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解放初期，卫生工作由县人民政府民政科负责。1952年7月8日，设立县人民政府卫生科。1956年6月卫生科改称卫生局。1967年3月县临时领导小组下设文卫办公室，管理卫生工作。1968年5月由县革命委员会抓革命促生产指挥组管理。1969年11月由县革命委员会政治部卫生组管理。1972年3月恢复卫生局。1981年4月局内设人事秘书、财会、医政、药政4个股。1985年9月增设审计服。全局有行政人员6人，卫生技术人员10人。
  第二节爱国卫生运动委员会 1953年4月由县防疫委员会改称南康县爱国卫生运动委员会。简称“爱卫会”，由副县长、卫生科长、公安局长分别担任主任委员和副主任委员。1980年7月，设立县爱卫会办公室。
  第三节防疫站 1952年3月，成立县防疫委员会，下设办公室、医疗研究检查组、紧急情报组、环境卫生组，后增设卫生宣传组。各区、镇相应建立防疫站，乡设立防疫小组，村有防疫员，全县共有10个防疫站，108个乡防疫小组，841个防疫员。1953年4月全县卫生防疫工作改由县卫生院防疫股负责。1958年9月，以防疫股为基础建立南康县卫生防疫站。1962年7月与县妇幼保健站合并，称县防疫保健站。1968年10月与县人民医院合并称县人民防治院。1970年8月，恢复县防疫保健站。1973年7月与县妇幼保健站分开，称县卫生防疫站。1985年内设宣传、检验、防疫、洁防、卫生、行政管理科。有工作人员35人，其中医师6人、医士16人、检验师1人、检验士3人、护士1人。
  第四节妇幼保健站 1954年10月在唐江镇设县妇幼保健站，负责指导全县妇幼卫生工作，有1名站长（助产士）和1名妇女保健员。1955年迁县城，驻县卫生院内。1961年3月与县人民医院合署办公。1962年7月与县防疫站合并，称县防疫保健站。1968年10月并入县人民防治院。1970年8月从县人民防治院分出，复称县防疫保健站。1973年7月从县防疫保健站分出，复称妇幼保健站，与县计育办合署办公。1976年4月从县计育办分出办公，1985年内设办公室、儿保组、妇保组、门诊部。有工作人员9人，其中医师3人、助产士3人。第五节药品检验所 1978年8月开始筹建南康县药品检验所。1979年2月正式成立，所址在县防疫站院内。有医师1人，药师1人，药士1人。1982年建成420平方米新实验室，有医疗器械维修人员3人。医师1人，药师3人，药士1人。设中药室、化学室、生物检测室、动物室和行政办公室、医疗器械维修组。1985年仍有5室1组，有职工15人，其中有医师1人、药师2人、药士3人、器械维修人员4人。
  第六节医药公司 1955年初，抽调2名药技人员，在县供销社唐江购销组组建中药材经营小组，开展中药材购销业务。1956年上半年划归商业科领导。1956年6月在中药材经营小组的基础上，成立中国药材公司江西南康县公司（地址：今唐江镇盐街上）。同年8月迁县城。唐江为县医药公司批发部。1957年，划归县卫生局领导。1958年4月，改称县药材批发部。同年10月组建南康县中西医药公司，归属县卫生局和赣南行政区中西医药公司双重领导。
  1964年3月，复称中国药材公司江西省南康县公司，归县商业局管理。1969年9月，改称县商业管理处药材组。1972年称南康县药材公司。同年坪市、横市、凤岗、潭口、龙回设立药材门市部。12月称江西省医药公司南康县公司。
  1980年元月，县医药公司隶属省医药公司，实行人、财、物统一管理。
  1985年公司设有人秘、业务、生产、财会、会统、审计、物价7个股。