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（一）市级财政体制
  1988年，实行“划分收支，核定基数，定额缴补，增收多留，分类包干，自求平衡”的新体制。体制核定收入基数6172万元，支出基数3597万元，定额上解2575万元，扣除耕地占用税、城建税、工商罚没收入等专项结算收入后，县留70%，上缴市30%。县财政为使收入上新台阶，给予乡镇和税务部门一定比例的增收分成，有效提高收入积极性，1989年财政收入首次破亿元，1992年破双亿元。
  1993年，实行“增收分成，定额递增，一定三年”体制。
  1994年，开始实行分税制财政体制，消费税100%、集体金融企业所得税100%、增值税75%上划中央；省对县级市实行“一三三”财政体制，即增值税10%、营业税30%、所得税30%、资源税15%、耕地占用税20%、土地使用税20%、土地增值税40%的分成办法，罚没收入省固定分成20%。核定晋江市收入基数14169万元，支出基数24649万元，定额补助10480万元。泉州对晋江市实行以收入基数增收分成12.5%的办法，即（当年地方本级收入－上缴省级部分－罚没款等专项收入－1993年核定收入基数14226万元）×12.5%。
  1996年，实行“划分收支、核定基数、增（超）收分成、短收扣支、自求平衡”的财政体制。晋江市财政局加挂晋江市国有资产管理局牌子。出台《晋江市预算外资金管理暂行规定》，建立“基本建设债务偿还调节基金”。
  2000年，出台《晋江市行政事业性收费票款分离暂行规定》和实施办法，市镇两级全面推行行政事业性收费“单位开票、银行收款、财政统管”的票款分离制度。全面推行党政群机关和全额事业单位的工资统发。
  2001年，开通晋江市政府采购网。
  2002年，国务院实施所得税分税改革，所得税分享比例为中央和地方各50%；晋江市市级单位会计核算中心成立，为副科级事业单位，由市财政局管理，负责办理纳入核算的行政事业单位财务管理和会计核算。全市386个市直党政群机关事业单位及所属基层所站纳入会计集中核算，实行账户管理、资金结算、会计核算、档案管理“四个统一”。
  2003年，对年终预算外资金收入结余分配办法进行改革，取消按收入计提15%政府偿债基金的办法，将收入结余分配为政府性基金、政府偿债基金。是年，分享比例改为中央60%，地方40%。省财政对市县体制相应调整，市县企业所得税划转基数按其2000年地方企业所得税收入和2001年1—9月增长率计算核定；其他划转收入基数按2001年实际数计算；按照2001年标准人均财力不足1.03万元差额部分调增体制补助。重新核对财政收入基数64605万元，财政支出基数65433万元，定额补助828万元。
  泉州对晋江实行固定基数、增量分成上解和一定比例超收返还的财政体制。固定基数以2001年上交泉州的财政超收分成为基数，核定数额5385万元；增量分成为（晋江市地方本级收入—专项收入—固定扣除基数61464万）×12.5%；泉州返还增量分成的80%，但固定扣除基数以每年12%比例增长，即超收返还为（晋江地方本级收入－专项收入－61464万×1.12n）×12.5%×80%,n＝年份－2001。
  2004年，保留晋江市财政局为市政府工作部门，机构规格为正科级。成立票据管理中心、国库支付中心。实行“划分收支、核定基数、增量分享、分类考核、一定三年”的市对镇财政体制。参照省分税制财政体制，将地方财政收入按类款项目、税种划分为市级收入、镇（街道）级收入、市镇（街道）共享收入。
  2005年，市政府组建晋江市国有资产投资经营有限责任公司，委托财政局管理，组织形式为国有独资有限公司。成立契税直征所，负责契税直接征收管理工作。
  2006年，全面推进电子化票据改革，100家单位建立电子化票据管理系统，“收支两条线”管理进一步深化；出台《晋江市政府采购资金财务管理暂行办法》，严格政府采购审核和资金拨付、清算程序。
  2007年，经市委机构编制委员会批准，成立晋江市政府财政投资项目评审中心，为市政府直属正股级事业单位，由市财政局管理，负责全市财政性资金投融资项目工程概算、预算、竣工决算（结算）的评估审查。出台《晋江市人民政府关于进一步推进企业改制上市工作的意见》，财政拨出1000万元设立“晋江市企业上市发展专项资金”。
  （二）市（县）对镇财政体制
  1991年，晋江县对镇实行“定收定支，增（超）收分成，短收扣支，超支不补，节余留用，一定二年”财政体制，两年来乡镇共得工商税收增收分成1001万元，城建税分成286.9万元，调动乡镇一级组织财政收入的积极性。
  1993年，晋江市对乡镇实行“划分收支、核定基数、增（超）收分成、短收扣支、超支不补、节余留用”财政体制，扩大支出包干范围和超收分成比例，乡镇共得工商税收增收分成1900多万元，城建税分成330万元。
  1994年，为贯彻分税制财政体制改革，市对乡镇财政体制作一定修改，增大特产税、工商各税增（超）收分成比例，进一步完善乡镇财政体制，当年乡镇增收2089万元。
  1996年，实行“划分收支、核定基数、增（超）收分成、短收扣支、自求平衡”的财政体制，划分收支包干范围（镇卫生院、支农专款采取专项拨款形式，不列入包干范围），核定收支基数：收入基数中，农业税、特产税以每年下达任务数为基数，其他收入按上年实际入库数为基数，工商税收以核定的1995年本级实际入库数作为计算增（超）收分成基数；支出基数以上年度各镇在册人员实际工资额并考虑增资因素核定。收入基数核定后，地方级工商税收当年实际入库数比上年增收部分按10%比例分成给各镇，比年初市下达给乡镇任务数超收部分按30%比例分成给各镇；特产税在当年市下达任务以内部分30%分成给镇，超任务部分全额回拨给镇级；农业税、特产税当年完不成收入任务的，按短收数扣减下年度支出包干指标。
  2004年，实行“划分收支、核定基数、增量分享、分类考核、一定三年”的市对镇财政体制。参照省分税制财政体制，将地方财政收入按类款项目、税种划分为市级收入、镇（街道）级收入、市镇（街道）共享收入。市级财政主要承担市级政权机关运转、国民经济结构调整和宏观调控，以及市级直接管理负责的社会事业发展支出；镇级财政承担维护机关正常运转和促进经济社会事业发展各项支出。以各镇（街道）2003年地方级收入为基础，每年适度递增作为当年镇级收入基数，超基数部分实行市对镇（街道）分类分档分成。建立增收激励机制，在保证完成当年收入基数和实现收支平衡前提下，各镇（街道）可从增量分成中按规定提取一定比例建立奖励基金；规范转移支付，明确市对镇（街道）专项转移补助、市对村（居、社区）转移支付补助和教育专项转移补助标准。
  2007年，实行“划分收支、核定基数、分档分成、分类考核、一定五年”的新一轮市对镇（街道）财政体制。财政收入划分为市级收入、镇级收入和市镇共享收入，考虑到五年内发展变数复杂，采取环比计算办法，以市镇共享收入每年实际入库数增长10%作为下一年度收入基数，实行基数内分类分档固定分成，超基数分类分档增量分成，把新增财力大头留给基层；对经济开发区、出口加工区等功能区内的企业税收采取单列管理，实行市、功能区和被征地镇（街道）按比例分成；为平衡区域财力差异，市财政从增量分成资金中提取10%建立财政预算内稳定调节基金。
  新一轮财政体制强化激励约束机制，在保证完成当年收入基数和实现收支平衡的前提下，各镇（街道）可按规定从分成资金中提取一定比例奖励基金作为相关经费补充；对积极化解镇级债务的，市财政给予适当奖励。制订较为规范的转移支付办法，市财政为主承担全社会基本需求，强化民生保障，对镇（街道）、村（社区）实行组织运转、计生、教育、社会保障、城建等专项补助。