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朱子的《四书》注释，首次清楚揭示出圣人之所以为圣的特质。
  圣人是天理、天道之化身，与天理合一无间，为道体之呈现。“圣人则表里精粗无不昭彻，其形骸虽是人，其实只是一团天理。”①“故人终不知，独有个天理与圣人相契耳。”②朱子从本体之理出发，论证圣人浑是天理，其作用处置万事万物，皆从天理上自然流出，无不中道合宜，犹如天地之诚实不伪，生生不息，虽有精粗远近之别而事物各得其宜。“吾道一以贯之章”注，“圣人之心，浑然一理，而泛应曲当，用各不同。”（《论语集注·里仁》）“饭疏食饮水章”注，“圣人之心，浑然天理”。（《论语集注·述而》）圣人是天理流行之实，为天理之客观呈现，举手投足，动静语默，皆合乎天理，中乎法度，无须勉强，乃天道精义之自然显现。“予欲无言”章注，“学者多以言语观圣人，而不察其天理流行之实，有不待言而著者。……圣人一动一静，莫非妙道精义之发，亦天而已，岂待言而显哉？”（《论语集注·阳货》）
  圣人之大全。圣人周全无遗，道大德全，如天地无所不包，无所不备，始终本末精粗动静，皆为一致。在一切行为事物上皆体现出理之完善，不存在丝毫的疏漏和瑕疵。“达巷党人”章注，“尹氏曰：圣人道全而德备，不可以偏长目之也。”（《论语集注·子罕》）“子见南子章”注，“圣人道大德全，无可不可。”（《论语集注·雍也》）这些皆强调圣人在道德上的纯全完备，达到了无往不可的地步，“圣人万善皆备，有一豪之失，此不足为圣人”①。
  圣人形象与天地相通，如太极之一体浑然而备阴阳正气，于外在容貌间呈露中和气象，显示其与天合一之境界。②“子温而厉”章注，“人之德性本无不备，而气质所赋，鲜有不偏，惟圣人全体浑然，阴阳合德，故其中和之气见于容貌之间者如此。”（《论语集注·泰伯》）圣人与天地化育相通的天地气象自然展露，时刻皆以道示人，无有丝毫隐藏。圣人之大全与其创生特质相联系，于生生不息，连续持久上显出圣之道大。圣人是如天地乾坤般的最大全体，是一至高至极至善的存在；如天道般流转不已，不可窥测。“发愤忘食”章注：“然深味之，则见其全体至极，纯亦不已之妙，有非圣人不能及者。”（《论语集注·子罕》）
  圣人之通。“圣”从字义上讲，与听觉有着紧密关联，为“通”义。《说文》：“圣，通也。从耳，呈声。段注：《周礼》：‘六德教万民，智仁圣义忠和’。注云：‘圣，通而先识。《洪范》曰：‘睿作圣’，凡一事精通亦得为之圣。’《风俗通》曰：‘圣者，声也。言闻声知情。’按：声、圣字古相假借。”③朱子亦突出圣人通达无碍无有限量的特质，指出圣人无论在处己修德还是外在应物上，皆无所不通。这种通，亦是学习之结果。“固天纵之将圣”章注，“圣无不通，多能乃其余事。”（《论语集注·子罕》）圣人之通还表现在因革损益、鉴往知来的变通上。圣人对事物客观规律和演进态势有着准确把握，能够鉴往知来，如对于三代礼乐之因革损益，皆能辨析其变与不变之成分，由其不变之本质推出将来之发展，而其通变则非汉代所谓“谶纬术数之学”可比。“子张问十世可知也”章注：“盖欲知来，而圣人言其既往者以明之也。圣人所以知来者盖如此，非若后世谶纬术数之学也。”（《论语集注·为政》）朱子认为只有圣人的通变才能达至经权之中，故从圣人之体经用权上亦能见出圣人之通。“佛肸召”章注，“张敬夫曰：子路昔者之所闻，君子守身之常法。夫子今日之所言，圣人体道之大权也。”（《论语集注·阳货》）
  圣人之“神明不测、大而化之”。朱子指出圣人乃神奇明彻变化无端之称号，这是圣人之功效作用。圣人与君子、士之区别在于，同样的行为不仅做得完美无暇，更在于自然从容，毫不费力，达到了出神入化之境。未能达此境者，则事事勉强费力，未能尽善尽美。“圣人，神明不测之号。”（《论语集注·述而》）“圣者，大而化之。”（《论语集注·述而》）“颜渊、季路侍”章的注释中，朱子充分诠释了圣人裁成辅相天地之道的化功，指出孔子志向即是安顿天下百姓，使各个阶层的民众皆有所养，各归其位，各得其所。其施为则如天地一般，顺万物之自然，因其本性而点化，不假丝毫人为之力，实具天地无心成化之神奇效果。“至于夫子，则如天地之化工，付与万物而己不劳焉，此圣人之所为也。今夫羁靮以御马而不以制牛，人皆知羁靮之作在乎人，而不知羁靮之生由于马，圣人之化，亦犹是也。”（《论语集注·公冶长》）
  圣人之化亦有变化无息之义。圣人与道体为一，其心如天地之创生变化，如时序之循环运转，无有停息，纯亦不已，乃天德王道。这种化的一个特点是造道极高而自然无为，圣人道德深厚，于民之治教皆顺其自然，无须有所作为，而自化成天下，泽被四海。尽管呈现出来的作用自然而然，但其心体之变化则神妙莫测。“无为而治者”章注，“无为而治者，圣人德盛而民化，不待其有所作为也。独称舜者，绍尧之后，而又得人以任众职，故尤不见其有为之迹也。”（《论语集注·卫灵公》）圣人之化上通于天，下达于地，周流遍布，难以预测，如天地一般，所存者神，所过者化，人观其教化之功，而莫测其神奇之体。这种化功往往于圣人威仪举止间显现，对学者产生观感而化，化人于无形之效果。故朱子在“夫子至于是邦也”章引谢氏说：“学者观于圣人威仪之间，亦可以进德矣。今去圣人千五百年，以此五者想见其形容，尚能使人兴起，而况于亲炙之者乎！”（《论语集注·学而》）揭示了圣人内在德性所至显透于外，对他人心灵所产生的感化效果。以物质为喻，圣人好比一种无形的香味，与其接触之物，必默然不觉染上其味，受其感化。这种现象的存在是有事实经验根据的。圣人之化，还体现在它不拘泥固执于某一点，随心所欲而皆一一合乎中道，达到无可无不可之化境。