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清末，本县设县署，为全县最高行政机构，设知县1人，为县最高行政长官，既管行政，又管司法。因主居正堂，又称正衙。正堂内设师爷4人，分管工、刑、兵、吏、户等房事务。
  知县下属职官有：
  县丞1人，主居左堂（又称二衙）。左堂内设师爷2人，分管粮架房和钱粮两楹。
  典史1人，主居右堂，又称四衙。是主管捕、关犯人的机构设有捕署和监牢。监牢又分男班房（即民班）、壮丁班（押解重犯）和女班房。
  教谕1人，洲导1人，主居儒学正堂（又称三衙），主管全县考试和书院督学等事宜。儒学正堂设有考棚，光绪三十一年(1905年)，废科举，兴学校、裁教谕和训导，设劝学所，主管全县教育事宜。
  此外，县城设有城守营，又名防汛厅，设把总1人。城守营内设文书和武备二师爷，负责把守城池和防治水患。
  僧、道会司，设有专官，主管全县佛教、道教。
  县以下，按自然地理区域，划分为13乡，80多个里，但乡、里均未设办事机构，行政事务由各地豪绅和族长掌管。光绪三十三年，知县谭鸿基召集全县乡绅会议，将全县八十六里改为八十六区（包括县城内四个区），乡有正，区有长。乡正和区长都由地方士绅充任，不列入政府官制，为地方自治组织。