足外科、内科、普外科、妇产科、急诊科、手术室、中医外科、皮肤科、康复理疗科等一级临床科室20多个和医技和保障科室7个，同时设立独具特色的专科专病门诊11个，临床科室病区增至6个。
  中医院占地面积32600平方米，总建筑面积41585平方米，其中业务用房36757平方米。其中，6层门诊大楼9860平方米，12层病房大楼26897平方米（2006年10月动工建设，2007年11月主体封顶，进入全面装修阶段）；二层行政办公楼950平方米，职工宿舍楼3幢共2500平方米。
  1988年，医院与省中医学院骨伤科合作，开设骨科诊疗中心，开设病床40张。1996年，病床编制60张，实有在编工作人员64人，其中卫生技术人员56人（副高级职称5人，中级职称8人）。1997年，病床编制数60张，人员编制120人，实有在编工作人员68人，其中卫生技术人员42人（副高级职称6人，中级职称12人）。2007年，病床编制数200张，实际开放病床250张，人员编制391人，其中卫生技术人员127人（正高级职称0人，副高级职称17人，中级职称24人）。
  1996年，业务总收入约300万元。1997年，门诊量4.65万人次，出院病人0.2442万人次；2007年，门诊量和出院病人分别增至30.85万人次、1.03万人次。
  （五）晋江市疾病预防控制中心
  晋江市疾病预防控制中心前身是晋江县卫生防疫站，原址在晋江青阳下行陈村。1992年5月，随撤县建市更名为晋江市卫生防疫站。1996年5月，投资500万元择现址建卫生检测大楼，1999年12月，新站落成乔迁，地址位于晋江市青阳镇洪宅垵仑顶村。2005年，撤销晋江市卫生防疫站，组建晋江市疾病预防控制中心。2005年3月，经晋江市政府审批，同意投资2400万元增建晋江市疾病预防控制中心实验综合大楼。该楼于2006年12月26日动工，2007年11月5日封顶。
  1988年，晋江县卫生防疫站设6个股室：行政、卫生、防疫、防痨、宣教、检验。2005年，晋江市疾病预防控制中心设有12个科室：办公室、后勤科、防疫科、防痨科、劳动卫生科、学校卫生科、环境卫生科、食品卫生科、检验科、健康教育科、消杀科、质量管理办公室。2006年7月，后勤科并入办公室，增设性病艾滋病防治办公室、应急办，挂靠防疫科。2007年4月，环境卫生科与消杀科合并为公共卫生科。是年年底，中心共有办公室、质量管理办公室、防疫科、防痨科、劳动卫生科、学校卫生科、公共卫生科、食品卫生科、检验科、健康教育科等10个业务科室。
  市疾控中心占地面积11483平方米，其中建筑用地面积2076平方米，道路绿地面积8420平方米。主要建筑及建筑面积方面：7层卫生检测大楼7243平方米，地下1层、地上12层的实验综合大楼13799.6平方米。1997年起，疾控中心（卫生防疫站）先后购进原子吸收分光光度计、气相色谱仪、微生物细菌鉴定系统、高效液相包谱仪等仪器设备100余台（件），开展使用原子吸收分光光度计测定金属元素Cu（铜）、Zn（锌）、Fe（铁）、Mn（锰）、Pb（铅）、Cd（镉），气相色谱仪测666、DDT（双对氯苯基三氯乙烷）、山梨酸、苯甲酸、苯、甲苯、二甲苯，微生物细菌鉴定系统快速测定致病菌，测定HIV抗体（艾滋病抗体）。2005年后，开展原子荧光法测定金属元素Se（硒）、Sn（锡）、Hg（汞）、As（砷），和麻疹、疯疹抗体测定等检测新项目、新技术。2007年具备对食品、食品添加剂、食品用产品、饮用水、涉水产品、公共场所卫生、劳动卫生、消毒及一次性使用医疗、卫生用品等99个项目的检测能力。
  1988年，卫生防疫站实有在编工作人员60人，其中卫生技术人员41人（中级职称6人）；1997年，人员编制74人，实有在编工作人员87人，其中卫生技术人员61人（中级职称18人）；2005年，疾控中心人员编制86人，实有在编工作人员79人，其中卫生技术人员58人（副高级职称2人，中级职称19人）；2007年，人员编制86人，实有在编工作人员82人，其中卫生技术人员55人（副高级职称4人，中级职称19人）。
  疾控中心坚持以预防为主，以控制各种疾病发生。1994—2007年，晋江市未再出现脊髓灰质炎病例。1997—2007年未出现白喉病例。1998年8月，晋江市卫生防疫站通过省技术监督局组织的计量认证。1999年3月，晋江市卫生防疫站被省卫生厅确认为一等卫生防疫站。4月，被福建省卫生厅批准为设立艾滋病病毒抗体检测初筛实验室的单位。1999年，消灭丝虫病指标通过省级专家验收。2000年，档案管理达省一级档案室标准。2000年，启动卫IX艾滋病项目管理，加强性病、艾滋病防制工作。2001年，在全市开展计划免疫接种门诊规范建设。2002年，启动世行贷款/英国赠款“中国结核病控制项目”预算控制与治疗工作，实施结核病人全程治疗补助制度，以确保结核病病人的治愈率。2003年，建立健全公共突发事件应急体系。2004年，晋江市鼠疫流行病学研究及监测项目、晋江市室内蜚蠊生态学调查项目获晋江市科学技术奖科技进步奖三等奖。2004年，全市疫情报告与省联网，使疫情报告准确、快捷。2004年10月，通过省技术监督局组织的计量认证、中国实验室国家认可委员会组织的国家实验室认可。2005年，晋江市成为全国艾滋病防治示范区，同年12月，通过消除碘缺乏病阶段目标省级评估。2006年11月，通过省级职业卫生健康检查资质认可。2005年—2007年，成为国家级碘盐实验室。2007年，结核病防治工作通过世界卫生组织和卫生部的联合督导检查。
  （六）晋江市妇幼保健院
  晋江市妇幼保健院前身为晋江县防疫站妇幼股，1985年1月创建妇幼保健所。位于晋江市青阳街道相府路12号。1998年4月撤所建院，1999年9月，通过“一级甲等”妇幼保健院评审。1993年9月，医院门诊大楼落成并投入使用，2001年8月，医院病房综合楼落成投入使用。至2007年底，医院共有办公室、党务科、财务科、总务科、医教科、护理部、人事科、保卫科等职能科室以及婚姻保健科、妇女保健科、儿童保健科、医技科、健康教育科、妇产科、儿科、生殖健康科等8个一级业务科室，医技科设有放射科、检验科、B超科、心电图室、手术室、药房、供应室、治疗室等。
  市妇幼保健院占地面积2365平方米，1989年建筑面积3170平方米，其中业务用房（门诊楼）2480平方米，生活用房690平方米。2001年，建筑面积7870平方米，病房综合楼4700平方米。检验水平不断发展。1987年开展常规检验项目，先后购置血球计数仪、血凝仪、尿11项检查仪；2003年购置日立7080全自动生化仪，2004购置美国PE荧光定量PCR检测系统。2005年3月，市妇幼保健院开始筹建临床基因扩增实验室，2007年1月，临床基因扩增实验室顺利通过卫生部临床检验中心专家组现场技术验收，成为福建省首家通过临床基因扩增实验室验收的县级妇幼保健院。仪器设备不断升级，先后购置贝克2101型B超、西门子G50彩超、VIZ-YDY数码电子阴道镜、500mAX光机、心电监护仪、胎心监护仪、新生儿呼吸机、新生儿抢救台、拓普康眼科全自动电脑验光仪及角膜曲率测量仪、儿童弱视矫治仪、牙科用X光机、红外线乳腺检查、治疗仪、微波红外线治疗仪、固有荧光诊断仪（宫颈癌早期筛查）、脐血流仪等。
  1984年11月，市妇幼保健院核定人员编制15人；1999年1月，编制增至53人，实有在编工作人员41人，其中卫生技术人员39人（副高职称2人，中级职称9人）；2007年5月，编制增至80人，实有在编工作人员72人，其中卫生技术人员66人（正高级职称1人，副高级职称4人，中级职称17人）。
  1996年4月，晋江市荣获全国社区康复先进市，1996年11月，市妇幼保健院被评为“全国妇幼卫生工作先进单位”；2003年2月，荣获全国“巾帼文明示范岗”称号。2000年，开展顺产分娩及一般子宫下段剖宫产术，2003年，开展腹膜外剖宫产、子宫肌瘤、产科危、急、重病人抢救等难度较大的手术，现为全市高危孕产妇接诊单位，妇产科业务相当二级综合医院水平。2005年7月起，启动“降低孕产妇死亡率项目”工作，2008年1月，通过省级验收；2005年11月，全面启动艾滋病母婴阻断传播实施项目。
  1998年，市妇幼保健院门诊量4.38万人次，住院552人次；2002年门诊量7.4万人次，住院1288人次2007年门诊14.9万人次，住院3175人次。
  二、乡（镇）卫生院（社区卫生服务中心）
  （一）卫生院设置
  1988年，全县设有乡（镇）卫生院18家，1989年，晋江县划出祥芝、永宁、蚶江、石狮4个乡镇设立石狮市，该4个乡镇卫生院随行政区域变化划归石狮市，至此，晋江县共有乡镇卫生院14家。1996年，成立西滨镇卫生院；2003年11月，撤销青阳、罗山2个镇建制，设立青阳、梅岭、西园、罗山、新塘、灵源6个街道办事处，2004年、2006年，青阳镇卫生院、罗山镇卫生院撤消，设立街道社区卫生服务中心；2005年，原英墩华侨医院由晋江市人民政府接管，由私立营利性医院转为公立非营利性医院，保留原有名称，纳入市卫生局直属管理；2006年，市政府决定在龙湖镇卫生院（晋南医院）的基础上组建晋江市医院晋南分院，由市医院管辖。至2007年，全市共有镇卫生院14家（含英墩华侨医院），分别是磁灶中心卫生院、金井中心卫生院、英林中心卫生院、陈埭镇卫生院、东石镇卫生院、安海镇卫生院、深沪镇卫生院、永和镇卫生院、池店镇卫生院、内坑镇卫生院、紫帽镇卫生院、西滨镇卫生院、英墩华侨医院。
  （二）卫生院建设
  1995年以来，市财政不断加大投入，用于镇卫生院的基础设施建设和购置设备。陈埭卫生院1997年迁入新院，西滨镇卫生院建设列入2006—2007年度市委、市政府为民办实事工程项目，投入1200万元；内坑镇卫生院于2003年翻建综合楼，2005年投入使用；东石镇卫生院于1999年着手征地2040平方米，2003年9月新院落成投入使用；深沪镇卫生院门诊综合楼扩建工程2065平方米，于1994年7月竣工使用；金井中心卫生院由爱国华侨陈祖昌捐资100多万元的门诊综合楼于1990年搬迁，2001年，陈祖昌再次捐资200万元建设病房大楼，于2002年投入使用；1994年，旅港同胞洪祖杭捐资140万元建立英林中心卫生院怀乡楼，2000年，旅菲华侨洪麟麟捐资300万元建立思亲楼。
  （三）社区卫生服务中心
  2003年，青阳、罗山撤镇建街道办事处后，青阳卫生院、罗山卫生院撤销，分别于2004年、2005年、2006年、2007年成立梅岭街道社区卫生服务中心、灵源街道社区卫生服务中心、新塘街道社区卫生服务中心、罗山街道社区卫生服务中心等4个社区卫生服务中心，均为市卫生局管理的事业单位，每个中心核定事业编制15人，其中卫生技术人员比例不低于80%。
  三、卫生所
  1989年，全县有村卫生所356个。1994年，全市有村卫生所387个。1997年，全市有村卫生所535个。
  1999年起，晋江市卫生局把创建甲级卫生所作为加强村级卫生机构建设，提高农村医疗卫生服务能力的重要工作来抓，制定工作方案，召开工作会议，动员部署创建甲级卫生所。经过市、镇、村三级卫生工作者的共同努力，在全市范围内创建的78家甲级卫生所全部通过验收，超额完成泉州市下达的创建50家甲级卫生所的任务。
  2000年，晋江市对全市468家村卫生所进行全面审评，有283家达到甲级卫生所标准。
  2001年，组织3轮甲级卫生所验收，有26家合格。
  2002年，晋江市又有132家村卫生所和32家个体诊所通过甲级卫生所验收，全市甲级卫生所验收合格率98%。
  2005年，晋江市积极扶持8个“空白村”建立村卫生所，实现全市村村有卫生所。至2007年，全市有村卫生所773家。
  四、民营医疗机构
  1988年，全县有私人诊所392家，医务人员392人。
  1997年，全市民营医疗机构有英墩、水仙、金川医院3家，村级卫生所535家，社会医疗机构309家（诊所、门诊部、企事业单位卫生所、室）。
  2001年，民营医疗机构4家（医院3家、门诊部1家）。
  2002年，民营医疗机构11家（医院7家、门诊部4家）。
  2003年，民营医疗机构22家（医院13家、门诊部9家）。
  2004年，民营医疗机构33家（医院19家、门诊部14家）。
  2005年，全市有民营医疗机构40家（医院22家、门诊部及其他18家），床位580张。
  2006年，全市有民营医疗机构44家（其中医院27家、门诊部及其他17家）。
  2007年，全市有民营医疗机构43家，卫技人员759人，其中医生282人，护士87人；个体诊所36家，卫技人员92人。