莆田市图书馆

第一节 财政审计
  一、市级财政审计
  20世纪90年代初，市审计局开始探索对同级财政预算执行情况审计的方法，总结“以财政综合预算执行审计为主线，以其他财政财务收支审计为补充，以专项资金审计为重点”的审计路子，坚持从“账户入手，下审一级”，把握住财政、税收两个财政预算执行的源头单位，突出对预算收入大户，支出大户和重点部门、重点单位和重点资金的审计监督。8月，对莆田县人民政府1994年度的财政决算进行审计。10月，对市财政局、地方税务局以及与财政收支有关的市土地局、工商局、教育局、公安局、林业局、机关事务管理局、物价管理委员会、莆田一中等14个重点部门和单位1995年的预算执行情况以及科技三项经费、城建经费、电力附加和农业专项资金进行审计和审计调查。是年，市审计局还结合同级财政预算执行情况先后对财政预算外资金、财政有偿使用资金、财政周转金管理和使用情况，财政赤字情况和税收征管情况和政府负债等情况开展专项审计调查。
  1996年，对市财政局、地方税务局、教育局、林业局、水利局、粮食局、交通局、民政局、计划委员会和科学技术委员会10等个部门和所属单位进计审计，同时还对部份财政收支大户和重点单位的财政财务收支情况进行审计调查。实际审计65个部门和单位，延伸审计调查38个单位，审计涉及面占预算单位数的31.3％。审计查出违纪违规金额443.62万元，其中应缴财政金额39.2万元，罚款12个单位，金额11.59万元。是年，对市本级财政部门1995年度预算外资金的收支规模和管理情况进行清理和检查。
  1997年，对同级财政、税务部门及有预算收入上缴任务的部门和单位的预算执行情况和其他财务收支情况进行审计，审计部门和单位主要有市计委、财委、物委、建委、教委、土地局、规划局、水电局等19个部门24个单位，并对重点建设项目湄洲湾北岸供水工程、九仙溪水电站和市自来水扩建工程的资金到位和管理情况进行审计以及对市电视台、湄洲日报社2个预算外资金收支大户的财务收支情况进行审计，查出各类违纪违规金额3643.9万元，应上缴财政金额316.02万元。
  1998年，除了对本级财政预算执行情况进行审计外，还对莆田、仙游2个县级财政和湄洲湾北岸管委会、湄洲岛管委会1997年度的财政决算和预算执行情况进行审计。各县（区）审计局也对全市15个乡镇财政进行财政决算审计，查出违纪违规金额844万元。1999年，市审计局主要对市财政局本局预算执行情况和湄洲湾北岸管委会、湄洲岛管委会1999年度的财政决算情况进行审计。
  2000年，主要审计市财政具体组织的预算收支情况、地税部门税收征管情况、市中心支行国家金库办理的预算资金的收纳拨付情况和教育经费、科技三项经费等法定支出情况，以及部份市政府部门预算执行情况，审计23个部门和单位。
  2001年，全市审计机关重点审计市财政局、地税局、计委、经贸委、国土资源局、交通局、建设局、科技局等16个一级预算单位和42个预算执行单位，延伸审计市金库及部份二、三级预算执行单位。在对同级财政进行预算执行审计的同时，对市直部分行政事业单位的政府性基金进行专项审计调查，调查涉及17个单位33个基金项目，涉及总金额为10112万元。
  2002年，主要审计市财政局具体组织市本级预算执行和地税部门税收征管情况和26个部门单位预算执行情况以及政府采购资金、执法单位罚没款以及预算外资金管理情况，环保、城市居民最低生活保障金等专项资金管理使用情况，查出各类违纪违规金额2799万元，其中虚增财政收入124万元，违规办理预算拨款96元，隐瞒、挖挤预算收入522万元，挪用预算资金80万元，并对涉及区划调整的莆田县、城厢、荔城、涵江4个县（区）的财政收支情况和资产负债情况进行全面审计。
  2003年，市审计机关对本级地税部门2002年度税收计划完成情况和政策执行情况进行审计，重点审计金融、电力、移动通信等43家企业的营业税和所得税等征收和管理情况。3月，全国抗防“非典”时期，市审计局对市卫生局2002年预算执行情况和其他财政财务收支审计项目延伸审计，发现卫生局所属2个医院未能严格执行药品收支结余收支两条线的规定，直接影响市财政“社会保障基金专户—社区卫生服务和预防保健事业资金”收入71万元，建议补缴入库，作为防“非典”专项资金，得到市政府采纳。是年，对市本级2002年度政府采购情况、市卫生局组织的医疗器械和市建设局政府工程类项目的政府采购情况等30个市本级采购机关和2家供应商进行审计调查。
  2004年，重点对地税部门征管情况和有预算内外专项资金再次分配权的、年末结存资金金额大的重点部门和单位进行审计；揭示市地税部门2004年度违规征缴税费1514.5万元问题。
  2005年，重点对二级预算单位的行政性收费、预算外经费和应缴未缴预算款项进行审计。主要审计市财政局具体组织2005年市本级预算执行情况，市地税局税收征管情况，市府办、经贸委、教育局等11个部门及其所属的4个二级单位预算执行情况，世行贷款沿海资源可持续开发项目资金、医保基金管理使用情况，并对由省审计厅统一组织和部署的2004、2005年度农村税费改革转移支付补助资金、扶贫资金、救灾资金、农村路网工程项目资金等四个专项资金进行审计调查。是年，对市地税局2004年度税收征管及经费收支情况的进行审计时，通过延伸对有关纳税大户的审计调查，发现市地税部门在执收过程中，违规将应由市级直征缴库的2004年度税费1514.50万元划归县（区）地税部门征收，缴入县（区）国库，影响市本级的财政收入，市审计局要求市财政局对上述款项进行划拨。
  二、县（区）级财政审计
  1991年，市审计局对莆田县、仙游县、城厢区和涵江区的财政决算进行审计，对审计中存在的违规退库、虚列支出、挪用、截留预算经费等严重违反财政纪律的行为予以披露。1998年，在审计仙游县财政决算中，查出该局截留预算经费、挪用公款放贷等严重违纪问题。1999年，在审计湄洲湾北岸管委会山亭乡财政进行决算中，山亭乡财政所未能严格执行《中华人民共和国预算法》，乡财政存在严重违反财政纪律的情况向北岸管委会和财政局提出协助进行清理整顿。2003年、2004年，市审计局先后派出审计组对荔城区人民政府、城厢区人民政府和涵江区人民政府2002年和2003年度的财政决算进行审计。
  三、部门财政决算审签
  2001年，莆田市审计局探索和试行部门决算审签制度、预算执行审计的新办法。2003—2005年，市审计局在总结经验的基础上制定印发《部门决算审签暂行办法》，在全市审计机关范围内推广部门决算审签制度。
  第二节 金融外资运用审计
  一、金融审计
  1991—1992年，莆田市各级审计机关重点对各银行、保险公司外资运用资产、负债、权益情况进行审计，对违规贷、拆借资金等问题进行调查处理。
  1993年，莆田市审计局对中国人民银行莆田分行、农业银行莆田分行整顿金融秩序情况进行审计调查，并对建设银行莆田分行1992年度至1993年度第一季度信贷资金管理和计划执行情况进行审计，对超规模发放贷款，违规拆借资金等违纪问题进行处理。
  1995年，对中国银行莆田分行，建设银行莆田银行1994年度的资产、负债、损益情况和消费基金增长情况进行审计和审计调查。1996年，对农行莆田分行、保险公司等莆田分公司的资产、负债、损益情况进行审计。1998年，对市人寿保险和财产保险公司莆田分公司1997年度资产、负债、损益情况审计，查处一起县级保险公司业务员采取抽取原始凭证重复报销冒领侵吞理赔款的经济案件。
  1999年，对中国工商银行莆田分行1998年度资产负债损益情况审计，延伸审计分行直属2个核算部、4个分理处、14个储蓄所、134家贷款企业，查出违规提退手续费，滥发奖金福利等违规金额48.65万元。是年，对福建兴业银行1998年度资产、负债、损益情况进行审计。2001年，对中国人民保险公司莆田分公司及所属支公司1999—2000年度资产、负债损益情况进行审计，查处各类违规金额124.38万元。2002年，对农业发展银行莆田市分行2001年资产负债损益情况进行审计，重点对信贷资产质量进行检查，查出该行被骗贷款237万元等问题。
  2003—2005年，对中国人寿保险公司莆田分公司2002年资产负债损益进行审计，延伸审计查出秀屿区月塘乡东潘村村委主任潘某等3人涉嫌利用职权骗取和挪用人寿保险公司退回给该村200多村民的少儿养老保险金和计生养老保险金6万余元为村干部投保国寿千禧理财二全保险的违法行为。
  二、外资运用审计
  1999年，市、县（区）审计局先后派出审计组对所辖市直各部门、各县区截止1998年利用亚洲开发银行和世界银行援贷款项目配套资金到位使用情况进行审计调查。截止1998年莆田市政府引进国外援贷款项2两个，即亚洲开发银行水土保持与乡村发展贷款项目（亚行水土项目）和世界银行农村卫生人力开发贷款项目（简称世行卫Ⅳ项目）。经审计，地方政府配套资金的到期位率不高，影响项目贷款资金的特别提款权（SDR）速度。
  2001年，审计机关对世行贷款农村卫生人力开发、沿海资源可持续发展和亚行水土保持与乡村发展项目的17个项目进行审计，查出违规金额523万元。2002年，对亚行水土保持与乡村发展、水土保持与农业开发、水产养殖开发、农贸市场开发、农产品加工开发、小水电工程开发7个分项目及世行贷款沿海资源可持续开发等共20个国外援贷款项目进行审计。审计发现市直和湄洲岛利用国外援贷款指标被调整给其他地市的情况。
  2003年，对市发改委、市财政局、市外汇管理局等政府外债管理部门和转贷金融机构、项目执行单位的世亚行及外国金融机构的借、贷、用、还等政府外债管理情况进行专项调查。
  2004—2005年，对2003年度世界银行贷款英国政府赠款中国结核病控制项目进行审计。2004年3月至2005年3月，全市审计机关共完成世行贷款沿海资源可持续开发发展项目等24个国外援贷款项目审计和审计调查，查出违规金额171万元，管理不规范金额4348万元，其他违规金额140万元。
  第三节 企业审计
  1991—1992年，市审计局主要对亏损大户莆田合成氨厂、食品行业、粮油购销行业、物资等行业的经营情况进行审计和审计调查，重点分析企业在经营活动中造成亏损的原因，帮助企业挖潜革新，提高经济效益。1993年，对市直国有工交企业转换经营机制情况进行专项审计调查。
  1998年，各级审计机关对国有企业经营的真实性和效益性进行审计，特别是对国有大中型亏损企业的审计。4月，对仙游糖厂、莆田糖厂1997年财务收支情况进行审计。仙游县审计局和城厢区审计局也分别对该所属自来水公司和新街口商场经营的真实性进行审计。是年，莆田市各级审计机关还对全市粮食行业经营情况进行一次审计调查。通过调查发现莆田市粮食行业企业报表反映亏损总额为2000多万元；审计调增亏损162万元，其中政策性亏损1761万元，经营性亏损336万元，对莆田市部分医疗单位1996年度的财务收支和管理情况进行了审计，审计的重点是医疗收费、药品管理和经营核算。1999年，对莆田市印刷厂1997、1998年度的财务状况和亏损情况进行审计。
  2002年，莆田雪津啤酒厂改制为股份制责任公司，成立福建雪津啤酒集团和莆田雪津啤酒有限责任公司。市审计局对雪津啤酒厂的资产、负债、损益的真实、合法和国有资产的保值增值情况进行审计，查出隐瞒截留收入和偷漏税收324万元。
  2003年，对莆田市国际经济合作有限公司2002年度企业资产、负债损益情况以及澳门劳工管理组劳工管理费收支情况进行审计。11月，对原莆田糖厂破产清算中存在的问题进行审计调查。
  2004年，对莆田市厦门湄洲进出口贸易公司改制前的资产负债损溢及国有股份收益情况进行审计，重点验证公司在企业改制过程中对国有资产评估的正确性和完整性、债权债务情况、职工身份置换计算以及国有净资产处置的真实性和合法性，并对2003年1至8月改制期间企业商品销售收入、成本、税费、出口退税、汇兑损益、利润等形成的国有股权收益情况进行核实。
  2005年，莆田雪津啤酒有限公司决定在福建省产权交易中心挂牌，面向全球通过要约竞价寻求合作伙伴，进行国有股权转让。市审计局对该公司的资产、负债、国有股权收益和国有资产的增值保值情况以及公司董事长的经济责任进行审计。是年，比利时的英博啤酒集团通过市场竞价以58.86亿元收购当时年产只有72万吨，净资产只有5亿多元的雪津啤酒的控股权，资产溢价率为1000％。
  第四节 行政事业审计
  1991年，莆田市审计局对重点单位、重点部门、重点资金，特别是对那些预算外资金收入多、罚没收入多、遵守财经纪律差的行政事业单位和部门进行经常性的财务收支审计，重点查处变预算内为预算外、截留和挪用行政经费、私设“小金库”、滥发资金实物等违法违规问题。1995年，对行政事业单位与同级财政预算执行情况一并审计。
  1998年，对全市公安和交警系统的罚没款和1997年度的财务审计中发现2个部门存在截留、挪用罚没款、设立账外账、巧立名目乱收费等问题，市审计局要求2个部门领导对存在的问题进行及时整改。
  1999年，对全市法院系统进行审计时，发现该系统在财务和暂扣物、款管理方面不规范，要求市财政局要对法院的财政、财务收支情况进行调查，加强对暂扣款、财物的管理。
  2000年，市审计局对全市（含县区）6个工商行政管理局1997年和1999年度财政、财务收支和1998年度的行政收费以及罚没收入情况进行全面的审计。通过审计发现全市工商系统共拖欠、截留应缴预算款和行政性收费60多万元，漏交税金20多万元，同时还存在扩大和虚列支出、固定资产管理不规范等问题。
  2001年，莆田市审计局结合同级财政预算执行审计，重点审计市地税局、国土资源局、城乡规划局、公安局湄洲湾北岸分局、教育局、民政局、计委、经委、财委等重点单位和部门。
  2002年，湄州北岸管委会审计特派员办事处，在对北岸管委会机关党工委2001年财务收支审计时，发现该机关党委会从1999年开始存在党费收入不入账、虚报冒领、违规报销汽车购置费等问题，查出该机关党委会书记吴某某涉嫌挪用、贪污党费等问题。
  2003年，市审计局指派城厢区审计局对仙游县公安局2002年度的财务收支和其他资金的收支情况进行审计，查出各类违规金额260.35万元，管理不规范金额114.69万元，应调账处理金额1.79万元。
  2004—2005年，对境内工商系统2003年度财政财务收支进行审计。
  第五节 领导干部任期经济责任审计
  1993年，市审计局探索厂长（经理）、乡（镇）长和县（区）局长的任期经济责任审计。1998年8月，市委、市政府批准市纪委、市委组织部、市监察局、市人事局、市审计局《关于对领导干部实行任期经济责任审计制度的意见》。1999年，建立领导干部任期经济责任审计联席会议制度，办公室挂靠市审计局。是年，开展县级以下党政领导干部和国有企业及国有控股企业领导人员经济责任审计工作。2000年，市审计局把领导干部任期经济责任审计中发现的问题整理成《审计要情专报》定期报市委、市政府领导。是年，开展县级以上党政领导干部经济责任审计工作。2001年，成立由纪委、监察、组织、人事、审计等机关组成市经济责任审计工作联席会议。2002年，成立“经济责任审计科”，8月，结合行政区划调整，对莆田县、仙游县、城厢区、涵江区、北岸管委会5名县（区）长、管委会主任的任期经济责任进行审计。10月，对仙游县审计局原局长林建仁的任期经济责任进行审计。是年，莆田市是全国12个经济责任审计试点单位之一。
  2003年，市纪委、市委组织部、市监察局、市人事局、市审计局制定《莆田市经济责任审计结果运用暂行规定》。2004年11月，经济责任审计科更名为经济责任审计室。同时，仙游县、荔城区、城厢区、涵江区、秀屿区成立经济责任审计局和经济责任审计分局。是年，对原莆田县县长吴元珍和仙游县县长林素钦的任期经济责任进行审计。是年，莆田市被中纪委、中组部、监察部、人事部和审计署五部委评为“全国经济责任审计工作先进地区”。
  2005年，对城厢区区长阮军经济责任进行审计，配合由泉州市审计局负责的对涵江区区长林庆生和荔城区区长陈国林的任期经济责任的审计。是年，全省经济责任审计工作联席会议在莆田市召开。至2005年，市纪委与审计机关对全市483名党政领导干部和32名国有企业领导人员进行经济责任审计，其中兼任部门主要领导干部的厅级干部5人、处级领导干部104人（次），科级及乡镇领导干部411（次），企业领导干部23人（次），查出违纪违规3737万元，管理不规范金额2.15亿、损失浪费358万元，发现经济案件线索20件，党政纪处分5人，追究刑事责任1人。经审计后提拔任用47人，平级调动岗位82人，免职11人（含离退休人员）。
  第六节 固定资产投资审计
  1991年，市审计局除按规定对建设项目进行自筹基建资金审计和项目开工前审计外，还把投资规模大，关系国计民生的重点建设项目和重点工程建设资金上，特别是对那些社会群众普遍关注的民心工程，市政府为民办实事工程作为审计的工作重点。
  1993—1998年，市审计局对境内13个旧城改造指挥部资金管理和使用情况进行审计，审计中发现问题及时报告市委、市政府，由市委、市政府授权依法进行处理、处罚。1999年，市审计局与市监察局、市建设局联合组成调查组，对建市15周年18个城建献礼项目资金的筹集、使用和管理情况进行检查监督。2001年，对市重点建设项目延寿山庄和莆田医学院一期工程的竣工决算进行审计，分别核减工程款71％、8％，为财政节约资金600多万元。
  2002—2005年，依法对莆田市机关大院2000年至2002年的迁建项目建设管理和财务收支情况进行审计调查。对“木兰溪一期防洪水利工程”，“霞皋垃圾处理厂”使用国债资金的重点建设项目进行审计，对审计中发现问题要求有关单位限期整改。
  第七节 专项审计和审计调查
  1991年，对统筹企业养老保险基金和待业基金的缴纳管理使用情况进行审计。1994年，对1993年度房地产行业开发和微利住宅比例情况进行专项审计调查，调查发现境内89家房地产行业开发企业注册资金127506万元，实际到位率11.35％。
  1995年，对莆田市本级财政、仙游县财政和市计委、农委、市扶贫办、市农业银行等10多个单位1993年、1994年度农业资金的投入情况进行审计调查。1996年，对农业综合开发资金的管理和使用情况进行审计，重点审计市、县农业资金的配套情况。仙游县审计局也对仙游县综合农场、郊尾兴龙果场、赖店镇、城东镇农业综合开发项目等用款单位进行审计。
  1997年，对莆田县、仙游县社会养老保险公司1996年度社会养老保险金财务收支情况及莆田县、仙游县、城厢区、涵江区劳动服务公司1996年度失业保险专项基金进行全面的审计，重点审计单位内控制度、内部财务管理及“两项基金”的管、征、缴和使用的情况。1998年，对全市机关事业和农村养老保险基金进行全面的审计和审计调查，发现欠缴金额1243万元，挤占挪用现象比较严重。
  1998年，市各级审计机关对市直及莆田、仙游、涵江、城厢4个县（区）1996年、1997两个年度的水利专项资金的预算、筹集、管理和使用情况进行审计。是年，对中国福利彩票赈灾募集销售活动情况进行专项审计，发现主办单位和承包销售单位存在套开发票、偷税漏税等违纪问题，违纪金额436万元。1999年，对救灾款物进行审计监督。
  2000年，审计机关对境内1171所中小学的收费情况进行专项的审计调查，重点查处私设名目、搭车乱收费和私设“小金库”等违法违规问题。5月，对湄洲湾北岸管委会农村社会保险公司1998年末基金结余和1999年度社会保险基金收支情况进行审计，发现有2个乡镇农保所票据短缺、票款不符；农保代办员涉嫌侵占揶用农保基金等严重违纪的问题，1人被追究刑事责任，3位责任人受党政纪律处分。
  2001年，市审计局对全市4个教育主管部门、6所重点中学和5所小学及部分乡镇财政所的教育经费投入、拨付、使用和管理情况进行专项审计调查。是年，驻湄洲湾北岸管委会审计特派员办事处对该管委会8个乡镇、17个行政村、30个变电站农村电网建设和改造项目进行审计和审计调查，发现大部分乡镇、村、站存在着多收费或搭车乱收费的情况，要求各乡镇、村、站把多收的费用退还农民，减轻农民负担1257万元。
  2002年，市审计机关对全市医疗、医药收费情况进行审计和审计调查，调查20个市、县医院及乡镇卫生院，8家医药供应单位。3月，对莆田县、仙游县、湄洲湾北岸管委会1999—2001年度农业综合开发项目资金的投入、管理、使用和效益进行审计和审计调查，涉及市县财政局、农业综合开发办公室等13个单位、16个乡镇，并抽审7个具体项目的计划和实施情况。审计中发现3个问题被省列为重点整改对象。是年，部分县（区）和乡镇行政区划作了调整。市审计机关对涉及行政区划调整的5个县（区）、1个管委会、17个乡镇、30个部门和单位的财政资金、财务收支以及国有资产的真实、合法和资产的完整性进行全面的审计和审计调查。
  2003年，市审计局对行政罚没款收缴和办案费使用情况、政府采购专项资金和预算外资金的专项审计调查，突出对预算外资金收支大户、重点资金、重点项目的审计监督，着重揭示行政罚没款在处罚程序、标准、幅度、决定书的执行，政府采购的计划、信息、运作、招标和监督，预算外资金的漏收、少收、拆借、调度和管理等方面存在的主要问题。
  2004年，重点对社会劳动保险中心、机关事业单位社会保险中心、医疗保险管理中心、劳动就业中心和农村社会保险中心5个社保经办机构2003年度社保基金的征收、管理、使用情况进行专项审计。审计发现有经办机构过渡户滞留养老保险基金及医疗保险基金1348万元，参保单位拖欠社会保险基金2489万元，各级财政补助的医疗保险费未能到位3624万元，挤占、挪用社保基金810万元。
  2005年，各级审计机关对各级政府2004年度城镇职工基本医疗保险和基本养老保险专项基金的筹集、管理和使用情况进行审计。审计发现市县（区）医保资金预算安排不足或者预算执行不到位，挤占挪用医保资金现象，如荔城区财政局2002年、2003年挪用医保金598万元，秀屿区财政局2002年挪用医保基金550万元。
  第八节 审计质量管理
  1999—2001年，莆田市审计局连续3年开展“审计质量年”、“强化审计质量意识年”、“审计质量建设年”活动，重新修订和完善“重大审计事项报告制度”、“审计业务审理制度”、“审计业务综合考评制度”和“审计过错责任追究制度”，强化审计复核制度，对审计行为、审计程序进行规范，明确责任，率先实行“审计公示”制度和“审计结果讲评”制度。
  2003年，重新修订制定“莆田市审计项目质量控制和审计责任追究试行办法”，制定一整套审计控制表格，对审计过程中的各个关键控制点进行控制，实现对审计项目全过程的质量控制。同时，重视对后续审计的监督和审计成果运用，制定《关于强化审计时效和跟踪审计的意见》，强调在审计决定送达3个月之内要对《审计决定》的执行和《审计报告》中提出的整改意见的整改落实情况进行检查，督促被审计单位要在规定的时间内执行审计决定，并对审计中发现的问题进行有效整改。联合市财政局、监察局颁发《关于认真落实审计决定的通知》，充分发挥审计、财政、监察三个职能部门的互补作用，以行政监察、效能告诫、财政扣款等行政手段，督促被审计单位全面执行和落实审计决定和意见。2004年7月16日《中国审计报》以《借助各方力量，形成合力——莆田市审计局狠抓审计结论的落实》为题对市审计局作了专题报道。2005年，选送的运用计算机A0软件“盐业行业审计项目”获得国家审计署表彰。
  第九节 机构
  一、市审计局
  1991年，莆田市审计局内设行政事业审计科、工交企业审计科、外经商贸企业审计科、综合审计科4个科，编制9人。1997年，内设办公室、综合审计科、财政金融审计科、行政事业审计科、工交审计科、外经商粮贸审计科、基建审计科、农林水审计科、纪检监察室（由市纪委、监察局派驻）9个科室，机关行政事业编制27名（含派驻纪检监察编制），机关后勤事业编制3名。
  2002年，辖仙游县、荔城区、城厢区、涵江区和秀屿区审计局。内设办公室、监察室（由市纪委监察局派驻）、法制科、财政金融审计科、行政事业审计科、经贸审计科、农业与资源环保审计科、固定资产投资审计科、经济责任审计室、特派审计室和计算机应用中心。2003年，增设社会保障审计科，内设11个科室1个中心。核定编制31人，其中行政编制28人，机关工勤事业编制3人，计算机应用中心事业编制3人。
  2005年，在编行政人员30人，机关事业编制6人。其中研究生1人、大学本科20人、大学专科9人、中专4人，具有高级职称2人、中级职称17人、初级职称3人。
  二、莆田市经济责任审计工作联席会议办公室
  2000年，建立莆田市经济责任审计工作联席会议制度，设立联席会议办公室，挂靠莆田市审计局办公。联席会议成员单位由市纪委、组织部、监察局、人事局、审计局5个单位组成。市纪委和市审计局为联席会议牵头单位。核定机关编制3名，工勤编制1名。
  三、莆田市审计局驻湄洲湾北岸审计特派办事处
  1999年，成立莆田市审计局驻湄洲湾北岸审计特派办事处，为市审计局正科级派出机构。2002年7月，因行政区划调整，撤销莆田市审计局驻湄洲湾北岸审计特派员办事处。成立秀屿区审计局，核定编制9人。其中行政编制5人，事业编制3人，工勤1人。
  四、县（区）审计局
  （一）仙游县审计局1991年，县审计局内设办公室、法制股、财政金融审计股、行政事业审计股、经贸审计股、农业与资源环保审计股、固定资产投资审计股、政法文教卫生特派室、经济责任审计室和经济责任审计工作联席会议办公室等职能科室。2004年12月，成立仙游县经济责任审计局（二级局），与仙游县审计局合署办公。局机关行政编制29人，事业编制8人。2005年，人员37人，局长1人，副局长3人（含经济责任审计局副局长1人）。
  （二）荔城区审计局荔城区审计局前身为莆田县审计局。2002年7月，因区域调整，莆田县审计局更名为荔城区审计局。核定机关编制9人，内设机构4个，分别为办公室、财政金融审计股、行政事业审计股、经贸审计股。下设荔城区投资审计室，为区审计局下属财政全额拨款事业单位，编制5人。2004年5月成立荔城区经济责任分局，为区审计局下属副科级行政单位。配备局长1人，副局长3人（含经济责任审计局副局长1人）。
  （三）城厢区审计局城厢区审计局局本部行政编制5人，下设经济责任审计室和政府投资审计特派室2个事业单位，编制分别为2人和3人。2004年11月，成立城厢区经济责任审计分局，为区审计局下属副科级行政单位。配备局长1人，副局长3人（含经济责任审计局副局长1人）。
  （四）涵江区审计局涵江区审计局核编行政编制人员6名，领导职数2名。2005年，行政编制6名，领导职数3名。下设经济责任审计分局和基建审核决算中心。分别为区审计局下属副科级行政单位和财政全额拨款事业单位。配备局长1人，副局长3人（含经济责任审计局副局长1人）。
  （五）秀屿区审计局2002年7月，成立秀屿区审计局，核定编制9人。其中行政编制5人，事业编制3人，工勤1人。2005年2月，成立秀屿区经济责任审计分局，为区审计局下属副科级行政单位。配备局长1人，副局长3人（含经济责任审计局副局长1人）。
  五、莆田市审计师事务所
  莆田市审计师事务所前身为莆田市兴化审计事务所，1992年更名为莆田市审计师事务所，为市审计局下属的正科级事业单位。1997年机构改革时核定编制23人，为“独立核算、自收自支、自负盈亏”的事业单位。1999年，在编人员28人。是年，莆田市审计师事务所与市审计局脱钩。2000年，注册更名为莆田市审信会计师事务所，为股份制社会审计组织，从业人员15人。