陇南徽县图书馆

两晋南北朝是个战乱的年代，嘉陵江流域亦是战乱四起。公元263年，曹魏灭汉，265年，司马炎篡魏，建立起晋朝，史称西晋。司马炎加强了对巴蜀地区的控制，充分利用该地区占据长江上游的有利位置，把这里作为征讨东吴的重要战略基地。咸宁五年（279）至太康元年（280）的伐吴战争中，巴蜀军队也起到了决定性的作用。
  晋武帝司马炎死后，惠帝继位，惠帝昏庸愚痴，各地流民、少数民族纷纷起兵反晋。李特、李雄父子以入蜀就食的六郡流民为主要力量，逐步消除西晋在巴蜀地区的军事力量，割据巴蜀，建立成汉政权。李雄称成都王后，不断对外用兵，开疆拓土，整个嘉陵江流域几乎全部囊括在成汉政权的统治之下。永和二年（346）十一月，东晋大将桓温自长江逆流而上伐蜀，李势投降，成汉政权灭亡。
  东晋梁州刺史司马勋企图割据益州，于东晋哀帝兴宁三年（365）反叛，率兵入剑阁，攻占涪城（今绵阳），围成都，但荆州刺史溯汉水而上，直捣司马勋的老巢，司马勋兵败。
  就在梁、益二州相继发生变乱的时候，以关中为根基的前秦政权日益强大，于太和六年（371）攻取了嘉陵江上游的仇池国（今甘肃省东南部的西和县、成县、文县一带），后于宁康元年（373）分两路大举进攻巴蜀，一路攻汉中，一路攻剑阁，剑阁攻克后，引兵南向，遂克成都。前秦统治巴蜀时期，曾发生过几次巴蜀士族势力反抗前秦统治的战争。直至淝水之战，前秦大乱，东晋在嘉陵江流域发动攻势，收复梁州、益州，梁、益又重新纳入东晋的版图。之后在巴蜀地区又发生了谯纵之乱，东晋政府前后两次西征巴蜀，主要作战区域也在嘉陵江中下游地区。