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1996年，天津市海洋局（简称市海洋局）成立，隶属市科委，下设综合处、海洋科技处、资源环境处和监察监测处，行政编制25人，办公地点设在河西区浦口道143号。是年，增设天津古海岸与湿地国家级自然保护区管理处（简称保护区处）。2000年，市海洋局划归市规划和国土资源局管理，加挂国家海洋局天津海洋管理办公室牌子，下设办公室、发展计划处、海域管理处和海洋环境处，行政编制20人。2002年，增设中国海监天津市总队（简称海监总队）。2003年，市海洋局办公地点迁至天津开发区第二大街9号。2005年，办公地点迁至天津开发区第一大街12号。2007年，增设渤海海洋监视监测管理基地筹备处（简称基地筹备处）。2008年，增设法规和规划处、海洋经济管理处，增加行政编制6人。2009年，市海洋局升格为天津市政府直属正局级机构，下设办公室、计划财务处、法规和规划处、海洋经济管理处、海域管理处、海洋环境处，行政编制31人。下辖塘沽、汉沽和大港海洋管理处3个派出机构和保护区处、海监总队和基地筹备处3个事业单位。