木竹运输有水运、陆运两种。
20世纪70年代前,区内木竹以水运为主。将竹木扎成毛排利用小河小溪下运到赣江边,然后改扎成抖子大排连片运到各地销售。70年代以后,很多河流小溪拦河筑坝,兴建电站,故大力发展修建林区公路,逐步由水运改为陆运。1973年分宜至永新的铁路建成,安福、永新、宁冈部分木材从铁路运出。 1997年京九铁路开通,沿途的新干、峡江、吉水、吉安县、泰和、万安等县的部分木材从京九铁路运出。 1985年木材开放,木材均为小批量调销,木竹均由汽车、火车、船运出地、出省,扎排水运基本取消。
陆运陆运下山又叫集材,即把归楞的木材从山场运到小溪边或公路边,集中待运。集材方式有人力肩运、拖运、滑道、木轨道、胶轮车、架空索道等。凡山高地陡的山场,主要用滑道流槽或架设空索道运;地势较平缓的山场,修建林道、板车道、用胶轮车运下山。
到1999年,区内林区公路共有439条,全长3185.8千米,其中由林业部门自行投资修建的2118.7 千米。由于林区公路多数建在偏远山区,坡陡弯急,雨水冲刷严重,建路等级低,三级以下标准的占 73.5%左右,路况完好率难以保持。特别是1980年以前,公路养护管理一无可靠的经费来源,二无专业护路机构和人员,三无护路技术规程和设备,所以对1980年以前自建自养的1482. 8千米的林区公路,弃养里程约占30%。各县(市)林业主管部门和各林场(站),对急需运行的公路,仍抽调生产工人或请民工临时养护,护路经费列入木竹生产成本开支。同时,林区的路政管理困难,如农民傍路取土,依山炸石,断路挖沟,占地建房,毁坏公路设施,盗窃养路材料等现象时有发生。虽在当地政府的支持下,多数得到妥善解决,但此类事情屡禁不止。
1961年7月,江西省农林垦殖厅森林工业局决定,正式组建吉安林业汽车分队,配备汽车5辆,驾驶员7人。到1977年底,发展到有运材汽车147辆,职工390人。19力年12月19日,井冈山地区农林垦殖局根据江西省农林垦殖局通知精神,将林业汽车第三营改称江西林业汽车运输公司井冈山地区分公司,并将原三营91辆汽车,80名驾驶员,123名修理工,除留下设在泰和上田的为分公司直属汽车队19 辆汽车,25名驾驶员,13名修理工外,其余连车带人下放到各县农林垦殖局管理,成立遂川、安福、吉安、 泰和、永丰、吉水、新干、峡江、万安、永新10个县车队,宁冈县未成立车队,井冈山管理局林业车队仍归省管。到1982年井冈山林业汽车队也划归吉安地区林业汽车运输分公司管理。到1990年底,全区共有林业车队12个,拥有运材汽车113辆,职工542人。从建队到1990年,货运总量401.9万吨,运输木材 346.34万立方米,货运周转量31623. 32万吨千米,运输收入5975. 38万元,获纯利335.45万元。到 1999年,除新干县、井冈山市林业车队还保留,其余均退岀、解散,木材运输任务由私有车辆承担。
水运全区江河溪水,纵横交错,水资源丰富,是历史上木材运输的主要渠道。木竹排运里程达 1638千米,其中小溪源头流放单排里程261千米。20世纪60年代以前,每年水运木材达30万立方米, 毛竹100余万根,占总运输量90%以上。各支流和小溪多数水面窄,礁石多,水位落差大。从1954年起,森工部门大力整治河道,除疏河炸礁外,还兴建永久性水坝、排筏道等水运工程,改善了水运条件。
1950年,吉安木材分公司设立神冈山转运站,有水运职工70人,以后陆续增加到300多人,编为两个工队。1955年,专区在泰和县马家洲进行河道运输民主改革试点,尔后全区铺开了排运工会民主改革,整顿了排运工人队伍。对政治历史清楚、身体强壮、水运技术好的民间排工,吸收为森工企业水运工人。从此,遂川、安福、吉安、永新、宁冈、万安、泰和、井冈山等县(市)先后成立了水运队,负责木竹扎运。 对小溪和一部分支流扎运,仍靠社会临时排工。1958年,神冈山转运站改为吉安专区贮木场,承担赣江的木竹排运、贮存和接运上游县的木竹。70年代,以生产松杂木为主的吉水、永丰、峡江、新干等县,也相继成立了贮木场或转运站,建立和配备了水运队伍。70年代末除莲花县和吉安市外,各县都有木竹专业水运队伍。
1985年后,木材放开经营,省内外用材单位都直接到各产材县购买木竹,用汽车、火车运输代替扎排水运。