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水、旱灾害为石城县主要自然灾害，每年均有不同程度的发生。水灾多发于春末夏初，旱灾则秋旱甚于伏旱，洪涝发生少于干旱，且多在局部地区发生。
  自1959至1985年，共出现伏旱10次，秋旱16次，伏旱连秋旱2次。其中严重干旱4次，中度干旱12次，轻度干旱5次。最长为1962年的83天，最短为1977年的20天。
  以降水量和距平均百分率划分洪涝，1959至1985年，二十余年有大水年7次，特大水年4次。其中1962、1968、1983、1984年为特大水年，受害范围最广，损失最大。
  历史灾情记录： 明正德十一年（1516）四月二十六至二十九日连雨大水。
  嘉靖三十六年（1557）大水。
  清顺治七年（1650），洪水决城。翌年五月初三复大水。
  康熙十年（1671），夏间大水，北门城内水深四五尺。
  康熙五十二年（1713）五月十二日大水，“邑河横流汹涌，去垛口止一尺，侵入城中，冲坏庐舍墙垣，漂没四乡田亩，数十丈合围大木皆拔起，人畜溺死颇多”。翌年，大水如前。
  康熙六十年（1721）大旱。
  雍正五年（1727）夏大水，冲决北关外，翌年大旱。
  乾隆七年（1742）春夏间，五十日不雨。
  乾隆十六年大水。
  乾隆二十九年大水。 乾隆三十九年大水。
  嘉庆五年（1800）七月十四，连雨三日，大水。
  咸丰三年（1853）大水，至今尚流传：“咸丰三年遭水灾，大水冲走郭头街”之说。
  民国十六年（1927）春旱。
  民国十九年大水，城内街巷可通舟楫。
  民国二十年大旱。
  民国二十九年大水，城内街巷可通舟楫。
  民国三十八年五月二日，暴雨。屏山淋死1人，次日山洪暴发，境内多处地方发生山崩。
  1951年7月，旱。全县受灾面积达8万余亩。
  1959年6月18日，大水，城内低处水深1.5米。全县损失折款285万余元，同年伏、秋又旱48天。
  1962年6月24至30日，降雨量达640.6毫米。其中26至28日，3天降水242.2毫米。全县淹没农田万余亩，早稻减产131万斤。同年秋旱83天。
  1963年，春旱两月余，受灾面积8万余亩，又秋旱44天。
  1966年，秋旱60天。
  1968年大水，又秋旱54天。
  1970年7月7日，大水。长溪渡口翻船，淹死9人，又秋旱45天。
  1974年，伏旱、秋旱计61天。
  1975年6月10日，大水。横江两岸淹没稻田2625亩，冲倒房屋91间，死亡1人，街上水深1至1.6米。珠坑左坑水库被冲垮。
  1978年，大旱65天。
  1983年5月30至31日，琴江上游持续8小时暴雨，降水量154.41毫米，琴江河水猛涨。县城内平均水深1.5米，最深处达2米。沿江两岸，一片汪洋，属近百年来之特大洪水，损失折款199.58万元。
  1984年5月31日至6月1日连降暴雨，降水量达260毫米。琴江河水暴涨，城内水位最深处达1.56米。全县各地普遍受灾，损失折款1496万元。
  二、风雹黑雨民国十三年（1924），大由落西风冰雹。
  民国三十五年，高田乡上坪、遥岭及岩岭等地大风，晚稻颗粒无收。
  1959年，高田落冰雹，大者一颗五六斤重。
  1973年4月1日，县内有9个公社受强风暴雨袭击，受灾户达2829户，冲坏水库、水陂11座。
  1979年3月15日晚，岩岭公社礼地、上柏、堂下、筀竹等处下黑雨约2小时，水黑如墨。
  1979年6月20日，小松受暴风雨袭击，毁坏水稻2975亩，水陂、木桥、民房、公路均有破坏，损失折款5万余元。1983年5月2日傍晚，木兰、大由、岩岭、小松等公社10个大队、54个生产队遭台风、冰雹、暴雨袭击，受灾户305户，损失折款6万余元。14日傍晚，又刮十一级大风，并夹杂雹霰，自西向东，经小别、琴江镇、观下、丰山等部分地区，波及15个大队，148个生产队，历时30分钟，损失折款128万余元。
  三、病虫害森林病虫害森林病虫，以竹蝗、松毛虫为主，多发生于山地林区，比较严重的有： 民国二十九年（1940），洋地河脚下、社公湾、禾仓下发生竹蝗，受害面积数万亩，致使21个纸槽关闭。
  1959年，洋地横足前、上洞等地7500亩竹林遭蝗灾。
  1980年，观下、屏山、大由、龙岗等地，松毛虫为害严重。
  农业病虫害解放后较严重的病虫害有： 1973年，早、晚稻受害面积9.59万亩，损失607.35万斤。
  1981年，受害面积7.01万亩，损失709.35万斤。
  1984年，受害面积46.38万亩，损失817.74万斤。
  1985年，受害面积63.78万亩，损失1521.92万斤。
  （详见《经济·农牧渔业·植保》） 畜禽病虫害、鱼病虫害（详见《经济·农牧渔业》） 四、兽害鼠害明隆庆五年（1571）虎盛行。
  清顺治八年（1651）虎盛行。
  民国十二年（1923）虎盛行，木兰2人被虎噬。
  民国二十九年（1940），岩岭老虎伤人。
  民国三十一年（1942），丰山福村老虎伤人。
  民国三十二年（1943），岩岭老虎伤人。
  民国三十六年（1947），丰山福村野猪伤人。
  1956年，山区兽害猖獗。
  近10余年来，因用药毒鼠，猫、蛇、鹰等亦被毒害，生态失去平衡，鼠害猖獗，1984年尤甚。 五、地震地水滑坡东晋义熙八年（412）正月，发生地震。
  明弘治十年（1497）六月，发生地震。
  民国十五年（1926）二月十三日，发生地震。自农历正月初一日起，时震时停，日必数次，历时20余天。震级为4.75级，烈度6级。
  民国三十年（1941），寻乌东北发生地震，波及石城，屋瓦墙泥坠落。
  1956年，小姑、洋地发生滑坡。
  1964年，岩岭公社上柏、留天斜发地水，上柏坪里水深二三尺，留天斜有埘中鸡群、灶上锅头被水冲走。
  1975年，发地震一次，震弱，未成灾。
  六、雷电灾害雷电灾害，石城常有发生，此仅志解放后较大事件： 1956年夏，小松上街一群耘禾群众，被雷电击跪于地，其中1人被抛出数坵之远。
  1967年夏，横江1人被雷电击死。
  1970年夏，观下湖下1人被雷电击死。
  1975年夏，高田、屏山各1人被雷电击死。
  1981年春、夏，高田3人被雷电击死。
  1983年5月10日晚，石田瑶陂上一妇女被雷电击死于床上，睡内侧的小孩安然无恙，睡另一头的丈夫被雷电击伤双脚，隔壁儿媳亦被击伤。
  1983年5月14日，雷电烧毁宜福村兔子窝山林1100余亩。
  1984年夏，高田1人被雷电击死。
  1984年8月24日，西外村西华山茶亭边被雷电击死3人。