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与古鱼类化石伴生的古两栖类、古鸟类“鳍翅鸟”化石，无论从骨骼结构还是外部生态性状，都与鱼类有着密切联系。这些事实，对研究古鱼类进化为新物种有很大的启示。根据新疆古鳕鱼化石的发现与鱼类演化的研究，证明：演化成新物种，是由生态的临界状态向另一物种过渡的。可见，古鱼类进化与临界生态的探讨有极其重要的意义，通过临界生态化石的发掘，证实鱼类的演化是多途径发展的。鱼类是最古老的脊椎动物类群，而研究临界生态化石，是研究古鱼类演化的重要方法。临界生态化石，是物种演化的最重要的证据，它是证明一个古生态地理种群，正向另一个古生态地理种群演化的最具体的依据。尤其是古鸟类“鳍翅鸟”化石，在古鱼类化石群中出现，并具有硬骨鱼生态性状的特征，它与传统的鱼类演化和分类实属不符。这种以硬骨鱼为原始参照群的古鸟类临界生态化石的出现，有可能打破传统鱼类演化与分类格局。
  （一）动物演化分类表序列
  1.分析两栖类、鸟类在动物演化分类表中的位置及其含义
  两栖类在演化分类表内位居第Ⅶ，鸟类位居第Ⅸ。鸟纲在爬虫类之后，哺乳类之前，其含义是：
  （1）鸟类根据分类学，划分在四足类。
  （2）鸟类根据胚胎学分类，属羊膜类。
  （3）鸟类根据繁殖形式和体温分布类型属于卵生、内温，有别于两栖类。
  （4）根据生物演化的顺序，传统的看法认为，鸟类是古爬行类进化来的。因此，鸟类的直接祖先是古爬行类，它与古鱼类演化没有直接联系。两栖类则是由鱼类进化来的，它的直接祖先是硬骨鱼纲的总鳍鱼。由于古鸟类“鳍翅鸟”临界生态化石的出土，取得并证实鸟类是硬骨鱼进化来的事实。因此，不能不重新考虑鸟类在动物演化分类表中的位置，以及鱼类六纲以后的其他两类，如爬行类、哺乳类与古鱼类的演化关系。根据古鱼类化石、古两栖类化石、古鸟类临界化石的发现，在动物演化分类表中，鱼类演化分类六纲以后的两纲、两类，其中两纲，即两栖纲、鸟纲，其进化都起源于鱼类；那么，另外两类，即爬虫类、哺乳类，其进化与起源是否也与鱼类演化有直接关系呢？
  2.动物演化与分类表中的序列 “开放 ”
  鱼类的演化，从无颌类到颌口类，六纲合并为鱼纲，鱼纲以后的进化顺序，是最原始的四足类到真正的陆生四足类，它们的胚胎演化，是由卵生到胎生，从无羊膜到有羊膜。那么从古两栖类化石及古鸟类化石的发现至少可以证明：
  （1）任何四足类都有可能从鱼类进化而来。
  （2）无羊膜类和有羊膜类也有可能从鱼进化而来。
  （3）胎生动物是由卵生动物演化而来的道理是否也可以成立呢？
  至少古两栖类化石及古鸟类“鳍翅鸟”临界生态化石的发现，可以证明以上三点是符合物种起源演化规律的。如果鱼类进化分类的六纲序列不变，那么鱼纲以后的两纲、两类则应实行序列“开放”，即改变了原来的演化序列，其序列“开放”后，拟改绘古鱼类演化图，以供探讨。见序列 “开放 ”后古鱼类演化图。
  3.序列 “开放”结果所得的演化规律
  （1）无羊膜（卵生）→有羊膜（卵生）→有羊膜（胎生）。
  （2）卵生（外温）→卵生（内温）→卵生、胎生（内温）。
  通过序列“开放”的探讨，认为：两栖类、鸟类、爬行类、哺乳类它们的直接祖先都有可能是鱼类。现在介绍比较普遍采用的分类法如表 1-3所示：
  注：①Ⅶ～Ⅹ纲为四足类，～Ⅹ纲为有羊膜类。
  ②加有“*”号者为化石种类。
  （二）红山区古鱼类演化谱系图的建立通过上述动物演化与分类表，对鱼类演化的总体系统进行了探讨。这里根据各类化石来研究鱼类演化，可用红山区古鱼类演化谱系图，表示两栖类“蛙鲵”、古鸟类“鳍翅鸟”的起源和演化谱系。
  两栖类的起源早有论述，一致认为它们起源于古代的总鳍鱼。最早的两栖类化石，见于古生代的泥盆纪，称为坚头类，是根据头骨、牙齿、肢骨结构等来确定其渊源关系的。其中鱼头螈就有两栖类特征。坚头类在演化过程中，出现过各种各样的适应辐射的后代，但大多数种类绝灭。目前一致的看法是：古代坚头类后裔中的两大支，是块椎类和壳椎类，它们是现存两栖类的始祖。根据红山区二叠纪发现的古两栖类有尾目“蛙鲵”化石来看，其头骨、肢骨、肋骨、肩胛骨、骨盆等结构，全然与坚头类大不相同。因此，不能不开展在古鱼类化石中寻找“蛙鲵”原始参照群的工作，结果在古鳕鱼化石中发现一种类鳕骨鳞鱼，其头骨与它近似，初步认为“蛙鲵”可能是类鳕骨鳞鱼进化来的。关于鸟类的起源，国内资料甚少，只在北京大学田清涞等编的《生物学教材》和台湾易希陶主编的《中山自然科学大辞典》两本书中发现有略述有关鸟的起源的内容。《生物学教材》中认为鸟类是从中生代侏罗纪的一种古爬行类动物进化来的，它的直接祖先还没有查明。这种说法，在国内外是具有普遍性的。《中山自然科学大辞典》中动物学部分，撰写的比较解剖学第三节，脊索动物分类表，第三纲，鸟类（Aves）第一亚纲，古鸟类（Archaeornithes）如化石始祖鸟（Archaeopteryx）；第二亚纲，今鸟类（Neornithes），第一超目，齿鸟类（Odontognathae）如化石黄昏鸟（Hespeyornis），鱼鸟（Ichthyornis）等。其中化石鸟类仅仅列举了以上3种。目前根据资料所知，化石鸟类仅有 3种，其中始祖鸟算是最古老的。
  我国新疆红山区二叠纪发现的古鸟类“鳍翅鸟”化石，经初步鉴定，可能是最早的鸟类。该“鳍翅鸟”体被羽毛，骨骼结构、呼吸系统均具备鸟的特征，头、胸、背、尾均有鸟类羽毛分区，其卵巢及背鳍与硬鳞硬骨鱼相同，尾为鱼类原型尾，左右两翅明显由鱼类胸鳍发育而成，因此，定名为“鳍翅鸟”。对其左右两翅及背鳍、原型尾与硬鳞软鳍硬骨鱼中的古鳕对比分析，生态特征相同，证明它是由古鳕鱼的一种鱼类进化来的，古鳕鱼是它的原始参照群。由于 “鳍翅鸟 ”生态性状还保留有鱼类的祖征，所以认为它是由鱼类向鸟类进化的临界生态古鸟类。
  根据古两栖类有尾目“蛙鲵”、古鸟类“鳍翅鸟”临界生态化石的发现，建立红山区古鱼类演化谱系图，用以说明红山区二叠纪内陆湖盆古鱼类演化的基本状况。