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1988年至1990年12月，县人大常委会的办事机构有：办公室、法制工作委员会、经济工作委员会、教科文卫工作委员会、侨务工作委员会、农村工作委员会。1991年2月26日，县第十一届人大常委会第一次会议决定增设城乡建设工作委员会。1993年11月9日，市第十一届人大常委会第十九次会议决定增设代表联络工作委员会，至此，市人大常委会下设办事机构共有1个办公室和7个工作委员会。1997年，制定市人大机关机构改革方案，明确机关内设机构（仍为1个办公室7个工作委员会）及其职责。1999年，市人大常委会主任会议讨论后，就机关内设机构的职责进一步明确。2006年5月29日，根据《中华人民共和国地方各级人民代表大会和地方各级人民政府组织法》《中共福建省委印发〈关于福建省地、市、县、乡（镇）人大机构改革的意见〉和〈关于福建省地、市、县政协机构改革的意见〉的通知》《中共晋江市委关于进一步加强人大工作的实施意见》及《中共晋江市委办公室、晋江市人民政府办公室关于制定市级党政机构“三定”规定的通知》精神、《中共晋江市委办公室关于印发〈晋江市人大常委会机关机构改革方案〉的通知》，确定市人大常委会机关机构设置和主要职责。
  市人大常委会机关设正科级办事机构1个：办公室，正科级工作委员会7个：人事代表委员会、内务司法委员会、农村经济委员会、财政经济委员会、教育科学文化卫生委员会、华侨民族宗教委员会、环境与城镇建设委员会。