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余姓是夏禹的后裔。据《风俗通》及《姓氏寻源》载: 余，“秦由余之后，系出隗姓”。《国语》云：“潞洛泉余满，皆隗姓也。”《百家姓考略》载：秦穆公伐西戎，获其臣由余，以为上卿，其后以王父字为氏。宋有余靖、余玠。
  由余，系春秋秦时人。"本晋人，亡入戎,.戎王闻秦穆公贤，使由余於秦以观之。穆公与之语，以为贤，因留不遣，遣戎王女乐间之，后由余降秦，为秦谋伐戎之策，益国十二，开地千里，遂霸西戎”（见《中国人名大辞典》“由余”条）。
  《姓氏辩证》云：“秦相由余之后，有由余氏。”后来，由余氏子孙将祖先的名字去了 “由”字，仅存一 “余”字。东晋明帝时，曾敕旨改“余”为“余”，至南朝宋武帝时，即恢复 “余”姓，这就是“余”姓的来历。
  余姓最初居秦之西北，后来繁衍到江苏下邳，浙江吴兴、 新安，河南高阳、新郑诸处，并成望族。而泉州余姓郡望，多见“下邳”。
  余姓闽之始祖，见载有如下几种：其一，“始祖青，世居河南固始，梁武帝（萧衍）时，宰闽之建阳，闻侯景扰江南，遂解组而避焉，是为入闽鼻祖也。” （见《潭阳余氏族谱》）其二，唐朝建阳人余镐，字周京，咸通进士，除授校书郎。因疏谏僖宗荒嬉不纳，便以父老乞归。至黄巢陷建州，余镐避居莆田。王审知据闽，辟召不应，耕隐壶山以终。
  其三，南唐时古田人余璀，字崑美，善唐律，仕为左拾遗，后移家将乐。
  其四，《中国文化大博览》载：余章，光州固始人，唐末黄巢之乱，随王潮入闽，居三山，为福建余姓一世祖。安溪、 南安、晋江诸余姓，多源于本支。
  万水归宗。晋江丙厝余姓以“金陵衍派”为堂号。祠堂楹联云：下邳世泽千年远；丙里宗支万代长。显然，晋江丙厝余姓尊仕南唐梁武帝的余青为鼻祖。
  闽南余姓，先哲贤才接踵相继，尤以宋、明更为显赫昌盛。
  余克济，字叔济，安溪人。宋庆元五年（1199年）登进士，其学邃于《春秋》，所至皆有治绩。著《通解》十五卷。
  余诚之，晋江人，宋庆元五年（1199年）登进士。历官秘书丞，避韩拕胄，力乞补外，后官至兵部侍郎。
  余福，字万祥，惠安人。明永乐间进士，官行人，劾权要，为讎所挤。
  余楠，字仕茂，号草崖，晋江人，遍读书史，不思科举场屋，助弟余栋于嘉靖四十三年（1564年）中举人；助其侄余炜于万历十六年（1588年）中举人。