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第一节 行政机构
  一、卫生局
  新中国成立后，1952年6月县人民政府设立卫生科，1956年6月改为卫生局，逐步建立与完善县卫生行政管理制度。1963年7月，卫生局改称卫生科，1966年7月与县卫生防疫保健站合署办公。“文化大革命”期间，机构名称屡有变动。1968年10月，县革命委员会生产指挥部下设民政卫生组。1969年2月，生产指挥部撤销，民政卫生组隶属县革命委员会，同年11月重新成立生产指挥部，民政卫生组仍属生产指挥部。1971年3月撤销民政卫生组，成立民卫股，5月改为民卫科。1973年9月，民卫科撤销，成立县革命委员会卫生局。1981年改称晋江县卫生局。
  1985年县卫生局设置人事秘书股和医政防疫股，1988年增设药政股。
  二、防疫委员会、爱国卫生运动委员会
  民国26年（1937）4月，因鼠疫流行，成立县扩大防疫委员会，由县卫生院院长等10人组成，下设总务、警卫、调查、募捐、消毒、宣传、处罚等七股，择定崇福寺暂设隔离病院。民国34年聘请公私立医院院长、商会理事长等为本会委员。民国36年5月，重新组织县防疫委员会，由福建省第四行政区督察专员和县长任正、副主任委员。委员会设技术组、环境卫生组、总务组，具体工作由鼠疫防治处、警察局、卫生院负责。
  1950年4月，晋江县人民政府成立防疫委员会，由晋江军分区、省立泉州医院、省防疫大队第二分队、县卫生院、惠世医院、永惠医院等单位负责人任委员，设正副主任委员、秘书处以及总务、组织、技术、交通管制、宣传等5组。各区、镇成立17个分会，乡设防疫支会，村设卫生小组。1951年县市分治后，由县长任主任委员。1952年，各区、镇防疫分会发展到20个，乡防疫支会219个，村卫生小组1039个。1953年2月，县防疫委员会改称县爱国卫生运动委员会。1954年，委员会在县卫生科设立办公室处理日常工作。此后随工作重点的转移，名称也屡作改动。1956年称消灭“四害”（蚊子、苍蝇、老鼠、麻雀，后麻雀改为臭虫）委员会，1960年称中共晋江县委除害灭病领导小组，1969年改称爱国卫生运动领导小组，1970年复称除害灭病领导小组，1978年复称爱国卫生运动委员会。各届委员会均以中共晋江县委、县人民政府的主要领导人为主任委员，县委及政府各有关部、办、委、局、工会、青年团、妇联、防疫站的负责人为委员。县爱国卫生运动委员会下设办公室负责日常工作。
  第二节 防疫保健机构
  一、戒烟所
  民国23年（1934）成立县戒烟所，所址设在泉州东街孔庙（现泉州市第一医院），负责戒烟事宜，并设病床收容烟民。县戒烟所隶属县政府戒烟科。民国27年2月，戒烟所改为戒烟戒毒组，隶属县卫生院。民国28年恢复戒烟所，隶属县卫生事务所。民国29年12月在青阳、石狮设立戒烟分所。民国30年10月，改称晋江县烟民戒烟调验所，隶属县卫生院。
  二、防疫所
  民国26年闽南发生鼠疫。5月省政府建立闽南防疫所，所址在新门街（现中共泉州市委宿舍），内设检验科、鼠防科和捕鼠工程队。同年7月，省政府又设立福建全省防疫总所，指导全省的防疫工作，所址设在新门街南华小学，聘德国人兰度雅为顾问。民国28年4月，更名福建防疫处。为躲避日机空袭，年底内迁永安县。闽南防疫所亦内迁永春县，于民国30年撤销。
  三、福建省防疫大队第二分队
  民国35年12月，由国民政府卫生署东南鼠疫防治处统一指导全省的鼠疫防治工作，并设立临时办事处。民国36年4月，东南鼠疫防治处建立第一检疫站，同时卫生署把医疗防疫总队第16巡回医疗队派驻晋江。3个机构在泉州公园（现市体育场）合署办公。民国38年8月以后相继撤销，而人员仍留在旧址。1949年8月31日泉州解放，军管会派员接管上述机构。1950年1月，改组为福建省防疫大队第二分队，下设医务组、防疫组、总务组、化验室、调剂室、警讯班、技工班。1951年3月，改称华东区福建鼠疫防治所惠安防治站，4月迁往惠安县。
  四、卫生防疫站
  1956年6月，县卫生院防疫股划归县卫生局，1957年5月扩充成立卫生防疫站，租用青阳镇新街58号民房3间为站址。1958年11月与县妇幼保健站合并，改称晋江县卫生防疫保健站。1969年3月与县医院合并，称晋江县人民卫生防治院，1972年5月，原卫生防疫保健站人员归队，重新组成晋江县卫生防疫站。1988年设行政、卫生、防疫、防痨、宣教、检验等6个股。配备有酶标检测仪、万分之一分析天平、高压蒸气消毒器、电蒸馏器、微量震荡器、手提高压锅、微量进样器、荧光比色计、离子酸度计、氟电极、高温电炉、原子吸收分光光度计、红外线干燥箱、大气采样器、721型分光光度计、751紫外线分光光度计、粉尘采样机、康氏震荡器、组织捣碎机、照度计、磁力搅拌机、恒温箱、通风湿度计、脉冲声级器、CO2测定仪、CO测定仪、高速离心机、真空干燥箱、余氯测定仪、体检器材等医疗设备。
  五、妇幼保健所
  1953年9月，成立县妇幼保健站，站址设在县卫生科。1954年初，迁到青阳镇下行张村新建站址。1958年11月与晋江县卫生防疫站合并称县卫生防疫保健站，下设有妇幼股。1969年3月并入县人民卫生防治院，1972年5月重建卫生防疫站后，恢复妇幼股。1984年12月，成立妇幼保健所，暂寄卫生防疫站内，1988年7月迁入原县医院旧址。保健所下设妇保、儿保、医技、行政4个组，门诊部设立妇保、儿保、咨询、检验、婚检等科室。
  第三节 医疗机构
  一、惠世医院
  清光绪六年（1880），英国基督教长老会派颜大辟来泉州，在南街新花山（今中山中路礼拜堂）设立施医布道处。翌年在连理巷创办惠世医院。光绪二十七年，长老会又在裴巷另设惠世女医院。民国22年（1933）两院合并，仍称惠世医院。1950年中华基督教会闽南分会接管该院。
  惠世医院的历届院长大多由教会指定英国人担任，经费大部分来自门诊收入，少量来自长老会年捐和国际救济。医院的附属单位有：惠世高级护士职业学校、隔离病院、永春医院和惠安仁世医院。
  1952年人民政府接管该院，改称晋江专区第二医院。“文化大革命”中改称反帝医院。1983年起称福建医学院附属第二医院。
  二、永惠妇孺医院
  民国5年底，何大年、苏德安夫妇在永春创办永惠妇孺医院。民国7年，迁至晋江县城内打锡巷口。医院虽各科略备，而侧重于发展产科。至30年代，设住院部，有产床80张。抗日战争中曾一度停办。民国34年抗战胜利后重新开办，设立董事会，并接受社会各界、华侨和联合国救济总署的捐助。1955年经人民政府批准，改为民办公助。1958年8月，并入泉州市人民医院。
  三、公立中医院
  民国8年，中医界自发组织的医学研究会在玉犀巷创办公立中医院。患者就诊只收挂号费，出诊只收车费，诊金药费概不收。医院经费初期由董事会向地方各界筹募，并由县政府从屠宰税项中拨充一部分。民国19年，向南洋华侨募捐银元1.45万元为基金，开设普济人力车公司，以收入充作医院经费。民国25年因经费不继而一度停业。翌年复业，址迁承天巷内。民国28年停办。
  四、平民医院
  民国21年夏，十九路军六十一师毛维寿部进驻泉州，在镇抚司（现泉州六中）创办平民医院，组织医院董事会。同时在安海大草埔陈厝祠堂和石狮新华路分别设立民众医院。民国26年，董事会奉令停办平民医院。民国31年，晋江县卫生事务所派员接收平民医院财产。
  五、县医院
  民国25年5月，省政府医疗巡回队第四队第一分队在晋江县成立。民国26年1月，奉命改组为晋江县卫生院，隶属县政府。院址设在泮宫明伦堂，后移庄府巷，民国27年初又迁至钟楼下东街南侧（现工商银行开元办事处），3月再迁至新门街南华小学。7月奉令改为县卫生事务所。所内设总务、医政防疫、环境卫生、妇婴卫生、卫生教育等5组。并负责办理华侨出国签发预防接种证书及国境检疫、壮丁体格检查。事务所还在东石、青阳设卫生所。民国28年，奉令创办县立医院，人员由事务所职员兼任。附属机构有设在涂门街的诊疗所和设在东街的戒烟所。民国31年，事务所复称县卫生院，在法石、张林、内坑增设卫生所，并在龙头山许氏家庙设隔离房，收容鼠疫、流脑、霍乱患者。民国33年县卫生院迁至花巷天主教堂，民国35年再迁南俊巷王氏祠堂（现泉州市广播站）。民国36年，县政府指拨新府口玄妙观为卫生院永久院址。
  1949年9月，军管会派员接管卫生院，改称晋江县人民政府卫生院，仅有人员22人，全部留用。1951年4月，卫生院随县政府迁至青阳，先后借用下行张村和田洋村的民房暂作院址。1952年10月，由省卫生厅拨款在下行张村征地建造门诊部及病房600多平方米。翌年5月，院舍落成，交付使用并开始收容病人。1954—1956年间，又先后建造院舍550多平方米，增设麻风门诊部和放射科。1956年9月，卫生院改称晋江县医院，有医职人员61人，病床50张，分内儿科、外科、妇产科、放射科、检验科、中医科、针灸室等。1958年又增设牙科。1961年，省卫生厅又拨款新建1座5000平方米的医院大楼。1966年8月，县医院成立革命委员会。同年11月，组织医疗队到马甲保健院建立后方医院。1969年3月，改称县人民卫生防治院。1972年5月，复称县医院。1979年旅居东南亚华侨蔡女士捐资72万元，建门诊大楼“爱国楼”五层3500多平方米；省、县拨款建综合楼和病房大楼6000多平方米。1988年3月，“爱国楼”落成，全国人大常务委员会副委员长叶飞为“晋江县医院”和“爱国楼”题字。
  1984年医院临床科室有内科、外科、儿科、妇产科、中医科、五官科、口腔科、骨科、家庭病床、急诊室、手术室；医技科室有检验、放射、药剂、供应、脑电图、心超；1988年新设B超、超声心动图、X光脑拍片、副鼻窦拍片。行政科室有办公室、医务、院务、财务、保健等。
  县医院的医疗设备比较完善、精良、高级，除常用设备外，还拥有纤维胃镜、IBM微电脑、SD6—32型超声波诊断仪、脑电图机、超声心动图机等。
  六、区卫生所
  民国26年县卫生院成立后，先后在河市、石狮、安海设立卫生分院，在东石、青阳、法石、内坑、碧山、大同先后设立卫生所，均属县卫生院的派出机构。民国36年2月，统称卫生所。新中国成立后，又先后设立罗溪、英林、马甲、前埔、新店卫生所。1952年改称区卫生所。所址大多利用当地宗祠或借用民房，人员一般1—4人。1958年9月，卫生所撤销，人员安排到各卫生医疗单位。
  七、省立晋江医院
  民国36年2月，省立龙岩医院迁至泉州，院址设在花巷天主堂，改称省立晋江医院，民国38年2月，改称省立泉州医院。同年8月31日，泉州解放，由军管会派员接管。1950年7月，改称泉州中心卫生院，1951年改称晋江中心卫生院。县市分治后名称屡有变动，现称泉州市第一医院。
  八、联合诊所 1951年8月，个体医务人员自愿组合在梅港成立晋江县第一个联合诊所。至1958年4月，全县各区共组织57个联合诊所。1958年9月，撤销联合诊所，人员统一安排分配到各乡人民医院。
  九、乡镇卫生院
  1958年9月，各乡成立人民医院。1959年11月，改称乡保健院。村一级设保健站（室）。实现乡乡有医院，村村有保健站。全县乡保健院、分院28所，保健站（室）162个。1962年改称公社保健院，并实行院站分开核算，自负盈亏的制度。1972年5月，改称公社卫生院；1985年1月，改称乡（镇）卫生院。1988年，各乡镇卫生院均拥有X光诊断机、高压消毒设备、心电图机、超声波机。多数卫生院有综合手术台、无影灯、甲乙丙3种手术包、骨科手术箱、电冰箱、721分光光度计、恒温箱、干燥箱、培养箱、分析天平、水浴箱、腹部手术刀包、检眼镜箱、牙科综合治疗椅或油泵牙科椅、特定电磁治疗器、微波针灸仪，经络磁疗仪、洗胃机、电动按摩机、电动吸引机等医疗设备。
  十、安海医院
  1954年5月，归侨倪端仪倡议并发动港、澳同胞和菲律宾、新加坡华侨集资，在安海寨埔创建安海医院。1957年6月落成开诊，设有住院病床50张。建院初期属侨办公助集体所有制单位。1986年改为全民所有制，按县级卫生事业单位进行管理。1988年与福建医学院附属二院协作，设立联合医疗中心。医务人员187人，有住院病床203张。
  十一、子英医院
  1954年，永宁乡的个体开业医生组合成立洋沙联合诊所。1958年改称石狮医院永宁分院子英保健室。1959年11月，乡侨委发动华侨捐资8万元，于1962年2月创办子英医院。1969年改称永宁公社保健院，1974年1月称永宁公社中心卫生院。8月，复称子英医院，仍负责公社中心卫生院的工作。1988年全院有医务人员46人，设病床72张。
  十二、石狮医院
  1956年10月，石狮联合诊所、联合妇幼保健站、中医联合诊所等单位合并组建石狮联合医院。院址在石狮镇民生路。1958年9月，石狮中医第二、三、四联合诊所、牙科联合诊所并入，改称石狮医院。下设永宁、龟湖分院和龙星、新星、促进、海鹰、龙塘等保健站。1961年，永宁、龟湖分院分别划归永宁、石狮公社管理。1974年，改称石狮中心卫生院。1984年5月，院址迁到新大街。1988年全院人员170人，设病床160张。
  十三、皮肤病防治院
  1955年县卫生院开设麻风门诊部，对传染性大的病人，集中送外地住院治疗。1958年9月，县成立麻风病防治站；11月在河市的昔仔前、笏石村建立麻风病康复村，首批收容麻风患者92人。村行政领导属河市乡跃进农业社朝阳生产队。1959年县组织“三病”（麻风、性病、头癣）普查工作队，普查面近47万人，查出“三病”患者5076人，收容麻风病患者149人进康复村。1960年康复村设有工业、农业、畜牧、多种经济4股，总管村内的生产、生活各项工作。1961年康复村迁至双阳新尾村东面新村址。1973年4月，县麻风病防治站改称县皮肤病防治院。从1959—1976年，在全县范围内共进行3次麻风病普查，发现患者1779人，临床治愈1330人。1979年7月，县皮肤病防治院与泉州市皮肤病防治院合并，改称晋江地区皮肤病防治院，继续负责晋江县的麻风病防治、收容任务。
  十四、精神病防治院
  1959年3月，创办县精神病医院，院址设在双阳的青阳室（陈三书轩）。同年与县教养院互换院址，迁至陈埭湖中村新湖张氏祠堂，改为精神病疗养院。1971年12月，改称精神病防治院。
  十五、县中医院
  1984年12月，成立县中医院门诊部，1986年10月，改称县中医院，院址设在青阳新大街南路33号。1988年3月和省中医学院骨伤科合作开设骨伤科诊疗中心，4月，开设病床40张。临床科设有内科、外科、妇科、儿科、痔疮科、骨伤科等；医技科室有检验科、放射科、心电图室、超声波室、骨质增生治疗室、手术室、气功推拿按摩室等。
  十六、驻军医院
  1964年，中国人民解放军在沟头山设立第135野战医院，主要面向军内伤病人员。初期只有门诊部向群众开放，后期住院部也接受军外患者。1969年该院奉调外地。
  十七、各系统、单位医疗室
  工业系统：1960年磁灶陶瓷厂、安海通用厂、石狮农械厂、金井铁厂等单位设立医疗室。此后逐年都有一些工厂设立医疗室。1988年，全县设立医疗室的工厂有：粉末冶金制品厂、柴油机厂、水泵厂、糖厂、晋江盐场、陶瓷厂、粉末冶炼厂、拖拉机修配厂、加排盐场、酒厂、纺织厂等。医务人员总计20人。
  教育系统：1956年晋江一中、养正中学、石光中学、毓英中学、南侨中学等均设有医疗室。至1988年，设立医疗室的学校有：晋江一中、养正中学、晋江三中、东石中学、职业中学、南侨中学、石光中学、华侨中学、实验小学等。医务人员总计12人。
  农业系统：西滨农场和县良种场分别于1958年和1962年设立医疗室，共有医务人员3人。
  1986年县直机关设立医疗室，配备医务人员2人。
  十八、私人开业诊所
  据民国25年资料记载，全县共有私人诊所163家，医务人员234人。新中国成立以后，私人诊所继续存在，1958年公社化运动中，私人诊所收归公社医院。80年代开始又允许私人开业，一些农村合作医疗站解体后演变为私人开业诊所。1988年，全县共有私人诊所392家，医务人员392人。
  第四节 医药企业
  一、药材公司
  1955年10月，县供销社在石狮马脚桥设立药材经理部石狮批发部，12月在安海设药材经理部安海营业处。1956年4月，成立中国药材公司晋江县公司，1957年在青阳设立批发部。同年8月，县药材公司并入县医药公司。
  二、医药公司
  1956年4月，由药材经理部和石狮、安海中百公司药品批发部合并成立中国医药公司晋江县公司，简称县医称公司，地址设在石狮镇民生路，隶属商业局领导，1957年改属县卫生局领导。1959年7月，公司迁入青阳镇。1964年回归商业局领导。1968年10月，改称县医药服务部。1972年复称县医药公司。1988年迁入青阳新大街医药综合大楼，设人秘、财会、业务、保卫、药政5股及新特药批发部。公司在青阳、安海、石狮、金井等地设有批发部和门市部。
  第五节 医教科研机构
  一、惠世高级护士学校
  民国23年，英国基督教长老会派惠世医院护士贾丽德创办惠世高级护士学校。初建时附设于惠世医院，后移西街裴巷，又迁北街连理巷与惠世医院毗连。经费主要来自医院拨款、英国基督教长老会和华侨捐募，中国国际救济会亦有拨补。学校面向社会招生，学制3年零3个月，学生免交学杂费和膳宿费，并发给少量零用钱。课程设普通文化课、专业基础课和临床护理技术课。学校自创办到1949年，共毕业98人。1950年学制改为2年。暑期中校址迁至小城隍医院职工宿舍区，同时与医院脱钩，行政和经济上均独立隶属晋江专区专员公署文教科。1952年并入晋江医士学校，改为晋江卫生学校。
  二、晋江县卫生进修学校
  1958年3月，创办县卫生学校。同年新建部分校舍并借用县卫生工作者协会的房屋。学制分三年制医士班和二年制护士班，采用中等卫生学校统一教材。生源一部分来自县招生委员会统一录取的应届初中毕业考生，另一部分来自各乡选送的优秀青年和各中学推荐的初中学生；1960年曾招收过一批小学毕业程度的学生。1961年学校改为训练班，不再招生，1963年最后一班护士班毕业，即撤销。
  1979年11月，复办晋江县卫生学校，对卫生系统历年来补员招工的人员进行业务培训。校址借用青阳梅山后塘村民房。由县医院和防疫站的医生兼课。进修期限从1个月至3年不等。1980年5月，改称县卫生进修学校。1983年迁入新大街南路新建校舍。1988年编制增至10人。
  三、晋江寿良中医职业学校
  1988年9月，华侨林先生捐资27万元，开办晋江寿良中医职业学校，校址设在池店乡华洲村。同年招收农村中医士专业1个班。学生自费入学，毕业后国家承认其中专学历，由各基层单位择优聘用或自行开业。
  四、晋江县医学科学研究所
  1959年8月，由县卫生局牵头，成立中医研究所和中医学术研究委员会，在县医院、安海医院、石狮医院成立研究中心组，各乡人民医院成立研究小组。1960年10月，县中医研究所改称县医学科学研究所，1963年撤销。1972年2月，县医学科学研究所重新成立，1982年6月再度撤销。