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明朝的战乱主要有明初的“靖难之变”②，明朝中期的叶宗留、邓茂七起义，刘通、李原起义和刘六、刘七等农民起义，以及明末历时18年的农民大起义。明代的连绵战乱，使大陆许多士民逃入海南岛避难谋生。例如：
  徐辉，明太祖朱元璋时任官。洪武三十一年（1398年）朱元璋死后，以皇太孙朱允炆继帝位（即明惠帝），年号建文，用齐秦、黄子澄的计划削藩，以加强中央集权。朱元璋第四子燕王朱隶打着“清君侧”的旗号，起兵靖难，各地也叛乱起兵。徐辉不愿意参加平息叛乱，因此失去官位爵位。先是避乱逃到福建莆田县，不久又与儿子徐迁鼎等全家人渡琼，定居于琼山县北洋地下沟村。
  明洪武五年（1372年），元代雷州太守邓弼4个曾孙邓仲仁、邓仲义、邓仲礼、邓仲智等，为避乱相率由雷州渡琼州，分别落籍定安和澄迈县。
  沈翥者，明代曾在广西任官，后避乱渡琼，落籍琼山县府城甘蔗园村。
  彭元钜，原籍江西吉水县，明代万历年间（1573—1619年）避乱渡琼，落居文昌县城。
  钟迟，江西庐陵县人，其父曾任文昌县仓大使③，后来其父回原籍。洪武二十四年（1394年），钟迟与其母落居文昌县铺前。
  莫蓁，广东吴川县一名儒士，明永乐初年（1403—1404年），渡琼落居崖州水南村。
  严歧淑，福建长泰县人，明嘉靖年间（1628—1644年）因家乡动乱，歧淑与詹、叶、李等姓亲朋相邀渡琼避乱，落居文昌县白延兰田村。
  侯全，祖籍福建长泰县，崇祯年间（1621—1644年）南迁渡琼，落居文昌县的延元峰村。
  洪芳位，其父洪邦正在明代任职天卫军，明朝时渡琼定居文昌县白延下酋村。
  尤昌，原籍广东顺德，明代避乱渡琼落籍文昌县城霞洞村。
  祝高，原籍福建莆田县，明代避乱渡琼谋生，后落籍文昌县。
  孔承思，明正德三年（1508年）从广东邓岗乡迁来海南经商，落居会同县文子村（今属琼海市）。另有孔宏集、孔宏林兄弟，原籍广东南海人，也于此时入琼经商，落居琼山县大林群上村。
  李兴衙，原籍福建，于明末同詹、施、严、叶、黎、王六姓亲友，由闽避乱入琼经商，后来落居文昌县官坡村。
  黄旺佑、黄添佑两兄弟，原籍福建，明代来琼经商，落籍万宁县；还有福建人黄伍荫，为商务迁琼，入籍文昌县。