新疆维吾尔自治区图书馆

同治三年（1864），新疆各族群众掀起的武装斗争虽然基本推翻了清朝政府在新疆的主政地位，但却没有给新疆带来稳定和发展。参加斗争的民众，其成分虽然主要是下层贫苦的农民群众，但主导暴动的却主要是封建的民族宗教上层头目。清朝政府在各地的治理机构被推翻后，暴动者并没有在新疆建立起一个统一的新政权，一些民族与宗教上层头目乘机争权夺利，形成地方割据势力，相互征战，使新疆社会陷入更大的动荡和混乱。
  库车及其周围地区被热西丁和卓及其亲信控制。热西丁和卓原是清真寺的一名阿訇，民众斗争取得胜利时，被人从麻扎里拉出来从政，利用宗教影响获取了领导权。他自称“汗和卓”，是“穆氏（穆罕默德）圣人最伟大的后代、宇宙力量之主宰”。②热西丁和卓及其家族亲信掌握了库车地区的军政大权后，为扩大统治地盘，组成了两支军队，由库车向西攻占了阿克苏、乌什等地；向东攻占了布古尔、库尔勒、喀喇沙尔、吐鲁番等地。所谓“汗和卓”的军队进到哪里，杀戮抢掠之事就发生在哪里，给当地经济带来严重破坏。尤其对所谓的“异教徒”，即满、汉等族群众更是肆意迫害杀戮，造成非穆斯林群众的大批死亡。到同治三年（1864）底，“西起乌什、阿克苏，东迄吐鲁番、鲁克沁，都成了库车热西丁的统治地盘”，①形成了当时新疆最大的地方割据势力。
  伊犁、乌鲁木齐等地少数民族中的一些上层人物和官吏，在清朝政府治理机构瘫痪后，趁机建立割据势力。伊犁维吾尔、回族中的割据势力头目迈孜木杂特、肖开特、马万信均先后自称“苏丹”，争权夺利，争斗不止，在造成人员大量伤亡的同时，经济生产也遭到极大破坏。乌鲁木齐地区的“清真王”妥得璘摧毁了清朝政府在乌鲁木齐的治理机构后，形成割据一方的地方势力，并不断扩充地盘，还与热西丁和卓争夺吐鲁番，派兵到伊犁干预“苏丹”之间的内讧，同样给这一地区带来了严重的人员伤亡和经济破坏。
  喀什噶尔、英吉沙尔、叶尔羌、和阗等地区，在库车民众暴动影响下，原清朝官吏、宗教头目等纷纷占地为王，形成割据。同治三年（1864）六月，英吉沙尔原清军绿营中营守备蓝春发、喀什噶尔中营把总王得春等驻军头目，联合当地回民先后起事。喀什噶尔白山派宗教头目托合提·马木提乘机占据喀什噶尔回城（今喀什市）称王。不久，塔什密里克（今疏附县南）阿奇木伯克布鲁特（柯尔克孜）头目思迪克率兵进攻，击败托合提·马木提，占领喀什噶尔回城。和阗阿奇木伯克海孜那奇在拜城任阿奇木伯克，在混乱之中经阿克苏潜回和阗，勾结从麦加朝觐归来的宗教人士哈比布拉，大肆杀戮“异教徒”，对信仰伊斯兰教的回族也不放过，建立“帕夏”割据政权。叶尔羌城内有暴动回民、阿奇木伯克尼牙斯的势力与清朝官兵等三股势力相互鼎立。这些割据势力派系不一、互相混战，社会动荡。喀什噶尔等地有大量浩罕商人，他们勾结地方伯克、阿訇，唆使其里通外国，联名写信给浩罕头目，提出浩罕出兵袭击喀什噶尔，驱逐思迪克。思迪克则派属下金相印去浩罕迎请和卓后裔，结果造成中亚浩罕汗国军官阿古柏挟持和卓后裔布素鲁克对新疆的入侵，给新疆各族群众带来更大灾难。
  因此，在新疆各地反对清朝政府治理的武装斗争过程中，由于历史的局限性和时代的局限性，各地群众斗争的领导权很快被一些民族宗教上层头目所控制，其斗争的矛头也由原来反对清朝当局扩大到不同民族和信仰不同宗教的一般群众身上，从某种意义上变成了不同民族之间的仇杀，结果是不少无辜的各族群众死于非命。在这几年动乱中，首先遭到重大损失的是满、汉等族军民。特别是在北疆原来满、汉族军民居住比较集中的伊犁、乌鲁木齐地区，人口损失更为严重。据统计，满、汉族军民在这次动乱中死亡人数可能超过20万，另有约10万以上的人被迫逃亡。①与此同时，新疆各地在战乱中城市被毁，土地荒芜，给新疆经济带来严重的破坏。②

　《伊米德史》（上册），1960年汉译本，第94页。;　新疆社会科学院历史研究所：《新疆简史》（第二册），新疆人民出版社，1979年，第125页。;　乾隆朝末年时，伊犁地区的满、汉族军民人数已经接近5万，乌鲁木齐地区满、汉族军民人数已经在10万以上。到同治初年，整个北疆地区的满、汉族军民人口总数应该在30万以上。在这次动乱中，满族人口丧失90%以上，汉族人口死亡、流散也在80%左右。这方面的具体情况，可以参阅齐清顺《：1759—1949年：新疆多民族分布格局的形成》，新疆人民出版社，2010年。;　关于对同治三年（1864）新疆各地、各族农民群众反对清朝统治武装斗争的性质、作用、影响等，过去已经有不少文章著述专门进行过叙述和讨论，这里不再做过多的叙述。至于对新疆经济所造成的严重破坏，后面还要讲到。