该校前身为1958年创办、1962年停办的吉安医学院。1978年8月,江西省革命委员会批准在井冈山地区卫校(后改为吉安卫校)的基础上,成立江西医学院井冈山分院。实行分院与卫校合署办校,分院隶属省卫生厅和井冈山地委、行署双重领导。1980年,更名为“江西医学院吉安分院”。1993年4月,经国家教委批准,在江西医学院吉安分院的基础上,成立井冈山医学高等专科学校,仍然与吉安卫校合署办校。1994年,吉安行署决定吉安卫校隶属于井冈山医专。
学校坐落在吉安市吉福路23号(原吉安县委大院),占地面积78670平方米(118亩),建筑面积 62910平方米,固定资产总值4183万元。附属医院占地面积8570平方米,建筑面积22895平方米,固定资产总值930万元。建校20多年来,投资2000多万兴建了教学楼、实验楼、图书馆、教工宿舍、学生公寓等教学、生活用房上百幢。
2000年学校内设机构有:党委下辖6个部委,行政管理有20个处室,教学管理有2个中心、4个系、 21个教研室。学校的民主党派组织有农工民主党支部、民主同盟支部和民革会员、九三学社社员。
分院创办时期,由于师资、设备等限制,学校只开设中医、西医等少数专业。1993年成立医专后,学校调整专业结构,拓展专业方向。1996年,增设麻醉医学、高级护理专业;1997年,增设医学工程技术专业;1999年,又增设口腔医学专业。2000年,井冈山医专设有临床医学、中西医结合医学、麻醉医学、口腔医学、护理学、医学工程技术6个专业,已经形成了医护结合的医学、护理、医学技术、医学工程4大专业群体的新格局。
学校教学设施与临床实习基地从建校以后经历了从无到有、从简陋到现代化的发展过程。分院时期,各类实验室20余间;1992年,把单独性实验室进行调整、合并,建立了综合性的实验中心。1994年, 建立了校内闭路电视教学系统。1995年,建立计算机中心,拥有高档次电脑100多台。1996年,筹建了现代语音室,配备了多媒体电脑主控室和64个隔音语音座位。1998年,建立了计算机主控室,全面组建网络教学。是年,还建成了医疗器械维修中心,填补了吉安地区一项空白;建立了专门的解剖标本陈列室和中草药标本陈列室。实验中心承担全校大、中专师生23门学科的全部教学实验和科研实验任务, 每年开出实验近4000课时。同时,学校还在全区各县(市)综合医院、外地区的市级医院或省、地三级以上医院进行毕业临床实习。至2000年,在区内外共建有实习教学基地46个。
该校一贯重视和加强师资队伍建设,拥有一支高素质的师资队伍。2000年,全校教职工464人,其中专任教师109人(不含教辅人员),正高职称5人,占专任教师总数的4. 6% ;副高职称20人,占 18.3% ;中级职称34人,占32%。硕士研究生、本科生、大学普通班学历的教师为数不少。
吉安高等医学教育创办,经历前后两段( 1958 - 1962,1978〜2000年)。26年中,共招收专科学生 3185人,其中医疗专业招收人数最多,达2183人;共培养本科毕业生36人,专科毕业生2703人。 1961 ~ 1962年,井大医学院医疗专业的毕业生中就有33人获得副高以上职称。2000年,毕业学生292 人,招收新生479人,在校学生1132人。
该校贯彻《中共中央关于加强社会主义精神文明建设实施纲要》、《中共中央关于进一步加强学校德育工作的意见》,围绕育人目标,造就合格人才,大力加强学生思想政治教育工作。通过课堂教学、讲座、 宣讲、读书读报、社会调查和开展课外活动等形式,对学生进行四项基本原则教育、马列主义世界观和人生观的教育、爱国主义和革命传统教育、专业思想教育、社会主义法制教育和医风医德教育。学校还在教师中积极开展“讲师德、铸师魄、练师能的教书育人、为人师表、做文明教师”活动;在学生中开展“文明礼貌、勤奋好学、助人为乐、遵纪守法、做文明学生”的活动。通过以上教育活动,全校师生的思想道德修养、科学文化水平、民主法制观念显著提高,学风、教风、校风显著好转。
建校以后,学校不断深化教学改革,加强教学管理。逐年建立、完善教学管理机构,形成了校级、部 (系)级和科室级管理的三级管理机制。1993年以后,学校普遍推行目标教学,以适应生物医学模式向生物——心理——社会医学模式的转变。1997年开始,学校全面启动了课程建设工作,改革教学内容, 修订各专业教学计划,调整教学时数,加强人文科学和实践环节的教学。1998年,该校根据教育部《高校教学管理工作规范》,明确了各年级、各专业教学人员岗位责任和教学运行管理办法。同年,开始开设选修课程。学校还组织学生进行课间见习和毕业临床实习,每年召开一次实习医院毕业见习工作协调会和临床实习教学研讨会,并进行临床教学评估。2000年,该校有区内外教学医院34个(其中区外17 个),聘任兼职教师519人,其中教授、副教授168人。
学校体育工作主要是抓紧体育课教学和组织师生的业余体育活动。:1986年以后,学校坚持体育达标和体育教学相结合,积极开展《国家体育锻炼标准》的测试,学生体育达标率达98%。学校还组队参加省、地一些体育比赛,曾获1995年全省高校第四届运动会撑竿跳高第一名和地区大中专篮球赛第一名。
学校遵照“科技兴国”战略,加强了对科研工作的领导,成立了科研所,制订了《“九五”科技发展规划》和《学术活动管理规定》等规章制度。科研经费连年增加:1993、1994年每年约0.5万元,1995.1996 年每年约5万元,1997,1998年每年约10万元。学校每年还拨出专款用于学术交流。1978年至今,组织科技人员参加国家、省、地级和校际学术交流会议500多人次;参加交流的学术论文300余篇,其中有 200多篇获奖。学校邀请省内外20多位教授、专家、学者来校进行学术交流。学校创办以后,科研成果层出不穷:井冈山大学医学院时,全校共有737个科研项目,其中一部分医学项目通过省、地有关部门鉴定后参加了全区和全省展览。医专成立后科研成果更加丰富。左永昌主持的“应激状态下IGL-I的免疫调节机制”被列为国家级研究课题;温永顺主持的“中草药对淋病滴虫感染的治疗研究”和尹质明主持的一贴安’治疗原发性痛经”被列为省级研究课题。郭剑主持的“鼻内筛前神经切断术治疗常年性鼻炎的临床应用”和贺熙然主持的“闭式胆汁回输装置的临床应用”两个课题分别通过省科委鉴定,并获地区科技进步三等奖;彭中朝主持的“微丝虫幼血片生染法”和张愈延主持的“现代白内障外摘除加后房型人工晶体植入式的应用研究”两个课题分别通过地区科委鉴定,并获地区科技进步三等奖;朱晓云、周绍光主持的“小儿液体疗法”和古蓉芳主持的“绣花针乙肝散治疗乙型肝炎的临床研究”两个课题也分别通过了地区科委的鉴定,并获地区科技进步三等奖。