主要植物境内有高等植物280科800余属3400余种,主要有: 乔木类杉、马尾松、三尖杉、红豆杉、青钱柳、枫杨、多穗柯、钩楮、罗浮榜、鹿角榜、青稠、宁冈稠、 大果榆、莽草、樟、香樟、猴樟、油樟、黄樟、大叶樟、细叶香桂、黄檀、青檀、建楠、红楠、刨花楠、湘楠、標木、枫香、香椿、臭椿、樟叶械、拐枣、猴欢喜、杜英、湘极、山桐子、刺楸、泡桐、拟赤杨、青果栋、银杏、士杉、福建柏、柏木、杨梅、深山含笑、梧桐、多花山竹子、厚朴、木荷、银木荷、宁冈青冈、水青冈、苦楮、甜榛、木莲等。
灌木类园果化香树、茅栗、板栗、锥栗、小构树、琴叶榕、异叶榕、檀梨、紫花含笑、山胡椒、豹皮黄肉楠、乌药、长柄双花木、继木、野山楂、石楠、尖嘴林檎、多花蔷薇、金樱子、福建山樱花、云实、野花椒、 黄花远志、算盘子、叶底珠、金甘子、油桐、白背叶、山柳、虎皮楠、盐肤木、野漆树、构骨、山枇杷、毛冬青、长叶冻绿、云南勾儿茶、扁担秤、连蕊山茶、茶叶树、厚叶红山茶、油茶、厚皮香、檢木、芫花、毛瑞香、 莞花、结香、胡颓子、紫薇、石榴、通脱木、穗序鹅掌柴、树参、五加、刺五加、四照花、青芙叶、猴头杜鹃、 羊跚躅、杜鹃、岭南杜鹃、白花杜鹃、腺萼马银花、鹿角杜鹃、滇白珠、乌饭树、杜茎山、血党、百两金、米砂根、红凉伞、紫金牛、罗浮柿、山矶、华山矶、醉鱼草、红紫珠、牡荆、豆腐柴、大青、黄梔子、白马骨、虎刺、宁冈械、小宁冈械、南天竹等。
竹类毛竹、薯竹、麻竹、淡叶竹、紫竹、佛竹、方竹、硬头黄竹、龟甲竹(观音竹)、人面竹、木竹(实心竹)、苦竹、乌(墨)竹等。
藤本类山萎、薜荔、马兜铃、何首乌、小木通、钝萼铁线莲、大血藤、羊叶钱线莲、青牛胆、苍白秤钩风、金钱吊乌龟、轮环藤、南五味子、冷饭团、瓜馥木、飞龙掌血、雷公藤、青风藤、蛇葡萄、獄猴桃、毛花獄猴桃、多花獄猴桃、钩藤等。
草本类蛮菜、草珊瑚、土牛藤、八角莲、酢浆草、竹节参、菟丝子、马鞭草、半枝莲、益母草、绞股蓝、艾蒿、半夏、药百合、七叶一枝花、蕨等。
乡土树种杉为主要乡土树种,又名杉树,境内各地有分布。主要产区有黄坳、下七、长坪、东上、茅坪、大陇、柏露等乡和大井林场、朱砂冲林场。2008年,全市杉树面积3.87万公顷,占全市林地面积 36. 50% ;活立木蓄积345. 30万立方米,占总蓄积量的42. 91%。
马尾松遍布全境。2008年,马尾松面积0.41万公顷,占林地总面积的3. 80% ;活立木蓄积量 33. 10万立方米,占总蓄积量的4. 11% ₒ 阔叶树主要有樟、楠木、枫树、木荷、拟赤杨、標木、栋类、榜类、椿类等,境内各地有分布。2008 年,全市阔叶树面积3. 31万公顷,占林地总面积的31. 10% ;活立木蓄积量382. 30万立方米,占总蓄积量的47. 52%。毛竹境内各地有分布。2010年,全市竹林面积1.40万公顷,占林地总面积的13.21%;毛竹蓄积量2576. 38万根。
油茶树又名木梓树、茶梓树,其果实是一种木本油料。寒露节采摘的为寒露籽,也叫细茶籽;霜降节采摘的为霜降籽,也叫大茶籽,寒露籽产油率高于霜降籽。产地遍及全市各乡、镇。东上乡蔡家田、七里船、牛塘里一带有红花油茶分布,又名厚叶红山茶,是一种特有名贵油茶,始花期10月,花大艳红,单花能开7天,群体花期长达6个月,是一种木本油料兼观赏树种。
特用林以茨坪为中心的大小五井,桐木岭、白银湖、朱砂冲、荆竹山、五指峰、蛤蟆落井,以及小溪洞、黄坳乡、长坪乡等3地部分区域,划入自然保护,成为风景名胜区的佳景和发展旅游事业的重要资源。
珍稀植物国家一级保护树种银杏、冷杉、南方红豆杉、蕴菜4种。
国家二级保护树种杜仲、福建柏、长柄双花木、野茶树、香果树、篦子三尖杉、白豆杉、独花蓝、连香树、伞花木、厚皮香、水松、鹅掌楸、香木莲、观光木、金钱松、永瓣藤、秤锤树、粗樨等36种。
国家三级保护树种沉水樟、半枫荷、红花木莲、凹叶厚朴、天竺桂、穗花杉、白桂木、华南桂、领春木、黄山木兰、厚朴、小花木兰、长喙厚朴、闽楠、楠木、青檀、紫基、银鹃树、红椿、南方铁杉、乐东木兰、 天师栗、翠柏等。
国家三级保护竹种方竹、木竹、紫竹。
江西省保护树种竹柏、华檀梨、紫花含笑、三尖松、南方红豆杉、野核桃、红楠、猴欢喜、厚叶红山茶、紫玉兰、湘楠、阿丁枫、光皮桦、饭甑稠、多穗柯、白玉兰、金叶含笑、野含笑、豹皮樟、大果马蹄柯、黄檀、黄连木、江西杜鹃等。
特有植物井冈山紫果械、井冈山獄猴桃、井冈山楮、井冈山卫矛、井冈山寒竹、井冈山冬青、短柄香冬青、井冈山绣线梅、井冈山杜鹃、小溪洞杜鹃、粗柱杜鹃、白花映山红、伏毛杜鹃、厚叶照山白、背绒杜鹃、腺果悬钩子、大节赤竹、井冈山唐竹、井冈山厚皮香、井冈山葡萄、资源冷杉、江西山柳、井冈山毛蕨、井冈山耳蕨、井冈山剑蕨、井冈山凤丫蕨等26种,其中种子植物22种,蕨类植物4种,这些植物在井冈山发现、命名或其模式标本采自井冈山。对研究全球植物进化与区系起源具有重要的价值。
引进树种美国湿地松、火炬松、金钱松、黄山松、雪松、五针松、龙柏、地柏、花柏、香柏、竹柏、钱柏、樱络柏、法国梧桐、水杉、重阳木、喜树、梓树、楸树、樱花、白玉兰、桜树、洞辨含笑、白花泡桐、油橄榄、冬桃、海桐、葡萄桐、糠树等。
古树名木茅坪古枫茅坪乡茅坪八角楼前近河边,生长着1株高35. 00米,胸径1.27米的古枫。当年毛泽东率中国工农革命军驻茅坪时,常坐在该树下的大石上看书或休息,该树冠幅17. 60 x 19. 20米、树龄550余年。
黄洋界荷树胸径(70厘米处分叉)0. 52,0. 47米,高12. 00米,冠幅12. 00 x 15. 00米,树龄150余年。井冈山斗争时期,朱德军长挑粮上山在此树下休息。
河西陇老井冈村古银杏胸径2. 32米,高35. 00米,冠幅18. 00 x 16. 00米,树龄1000余年。
河西陇老井冈村三尖杉胸径0.96米,高15. 00米,树龄1000余年。
下角崇南方红豆杉胸径1. 30米,高21. 00米,冠幅10. 00 x 15. 00米,树龄1000余年。
湘洲北坑乳源木莲胸径1. 50米,高27. 00米,冠幅10. 00 x 15. 00米,树龄500余年。
湘洲村乐昌含笑胸径1.43米,高29. 00米,树龄400余年。
河西陇观光木胸径0.60米,高25. 00米,珍稀树种。
行洲村苦楮胸径3.00米,高30. 00米,冠幅15. 00 x 15. 00米,树龄2000余年。
黄坳乡樟树胸径3. 41米,高28. 50米,树龄1000余年。
下七乡洪坪村坝尾竹柏胸径0. 97米,高21. 00米,冠幅10. 00 x 20. 00米,树龄800余年。水坳罗汉松东上乡水坳村圣帝殿前,并排生长着两株古罗汉松,树高10.00米,胸径1. 53米, 冠幅12. 00 x 12. 00米,树龄1000余年。
东上浆山古银杏东上乡浆山圣帝殿前公路左边山上1株古银杏树,高21. 00米,胸径1. 19米, 冠幅15. 00 X16. 00米,树龄1150余年。
柏露蔡下银杏胸径0. 89米、高16. 50米、冠幅12. 00 X 13. 00米、树龄800余年。
茅坪象山庵毛泽东旧居古银杏胸径0.67米、高18.00米、冠幅14.00 x 15.00米、树龄500 余年。
新城城口古樟新城镇城口村后山上1株古樟高26. 50米,胸径2. 66米,冠幅27. 80 x29.00 米,树龄1200余年。
下浆古厚朴树东上乡下浆村小河边一株古厚朴树,高26.51米,胸径0.92米,冠幅9.00 x10. 00米,树龄500多年。
茶源楠木茅坪乡茶源村口生长着1片楠木树林,其中最大的1株高25. 8米,胸径1.22米,冠幅17. 50 x 18. 51米,树龄800余年。
新城镇政府侧旁厚壳树胸径0. 78米,高16. 50米,冠幅9. 30 x10. 50米,树龄360余年。
大鼻里白玉兰大陇乡源头村大鼻里村小溪旁1株白玉兰,高19.51米、胸径1. 10米,冠幅 14. 60 x 18. 50 米,树龄 550 余年。
蔡家田香椿东上乡蔡家田村一株香椿树,胸径0. 74米,高21. 50米,冠幅11.00 x 12. 50米,树龄250余年。