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一、干部调配与流动
  1991年8月，在全县范围内交流调整38名副科级以下干部。1992年，组织实施清理机关事业单位计划外用工工作，共清退计划外用工305名。是年，在县医药公司进行企业干部聘用制试点。1995年，配合市委组织部对55名乡（镇）副科级以下干部（职工）进行调整交流。是年，通过考核，择优选配68名土地管理工作人员充实乡（镇）土地管理所。1996年起，在部分市直机关事业单位试行岗位轮换，以增强中层干部队伍的活力。是年，首次在市交通局实行股级干部岗位交流轮换。1998年，市委、市政府结合南安市实际，在乡（镇）机关事业单位推行岗位轮换和交流回避制度，市委编办配合市委组织部调整交流50名乡（镇）干部、职工。是年，在开展“学地税整顿机关作风”活动中，全市有17个单位按严格程序上报“五个一批”（交流一批、进党校学习一批、送人才交流中心一批、辞退一批、重奖重用一批）对象296名。其中回避交流32名，送人才交流中心3名，辞职辞退9名，轮岗交流80名，送党校提高素质培训17名。
  2000年，市直机关5个部门44名科、股长进行轮岗任职。是年，推行人事代理，五大国投公司原事业单位和参照行政人员管理的干部职工以及审计师事务所、会计师事务所、律师事务所干部职工实行人事代理；对国有企业下岗的本科学历以上人员进行一次摸底，通过考试录用到国投公司工作8名；继续组织清退全市机关事业单位计划外用工，共清理清退近200名。2001年，有60多名行政事业单位干部职工在市域内合理流动，其中对15名行政事业单位人员实行交流回避。2002年，就原南安宾馆、中旅社、康龙农场改制，提出人员处理意见并组织实施；在建筑设计院、海都医院等自收自支单位推行人事代理和工资分配改革。
  2002年4月至2005年，做好机构改革期间党政机构改革人员分流工作，全市党政机关共分流（减少）人员210名（不含政法机关57名）。2006—2007年，从超编学校选调59名教职员工到市行政执法局下属事业单位工作。2007年，对任职时间满8年及以上的股级干部进行岗位轮换；联合组织部出台重点项目和产业基地建设工作人员组织管理暂行规定。是年7月，调整交流80名机关事业单位工作人员。2008年，交流12名长期在山区乡（镇）工作的人员到中部或沿海乡镇。
  二、干部任免
  1989年起，县人事部门按人事管理任免的权限、程序办理任免政府机关事业单位科级非领导职务人员及股级干部，确认科员、办事员及职员的任职手续。1989—1993年，共确认科员306名，办事员、职员67名。1994—1998年，共任免33个单位161名科、股长，审批科员、办事员、职员486名。1998年8月，市委、市政府选拔35名市直机关干部任科级非领导职务。
  1999年，对历年来全市行政机关117名聘用干部进行全面考核，经市委、市政府同意，将其中30名符合转录为党群机关工作人员的聘用干部名单上报审批。1999—2000年，确认国家公务员任职定级89名，办理100多名科员、办事员、职员任职手续。2003—2008年，共确认科员277名、办事员46名、职员637名，审核任命股级干部216名。
  三、培训教育
  （一）国家机关工作人员和国家公务员培训教育
  1996年9月，应届毕业的300名非师范类大中专生全部到乡（镇）计生办进行为期一年的岗前培训。1998年，组织军转干部和41名1996年、1997年录用的国家公务员到福建行政学院泉州分院参加初任培训；组织4期共1986名干部参加青年干部计算机培训考试。1999年，组织523名干部参加全国第5次、第6次青年干部计算机一级B类培训考试，考试合格291名。
  2000年，组织230名干部参加全国第七次青年干部计算机一级B类培训。开展中青年干部因特网知识培训，首期培训考试98人。2001年，组织公务员参加有关培训253人次。联合市委组织部举办6期11班的行政机关人员和事业单位职员更新知识培训；对92名经考试录用到事业单位工作的毕业生进行岗前业务培训。2002—2004年，先后组织全市5424名机关工作人员参加行政许可法学习等依法行政知识培训。2005—2006年，先后举办10期公务员法、公务员电子政务培训班，参训2447人次；组织全市2400多名公务员参加省公务员法知识网上考试，并发放福建省公务员培训证书。2007年，举办4期公务员普通话培训与测试培训班，共培训公务员284名。2008年，举办学习《构建社会主义和谐社会》专题培训，参加培训的公务员共2741名。
  （二）专业技术人员培训教育
  1994年起，对专业技术人员继续教育证书进行统一编号，加强证书管理。1997年，共办理专业技术人员继续教育证书9020本，验证8700人次。
  1999—2003年，贯彻《福建省专业技术人员继续教育条例》，采取培训考试、职称资格考前辅导等形式，在事业单位开展专业技术人员的继续教育。1999年，组织教育、水电、农林等系统专业技术人员继续教育共5000多人。2000年，采取到各乡（镇、街道）办班的办法，共举办21期创造力开发培训班，参训18923人；组织职称外语、经济类资格考试的考前辅导工作，参训100多人。2001年，与农业、农机、水电、档案等主管部门联合进行专业技术人员继续教育培训443人；与乡镇企业局、建委联合举办工程系列、会计系列培训班6期，参训591人。2002年，与乡镇企业局联合举办6期非公有制经济组织专业技术人员任职前的培训考试，参训794人；开展事业单位专业技术人员继续教育培训14期，参训3325人。2003年，与农业、林业、水电等主管部门联合开展专业技术人员继续教育457人；与乡镇企业局联合举办非公有制经济组织专业技术人员任职培训班5期，参训498人；组织教育系统专业技术人员参加WT0知识与知识产权知识培训，参训13000多人。
  2004—2008年，举办专业技术人员任职培训班及继续教育公共必修课培训。2004年，组织市直和乡（镇）各单位的专业技术人员参加继续教育公共课现代科技知识培训考试，共计107个单位2069人参训；与乡镇企业局联合举办非公有制经济组织专业技术人员任职培训班5期，参训350多人。2005年，组织教育系统专业技术人员参加现代科技知识培训考试，共计13800多人参训；与农业、林业、水电等主管部门联合开展专业技术人员继续教育专业课培训，430人参训。2006年，组织市直和乡（镇）各单位的专业技术人员继续教育公共课创新能力与职业道德培训考试工作，共计2207人参训；举办非公有制经济组织专业技术人员任职培训班4期，参训180多人。2007年，组织全市教育系统专业技术人员继续教育公共课创新能力与职业道德培训考试工作，共计13061人参训；举办非公有制经济组织专业技术人员任职培训班4期，参训142人；与农业、林业、水电等主管部门联合开展专业技术人员继续教育390多人；邀请知名教授来南安讲学，举办“资本市场与人才战略”“民营企业核心竞争力的构建与培育”等讲座，共500多人参加培训。2008年，组织教育系统专业技术人员参加构建社会主义和谐社会公共必修课培训，参训13446人；组织市直、乡（镇）事业单位和卫生系统专业技术人员进行专业课继续教育培训；举办非公有制经济组织专业技术人员任职前培训4次、参训人员200多人。
  四、考核奖惩
  （一）考核
  1989—1993年，机关、事业单位考核工作以“德、能、勤、绩”四方面衡量，考核结果作为干部、职工奖惩、培训、辞退及调整职务、级别和工资的主要依据。1994年起，干部、职工考核以考核“绩”为主，实行“领导评与群众评、平时考核与年度考核相结合”的办法，考核结果设置“优秀、称职（合格）、基本称职（基本合格）、不称职（不合格）”四个等次。1998年，对历年来全市行政机关117名聘用干部（其中党群机关30名）进行全面考核，其中30名符合条件的转录为党群机关工作人员。
  1999年，严格按照省、市关于做好机关事业单位工作人员年度考核工作文件精神和《国家公务员考核暂行规定》《事业单位工作人员考核暂行规定》进行考核，同时严格按规定控制优秀等次人数。2003年起，把年度考核和绩效考评结合起来进行综合考核。
  （二）奖励表彰
  1993年，全市办理奖励及晋升一级工资奖励21名。1996年起，推行国家公务员制度，对国家公务员奖励分为记一等功、二等功、三等功、嘉奖和授予荣誉称号等5种，对获记一等功、二等功、三等功和嘉奖的公务员，发给奖品或奖金；对授予荣誉称号的国家公务员，给予晋升职务工资档次奖励或给予一次性奖金。1998年，为连续三年度考核优秀的机关工作人员晋升一档级别工资共53名。
  1996—2008年，全市机关事业单位公职人员获市政府各种奖励共900多人次。
  （三）惩戒
  1991—1995年，对机关事业单位公职人员违纪、失职者，依照《国务院关于国家行政机关工作人员的奖惩暂行规定》，视情况给予警告、记过、记大过、降级、降职、撤职、开除留用察看、开除等8种处分。全市机关事业单位公职人员因违纪、失职等受行政处分131人，其中，警告6人、记过12人、记大过10人、降级16人、降职5人、撤职7人、开除留用察看43人、开除32人。
  1991年，处理行政事业单位工作人员违反计划生育政策行为，否定职称评定12人，不予调升工资708人。1992年，对历年违反计划生育政策的行政事业单位工作人员，实行“一票否决”，不予调整奖励工资981人。1993年，对历年违反计划生育政策的行政事业单位工作人员，不予享受岗位工资116人。
  1996年起推行国家公务员制度，行政处分改为“警告、记过、记大过、降级、撤职、开除”6种，受撤职处分的同时降低职务、级别工资，涉嫌刑事犯罪的行政事业单位工作人员，提请司法部门依法惩处。
  1997—2008年，全市行政事业单位工作人员受行政处分3064人，其中警告1214人、记过512人、记大过211人、降级198人、撤职116人、开除501人，长期擅离岗位作自动离职处理312人。2002年，与市纪委、市委组织部联合下发《关于追缴纪律处分处理未到位人员津补贴的通知》，对1997年1月1日以来受各种处分行政处理未到位的34人，收回已发的工资、津补贴40608元。
  1989—2008年，全市87名行政事业单位工作人员被判处有期徒刑缓期执行，按规定执行临时工资。五、人事档案管理
  1998年，政府系统的人事档案划归市人事局管理。1999年8月，市人事局增设人事档案室（股级单位），核定编制3名。人事档案室负责保管机关、企事业单位副科级以下工作人员（教师、党群系统人员和集体工除外）的档案资料。2000年，抽调20多人对属市人事局管理的5000多卷干部档案重新规范整理。2002年7月，经泉州市委组织部干部人事档案工作目标管理达标活动考核小组检查验收，人事局档案室被确认为档案管理二级达标。2006年，完成全市机关、事业单位21484名在职人员和6426名离休、退休、退职人员名册档案建库工作。2008年底，档案库房面积160平方米，纳入管理档案10200多卷。其中在职人员4100多卷，退休人员3800多卷，“文化大革命”时期档案1304卷，其他档案1000多卷，实现专用档案库房、阅档室、办公室三室分开。