1907年秋天,峄县知县谢曦与王宝田勾结,想提高地税,借机牟利,还召集社会名流及士绅商议,以掩人耳目。在会上,张文源认为银价提得过高,加重了百姓的负担,并指责知县敛财,而不顾百姓利益。知县恼羞成怒,将张文源扣押,试图将其秀才功名革除 后加以治罪。但峄县教谕,认为张文源并无罪过,拒绝了知县的要求。谢曦又三次向省里报告,要求革除张文源的秀才功 名,皆遭到拒绝。后来他悬赏10两白银,以求加害张文源的 “罪过”,也未达到目的。最后还是王宝田出面,利用自己的关系,贿赂省城官员,革除了张文源的秀才功名,将其逮捕入狱。后押解到济南,投入历城监狱。
这本是一个冤案。省里的官员不知道张文源所犯何罪,所以将其关押在监狱里,三年多时间,从未审讯过。在狱中,张文源认识了同盟会员杜紫亭,并由其介绍,加入了同盟会。张文源也逐渐地从一个自发反抗封建压迫的斗士,成长为自觉革命 的民主战士。