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一、领导机构
  中共南安县第六届委员会任期三年：1987年11月至1990年11月；第七届委员会任期三年：1990年11月至1993年12月；第八届委员会任期五年：1993年12月至1998年12月；第九届委员会任期五年：1998年12月至2003年12月；第十届委员会任期三年：2003年12月至2006年7月；第十一届委员会任期五年，从2006年7月始。
  二、工作机构
  1989年1月，县委办公室、县政府办公室设立机要室；3月，县委精神文明建设领导小组办公室（简称文明办）升格为科级单位；12月，县委办机要室改称县委机要局，为副科级单位。至1989年底，中共南安县委工作机构8个：县委办公室、县委组织部、县委宣传部、县委统战部、县委对台工作部、县直机关党委会、县委政法委员会、县委党史工作委员会。属县委部门管理的机构2个：县委文明办（科级单位，由县委宣传部管理）及县委机要局（副科级单位、由县委办公室管理）。属县委管理的事业机构1个：县委党校。
  1990年7月，县委党史工作委改称为县委党史研究室；10月，县老干部局改称为县委老干部局。1991年3月，县农业委员会加称县委农村工作部（简称县委农工部），实行一套人马，两块牌子；4月，县委对台工作部改称为县委台湾工作部（简称县委台工部），对外称县人民政府台湾事务办公室（简称县台办），实行一套人马，两块牌子；5月，成立南安县社会治安综合治理委员会（与县委政法委合署办公），下设办公室（简称县综治办），为正科级单位；11月，县直机关党委会改称为县委县直机关工作委员会（简称县直党工委）。1993年4月，县纪委、县监察局合暑办公。
  至1995年底，中共南安市委所属市直机构：市委办公室（包括市委机要局）、市委组织部、市委宣传部（包括市精神文明建设办公室）、市委统战部、市委对台工作部、市委政法委员会（包括市综治办）、市委市直机关工委、市委老干部局；所属事业机构：市委党史研究室、市委党校。
  1996年，撤销市委农村工作部（市农业委员会），设立市委农村工作领导小组办公室（加挂市政府农业办公室牌子）；市精神文明建设领导小组办公室改称为市精神文明建设办公室（简称市文明办），仍由市委宣传部管理。
  1996年，党政机关机构改革（简称1996年机构改革），市委设6个工作机构：市委办公室（台湾工作办公室与其合署，加挂市政府台湾事务办公室和市委政策研究室牌子）、市委组织部、市委宣传部、市委统一战线工作部（加挂市宗教事务局牌子）、市委政法委员会（社会治安综合治理委员会办公室与其合署）、市委直属机关工作委员会。3个部、办管理机构：市委老干部局由市委组织部管理；市精神文明建设办公室由市委宣传部管理；市委机要局由市委办公室管理。1个议事协调机构：市委农村工作领导小组办公室（加挂市政府农业办公室牌子）。
  1998年，市档案局与档案馆合并，保留档案局牌子，改为市委直属正科级事业单位。同年，成立中共南安市委机构编制委员会办公室（简称市委编办，加挂南安市人民政府机构编制管理办公室牌子），为正科级单位；市保密局并入市委机要局，归市委办公室管理，为副科级单位。
  2002年党政机关机构改革（简称2002年机构改革），市委设8个工作部门：市委办公室（加挂市委政策研究室、市委机要局、市委保密委员会办公室、国家保密局牌子）、市委组织部、市委宣传部、市委统一战线工作部、市委政法委员会（市社会治安综合治理委员会办公室与其合署）、市委台湾工作办公室（加挂市人民政府台湾事务办公室牌子）、市委机构编制委员会办公室（加挂市人民政府机构编制办公室、市事业单位登记管理局牌子）、市委直属机关工作委员会。3个部门管理机构：老干部局由组织部管理，精神文明建设办公室（精神文明建设指导委员会办公室）由宣传部管理，均为正科级；市委信访局（市人民政府信访局）以市委办公室为主管理，为副科级单位。1个议事协调办事机构：市委农村工作领导小组办公室。1个挂靠单位：市委610办。3个事业单位：市委党史研究室、档案局、市委党校。
  2005年，市委信访局升格为正科级机构，仍由市委办公室为主管理。
  至2008年12月，市委工作部门8个：市委办公室、市委组织部、市委宣传部、市委统战部、市委台工部（加挂市政府台湾事务办公室牌子）、市委政法委、市委编委、市委信访局（加挂市政府信访局牌子）。市委部、办管理的单位9个：市委政策研究室、市委机要局、市委保密委员会办公室、市国家保密局由市委办管理；市委文明办由市委宣传部管理；市综治办、市委610办由市委政法委管理；市委老干部局、市委非公企业党工委由市委组织部管理。市委管理事业单位3个：市委党史研究室、档案局、市委党校。
  三、机关党组、党委
  （一）机关党组
  1989年，县人大常委会、县人民政府、县政协、县公安局、县人民检察院、县人民法院已设立党组。1997年6月，市政府办公室、市农办、市教育委员会、市建设委员会、市计划经济贸易委员会、中国人民银行南安市支行设立党组。2002年9月，设立市药品监督管理局党组。
  2006年1月，设立市国土资源局党组、市工商联（商会）党组；6月，设立市技术监督局党组；9月，市药品监督管理局党组改称市食品药品监督管理局党组。2008年2月，设立市总工会党组。
  （二）市直机关党委
  1989年，全县设立人武部、文教、经委、财委、农委、建委、县委机关、县政府机关、政法委机关等9个县直部门党委。
  1996年8月，市直机关党组织设置改为归口管理，市文教党委改设为文教口党委；撤销市经委党委、市财委党委，合并成立市计经贸口党委；市农委党委改设为市农口党委；市建委党委改设为市建委口党委；市委机关党委改设为市委党群口党委；市政府机关党委改设为市政府综合口党委；市委政法机关党委改设为市委政法口党委。
  1999年6月，成立市农业产业化投资经营有限责任公司党委、市水利电力投资经营有限责任公司党委、市工矿投资经营有限责任公司党委、市商贸投资经营有限责任公司党委、市交通运输投资经营有限责任公司党委等5个国投公司党委。
  2002年6月，市直机关党组织设置全面调整，原来机关7个“口”党委重新划分为10个“系统”党委：市委党群口党委改称为市直机关党群系统党委；市政府综合口党委改称为市政府综合系统党委；市委政法口党委改称为市委政法系统党委；市农口党委改称为市农林水系统党委；市文教口党委改称为市文教系统党委；撤销市计经贸委口党委，设立市计划系统党委、市经贸系统党委；撤销市建委口党委，设立市规划建设系统党委；设立市统战系统党委、市财税系统党委。
  2005年11月，撤销商贸、工矿、农业、公共事业等4个国投公司党委，合并成立南安市贸工农国投公司党委。2006年3月，市文教系统党委改称为市宣传系统党委。
  至2008年，全市有党群系统、政府综合系统、统战系统、宣传系统、政法系统、计划系统、财税系统、经贸系统、农办系统、规划建设系统等10个系统党委，电力有限责任公司、公安局、贸工农国投公司3个市直党委。
  四、乡镇（街道、开发区）党委（党工委）
  1989年，全县有溪美、美林、东田、仑苍、英都、翔云、眉山、金淘、蓬华、诗山、码头、九都、罗东、梅山、向阳、洪梅、洪濑、康美、丰州、官桥、水头、石井等22个乡（镇）党委。
  1999年1月，因行政区域调整，撤销原溪美镇党委，设立溪美街道党委和柳城街道党委；撤销原美林镇党委，设立美林街道党委和省新镇党委；7月，撤销原丰州镇党委，设立丰州镇党委和霞美镇党委；撤销原罗东镇党委，设立罗东镇党委和乐峰镇党委。
  2003年4月，撤销原溪美街道党委、柳城街道党委、美林街道党委，设立溪美街道党工委、柳城街道党工委、美林街道党工委，作为市委派出机构。
  2005年9月，撤销雪峰华侨经济开发区党支部，设立雪峰华侨经济开发区党工委，作为市委派出机构。
  至2008年年底，全市有23个乡（镇）党委，3个街道党工委及雪峰华侨经济开发区党工委。