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是全县防汛抗旱指挥机构，由县委分管副书记任总指挥、县政府分管副县长、县人武部部长、县水电局局长任副总指挥，有关单位负责人为成员。指挥部下设办公室于县水电局，负责日常工作。各乡镇分别成立由乡镇长任指挥长的乡镇防汛抗旱指挥机构，下设安全保卫、交通物资、医疗救助、抗洪抢险等应急分队。1999年3月，为做好县城防洪抢险工作，成立县城防洪抢险团，下设7个营，精选150名民兵组成抢险应急分队。2001年4月，县防汛抗旱指挥部办公室由非常设机构改为全额拨款事业单位。