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一、溪河特征
  （一）溪河自成单元独流入海
  境域除晋江、九十九溪、九溪外，其他26条溪河均发源于境内的丘陵、台地。这些溪河源近流短，流程5千米以上的仅有9条，且自成单元向东、向南独流入海。
  （二）河道浅窄、河网密度大
  溪河总长度为171.22千米，河道浅窄，河网密度大，为全省平均密度（0.106千米/平方千米）的一倍，达0.214千米/平方千米。
  （三）流量、水位季节变化明显
  晋江溪河的流量，水位季节变化与降水量的季节分配密切相关。春夏季溪河水量多、水位上涨，为丰水期，尤其7—9月受台风的影响，流量激增，水位暴涨，在干旱季节则多为断流。由于降水的变率和降水量的年际变化比较大，溪河每年平均流量的变化也比较明显。
  （四）河水含沙量大
  境域溪河河床多为砂质、沙壤质，境内森林覆盖率低，水土流失严重，河水含沙量多。尤其受近年开山采石等人为因素影响，加剧地表的冲刷，增加河水的含沙量。汛期含沙量多于枯水期。
  二、主要河流
  （一）晋江
  晋江流经县城北部，晋江境内长约14千米，流域面积约70平方千米，是山美—金鸡灌区的引水河道。
  晋江源于戴云山脉东坡，上游有东、西溪。东溪源于永春县西部雪山南麓，长约126千米。西溪为正源，源于安溪县西北部戴云山东南麓，长约145千米，流域面积3101平方千米。东、西溪汇合于南安县双溪口，始称晋江，长37千米，干流经金鸡、鲤城、华洲、溜石，在浔浦注入泉州湾。
  晋江年平均流量为163秒立方米，径流系数为68.6%。夏季水量最多，春季多于秋季，冬季最少。年最大洪峰流量出现于7—9月台风季节，1956年最大洪峰流量达9060秒立方米（9月19日）。含沙量汛期多于枯水期，年平均达0.55千克/立方米，是福建省四大河流中含沙量最多的一条。
  晋江水系双溪口以上为上游，河床狭窄，比降较大，河流湍急水力资源丰富；双溪口至金鸡段称中游，河床比降较小，水量变化大，含沙量多；金鸡以下为下游，河道较宽，比降小，水流缓慢，泥沙淤积，河床增高，河漫滩发育，航运受影响。
  （二）九十九溪
  九十九溪全长49.33千米，流域面积350.8平方千米，在晋江境内长20千米，流域面积137平方千米，是晋东平原重要的灌溉河系。
  九十九溪有两源，分别源于南安县大旗尾山和黄山骆驼岭，向东流经内坑、磁灶，在洋宅附近的双溪口汇合称为磁灶溪（梅溪）；再流经池店、陈埭等乡镇，在双沟与金鸡引水河道相接，向北流经溜滨水闸入海。
  九十九溪年径流量为2.01亿立方米，支流有崎溪、前埔溪、塘埔溪、倒桥溪、下灶溪和紫湖溪等。由于九十九溪集雨面积大，汇集支流多，河床浅窄，土质多为轻壤土，汛期排泄不及，往往造成洪涝灾害。九十九溪流域已建新安、东山、紫湖、五道、后望坑、桂山、埔坑、和紫溪等水库。
  九十九溪历史上是晋江、南安水上交通要道。史书记载：“船只往返于梅溪之上”“白石九十九溪水，出清洋坡，历大桥及沿江斗门经此通津埔埭，抵溜石刘礼陂入海……”
  （三）坝头溪
  坝头溪源于安海镇红麒麟山，经大山后、垵内、溪边、坝头、梧塘、菌柄、庄头、桂林等村庄，于井林桥注入安海湾。
  坝头溪全长13千米，流域面积36平方千米，河床土质为轻壤土，年径流量2050万立方米。主要支流有后边、可慕、洋南、后蔡、西畲等。其流域建有玉湖、溪边、大布林水库。
  （四）加塘溪
  加塘溪源于内坑的草头山，向南注入安海湾。全长11.85千米，流域面积26.84平方千米，河床土质为轻壤土，年径流量为1530万立方米。主要有后溪、灰厝、岭内和前埔等溪流，在内坑的土垵、莲山分别建双宅、劳武水库。
  （五）梧垵溪
  梧垵溪源于高州山，经小梧塘、洋尾、西宝、湖格、梧林、前增，注入后洋塘。全长10.11千米，流域面积40.47平方千米，河床土质为沙壤土，年径流量1510万立方米。主要支流有林口、张前、洋柄、英墩、山前、樟井和仕林等溪流。流域内的罗山乡建有英塘、洋柄、和林口水库，石狮镇建有仕林、灵秀山水库。
  （六）阳溪
  阳溪源于灵秀山，经草塘、陈林、福林、钞厝、新刘厝、中山街、衙口注入深沪湾。全长9.7千米，流域面积26.5平方千米，河床土质为沙壤土，年径流量为1510万立方米。主要支流有新西吴、草田、洪溪和吴厝溪等。流域内的永和乡建有山兜、湖内水库，龙湖乡建有吴厝、陈林、洪溪水库。
  （七）梅塘溪
  梅塘溪源于清透溪，经草洪塘、洪塘，于梅塘闸注入围头澳。全长8.2千米，流域面积18.4平方千米，河床土质为沙壤土，年径流量1049万立方米。主要支流有柯村、新周坑等。在东石大白山建有洪塘水库。
  （八）湖漏溪
  湖漏溪源于虺湖，注入深沪湾。全长7.3千米，流域面积26.41平方千米，河床为沙质，年径流量1510万立方米。主要支流有竹围溪。
  （九）外曾溪
  外曾溪源于内坑田边，经亭头、西溪寮、外曾、内曾、曾埭，与西柄注入安海湾。全长7千米，流域面积12.13平方千米，年径流量689万立方米。主要支流为后桥溪。
  （十）其他
  河道长5—6千米的溪河有祥芝的厝上溪（流域面积17.88平方千米，年径流量1020万平方米），永宁的下宅溪（流域面积11.1平方千米，年径流量630万立方米）。
  河道长4—5千米的溪河有石狮、龙湖的长园溪（流域面积16.32平方千米，年径流量925万立方米），安海的侯厝溪（流域面积5.5平方千米，年径流量311万立方米），罗山的缺塘溪（流域面积9.54平方千米，年径流量541万立方米），石狮、永宁的西岑溪（流域面积5.5平方千米，年径流量311万立方米），东石、英林的埭边溪（流域面积8.4平方千米，年径流量476万立方米），青阳的普照溪（流域面积8.84平方千米，年径流量496万立方米），龙湖的东溪（流域面积14.9平方千米，年径流量823万立方米）。
  河道长3—4千米的溪河有永宁的沪厝溪（流域面积6平方千米，年径流量339万立方米），祥芝的雷坑板溪（流域面积4.2平方千米，年径流量239万立方米），蚶江的莲塘溪（流域面积5.94平方千米，年径流量322万立方米），东石的潘径溪（流域面积11.81平方千米，年径流量670万立方米），罗山的梧桐溪（流域面积9.58平方千米，年径流量536万立方米），英林的港塔溪（流域面积7.1平方千米，年径流量403万立方米），金井的金井溪（流域面积9平方千米，年径流量511万立方米）。
  河道长度3千米以下的有祥芝、蚶江的大厦溪（流域面积6平方千米，年径流量339万立方米），金井的钞岱溪（流域面积3.55平方千米，年径流量201万立方米）和格霞溪（流域面积3.03平方千米，年径流量171万立方米）等。
  据史书记载、发掘文物和现今遗迹，县境内溪河诸如坝头溪、加塘溪、外曾溪、钞岱溪、梅塘溪、阳溪等，在唐、宋时大都可航运，现除九十九溪的下游外，大多是不能航运的时令河。
  三、湖泊
  晋江境域的湖泊中，龙湖、虺湖是境内两大淡水湖，也是福建省境著名的淡水湖。龙湖、虺湖在成因类型上都属于泻湖，原先是靠近大陆的浅海，后被泥沙堆积封闭而成。由于海岸的外伸，湖水不断淡化，遂成淡水湖。
  （一）龙湖
  龙湖位于龙湖乡东南，水面面积1.62平方千米，集雨面积9.6平方千米，蓄水量405万立方米，湖底高程一般为13米，岸高16—16.5米，具有灌溉、养殖之利。
  龙湖灌溉面积1030.6公顷，保灌面积491.3公顷，养鱼面积166.6公顷。龙湖湖床宽阔，泥沙柔软，水质甘冽，水产资源丰富，鳗、鲈、鲫等鱼别具风味。龙湖鳖驰名国内外，有“龙湖鳖，镶金边”的美称。
  （二）虺湖
  虺湖位于龙湖、英林、金井三乡（镇）之界，水面面积1.03平方千米，集雨面积36平方千米蓄水量205万立方米，湖底高程一般12米，岸高14—15米。有效灌溉面积636.6公顷，保灌面积457.3公顷。
  （三）前港湖
  前港湖位于龙湖乡东部，水面面积仅0.05平方千米，集雨面积1.38平方千米，蓄水量7.5万立方米，湖底高程8.9米，岸高11米。有效灌溉面积70.3公顷，保灌面积25公顷。
  四、地下水
  晋江地下水资源较贫乏，水质较好。除池店陈埭等乡（镇）滨海地区矿化度大于1克/升的微咸半咸水外，其余都属于矿化度小于1克/升的中性水。按照地表堆积物和地质构造中孔隙与裂隙潜水量可分为：
  （一）富孔隙潜水区
  分布于冲积扇、风积海积和河谷平原。含孔隙潜水，海积层常为双层、多层结构，浅部含淡水，深部含咸水。孔隙涌水量40—100吨/日、米，最大为883吨/日、米，供水性较好，为地下水丰水区。
  （二）中等孔隙潜水区
  分布于河谷平原和一级台地地区。供水性较差，地下水微缺，含中等孔隙潜水，孔隙涌水量20—40吨/日、米。
  （三）弱孔隙潜水区
  分布于一、二级台地。含孔隙裂隙潜水，上部为红色黏土透水性差富水性弱，下部为风化带，裂隙发育，富水性较好。孔隙涌水量上部小于5吨/日、米，下部为5—25吨/日、米，系地下缺水区。
  （四）弱裂隙潜水区
  分布于丘陵、三级台地。浅部风化裂隙较发育，含裂隙潜水深部含水极弱或不含水。孔隙涌水量0—10吨/日、米，系地下水严重缺水区。
  晋江的地下水在池店、陈埭、蚶江至深沪湾一带及滨海平原，水位埋深为0.3—2.2米，属中等丰水区；台地、丘陵地带地下水水位埋深在2—4米，最深达605米，属缺水区。
  五、水资源状况
  据晋江县地表水、地下水资源的调查及估算资料，县境属贫水区，人均水资源多年平均值为537立方米，相当于全省平均数的15%，全国的21.5%。据全国农业水利化区划分级，按人口平均水量与亩水量的指标，均属D级。
  （一）历年平均值
  地表水资源49639万立方米，地下水资源6269万立方米，每平方千米产水量69.1万立方米，其中地表水61.3万立方米。
  （二）丰水年平均值
  地表水资源76444万立方米，地下水资源8338万立方米，每平方千米产水量104.8万立方米，其中地表水94.5万立方米。
  （三）平水年平均值
  地表水资源47157万立方米，地下水资源6143万立方米，每平方千米产水量65.9万立方米，其中地表水58.3万立方米。
  （四）偏枯水年平均值
  地表水资源35244万立方米，地下水资源5140万立方米，每平方千米产水量49.9万立方米，其中地表水43.6万立方米。
  （五）枯水年平均值
  地表水资源26309万立方米，地下水资源4389万立方米，每平方千米产水量327.5万立方米，其中地表水32.5万立方米。
  晋江水资源的开发利用，地表水受降水量的时空分布不均，年际变化大及蓄水工程布局的影响，其利用率仅占地表水资源的16.8%；地下水利用量占可开采量的25.5%。地下水中浅层地下水资源贫乏，在浅层中开挖深井，水量不多，经济效益较差。