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咸和元年至二年（326～327）前凉政权一直向西发展，征服了西域诸国。永和元年（345）前凉统治者张骏病逝，，其子张重华继位。他在位期间（346～356），龟兹与西域其他国，及前凉仍保持着密切关系。自此以后，前凉内讧迭起，君主频繁易位，一个不如一个，终于为前秦所灭。
  前秦是我国古代少数民族氐人建立的政权。太元元年（376），前秦苻坚攻灭前凉，任命梁熙为持节、西中部将、凉州刺史、领护西羌校尉，驻扎于姑臧（今甘肃武威），统领原前凉所有的武威、张掖、酒泉、敦煌、高昌诸郡，以及青海的一部分地区。熙遣使赴西域各国，宣传苻坚的威德，以绦缯赐诸王，力求恢复中西交通，统一西域。“于是朝献者十有余国”（《晋书·苻坚传》）。稍后，“鄯善王、车师前部来朝，大宛献汗血马，肃慎南楉矢，天竺献火烷布，康居、于阗及海东诸国凡六十有二王，皆遣使贡其方物”。苻坚祗位其事于太和七年（382）前，因至公元382年时车师前部王弥阗、鄯善王休密驮又来朝贡，“坚赐以朝服，引见西堂。阗等观其宫宇壮丽，仪卫严肃，甚惧，因请年年贡献。坚以西域路遥不许，令三年一贡，九年一朝，以为永制。阗请曰‘大宛诸国，虽通贡献，然诚节未纯，请乞依汉置都护故事，若出关，请为向导’”（《新唐书·突厥下》）。上述“十有余国”及“六十有二王”的朝献中均未列龟兹、焉耆之名，显然龟兹、焉耆也被列为“诚节未纯”之列。史书虽没有明说，但从苻坚派遣吕光远征龟兹、焉耆的行动看，是从他们“诚节未纯”的确切行动中作出的决断。
  当时的龟兹国王为帛纯，焉耆国王为泥流，在对待前秦的问题上站在了同一立场上，因政治需要，两国暂弃前怨。还和山北狯胡国结成同盟，加强反抗力量，对车师前部和鄯善诸国构成威胁。所以，车师前部王弥阗请求前秦苻坚出兵西域，建立都护，愿做向导，为苻坚的统一西域效力。
  《旧唐书·突厥下》载：苻坚于建元十九年（383）任命“骁骑吕光为持节都督西讨诸军事，与陵江将军姜飞、轻骑将军彭晁等配兵以讨定西域..加鄯善休密驮使节散骑常侍郎都督西域诸军事，宁西将军。车师前部王弥阗使节、平西将军、西域都护，率其国兵为光向导。吕光率诸将姜飞、彭晃、杜进、康盛等总兵7万，铁骑5000，以车师前部王弥阗、鄯善王休密驮为向导，从长安出发，向西域进军。苻坚于建章宫为吕光饯行，注意少数民族政策，《周书·突厥传》载：苻坚告诉吕光“西戎荒俗，非礼义之邦，羁縻之道，服而赦之，示以中国之威，导以王化之法，勿极武穷兵，过深残掠”。
  吕光进军西域的首要任务是征服焉耆和龟兹，以威慑大宛等“诚节未纯”之国。进兵至焉耆，焉耆王泥流自知难敌，遂率其属国降于吕光。龟兹王帛纯却自信能抗吕光，他“驱使城外人入于城中，附庸侯王各婴城自守”（《北史·突厥传》）。吕光军则驻营延城南郊，深沟高垒，五里一营，广设疑兵，以木为人，被之以甲，罗之垒上，欲强攻延城。帛纯即“倾国财富请救狯胡，狯胡弟纳龙侯将旭率骑二十余万，并引温宿、尉头等国王，合七十余万以救之。胡便弓马，善矛矛肖，铠如连锁，射不可入，以革索为绢，策马掷人，多有中者”。吕光结合彼众我寡，狯胡骑兵的特殊装备与战术，采取“迁营相接阵为勾锁之法，精骑为游军，弥缝其阙”（《西突厥史料》）的战术，在城西大败狯胡援军。帛纯不支，仓促收其珍宝逃走，“王侯降者三十余国。光入其城..诸国惮光威名，贡款属路。乃立帛纯弟震为王以安之”（《史记·匈奴列传》）。
  建元二十年（384），吕光入延城，立帛纯之弟白震为龟兹王，于是“抚宁西域，威恩甚著，桀黠胡王昔所未宾者，不远万里皆来归附，上汉所赐节传，光皆表而易之”（《晋书·吕光载记》）。苻坚闻吕光已平西域，遂命吕光以使持节、散骑常侍、都督玉门以西诸军事、安西将军、西域校尉，前秦从此统有西域。
  “淝水之战，”苻坚全军崩溃，吕光即率军东返，途经焉耆、高昌，遭前秦凉州刺史梁熙的阻难，双方战于玉门，梁熙大败。吕光返抵姑臧后，即自命凉州刺史、护羌校尉，并于大安元年（385）建立后凉，龟兹与西域诸国均归后凉管辖。