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一、领导机构
  （一）中共晋江县第六届委员会
  1987年11月，中共晋江县第六次代表大会选举产生中共晋江县第六届委员会，任期1987年11月至1990年11月。
  1988年，县委副书记洪辉煌、黄源水、朱明先后调离晋江另任；同年12月，上级任命县委常委许龙烈为副书记。1989年7月，任命吴汉民为县委常委、副书记；10月，任命常委洪泽生为县委副书记；12月，调陈永恩任县委常委。1990年9月，时任中共泉州市委常委、晋江县委书记的尤垂镇调任泉州市委宣传部部长，上级任命施永康（时任晋江县委副书记、县长）为晋江县委书记，何锦龙为常委、副书记，杨逸蓉为常委；同年10月，县委副书记洪泽生调离晋江另任。
  书记：尤垂镇（1987.6—1990.9） 施永康（1990.9—1990.11）
  副书记：施永康（1988.1—1990.9） 朱明（1984.10—1988.12） 洪辉煌（1987.1—1988.11）
  黄源水（1987.9—1988.11） 许龙烈（1988.12—1990.11） 吴汉民（1989.7—1990.11）
  洪泽生（1989.10—1990.10）何锦龙（1990.9—1990.11）
  常委：尤垂镇（1988.7—1990.9） 施永康（1987.9—1990.11） 朱明（1984.10—1988.12）
  洪辉煌（1985.5—1988.11） 黄源水（1987.1—1988.11） 吴乌秀（女，1988.1—1990.3）
  林进德（1983.11—1990.11）王恭庭（1987.9—1990.11） 许龙烈（1987.9—1990.11）
  黄长江（1987.9—1990.11） 吴汉民（1989.7—1990.11） 洪泽生（1989.7—1990.10）
  陈永恩（1989.12—1990.11）何锦龙（1990.9—1990.11） 杨逸蓉（女，1990.9—1990.11）
  （二）中共晋江县（市）第七届委员会
  1990年11月24日，中共晋江县第七次代表大会选举产生中共晋江县第七届委员会，任期1990年11月至1993年12月。有27人当选县委委员；3人当选县委候补委员。
  同日，中共晋江县第七届委员会第一次全体会议选举产生中共晋江县第七届委员会常务委员会，9人当选县委常委，施永康当选县委书记，何锦龙、许龙烈、吴汉民当选县委副书记。
  1991年12月，上级任命范洪力为县委常委（挂职）。1992年2月，上级任命常委陈章进为县委副书记；县改市后，1992年11月，上级任命王志泉为市委常委；12月，任命江作梁为市委常委、副书记（挂职）。1993年5月，任命施并章为市委常委；11月，任命常委杨逸蓉为市委副书记；12月，市委常委范洪力挂职期满离任。
  1992年3月6日，国务院批准晋江撤县建市，5月1日举行撤县建市庆典。自此，中共晋江县委员会改为中共晋江市委员会，施永康等人改任中共晋江市委相应职务。
  书记：施永康（1990.11—1993.12）
  副书记：何锦龙（1990.11—1993.12） 吴汉民（1990.11—1992.7）
  许龙烈（1990.11—1993.3） 陈章进（1992.2—1993.12）
  江作梁（挂职，1992.12—1993.12） 杨逸蓉（女，1993.11—1993.12）
  常委：施永康（1990.11—1993.12） 何锦龙（1990.11—1993.12）
  许龙烈（1990.11—1993.3） 吴汉民（1990.11—1992.7）
  王恭庭（1990.11—1993.12） 林进德（1990.11—1993.12）
  陈永恩（1990.11—1993.12） 杨逸蓉（女，1990.11—1993.12）
  陈章进（1990.11—1993.12） 范洪力（挂职，1991.12—1993.12）
  江作梁（挂职，1992.12—1993.12） 王志泉（1992.11—1993.12）
  施并章（1993.5—1993.12）
  （三）中共晋江市第八届委员会
  1993年12月12日，中共晋江市第八次代表大会选举产生中共晋江市第八届委员会，任期1993年12月至1998年11月。有30人当选市委委员，4人当选市委候补委员。同日，中共晋江市第八届委员会第一次全体会议选举产生中共晋江市第八届委员会常务委员会，11人当选市委常委，施永康当选市委书记，何锦龙、陈章进、江作梁、杨逸蓉等4人当选市委副书记。
  1994年12月，市委副书记江作梁挂职期满离任。1995年4月，市委副书记何锦龙调离晋江另任；同月，上级任命龚清概为市委常委、副书记；5月，任命梁金祥为市委常委（挂职）；1995年6月，市委副书记杨逸蓉调离晋江另任；7月，任命常委施并章为市委副书记；12月，任命吕炜民为市委常委。1996年1月，上级决定时任中共泉州市委副书记、晋江市委书记的施永康不再担任晋江市委书记一职，任命朱明为晋江市委常委、书记；1996年3月，任命熊皓为市委常委、副书记（挂职）。1997年1月，市委副书记熊皓挂职期满离任；2月，上级任命陈觉晓、周伯恭为市委常委。
  书记：施永康（1993.12—1996.1） 朱明（1996.1—1998.11）
  副书记：何锦龙（1993.12—1995.4） 陈章进（1993.12—1998.11）
  江作梁（挂职，1993.12—1994.12） 杨逸蓉（女，1993.12—1995.6）
  龚清概（1995.4—1998.11） 施并章（1995.7—1998.11）
  熊皓（挂职，1996.3—1997.1）
  常委：施永康（1993.12—1996.1） 何锦龙（1993.12—1995.4）
  陈章进（1993.12—1998.11） 江作梁（挂职，1993.12—1994.12）
  杨逸蓉（女，1993.12—1995.6） 施学长（1993.12—1997.2）
  林进德（1993.12—1998.11） 陈永恩（1993.12—1998.11）
  施并章（1993.12—1998.11） 丁聪枝（回族，1993.12—1998.11）
  陈长庚（1993.12—1998.11） 龚清概（1995.4—1998.11）
  梁金祥（挂职，1995.5—1998.11） 吕炜民（1995.12—1998.11）
  朱明（1996.1—1998.11） 熊皓（挂职，1996.3—1997.1）
  陈觉晓（1997.2—1998.11） 周伯恭（1997.2—1998.11）
  （四）中共晋江市第九届委员会
  1998年11月19日，中共晋江市第九次代表大会选举产生中共晋江市第九届委员会，任期1998年11月至2003年11月。有30人当选市委委员，6人当选市委候补委员。同日，中共晋江市第九届委员会第一次全体会议选举产生中共晋江市第九届委员会常务委员会，10人当选市委常委，朱明当选市委书记，龚清概、施并章、吕炜民、陈长庚等4人当选市委副书记。
  1998年12月，上级任命陈觉晓、马莲（挂职）、周龙隆为市委常委。1999年3月，任命吴清滨为市委常委。2000年8月，任命王景星为市委常委、副书记。2001年2月，任命罗云为市委委员、常委；8月，吴清滨任晋江市人民政府副市长，免去其市委常委职务；9月，市委常委陈贻萍调离晋江另任；10月，任命王远东为市委常委；11月，任命常委周伯恭为副书记。2002年5月，时任中共泉州市委常委、晋江市委书记的朱明调任中共泉州市委副书记，上级任命龚清概（时任晋江市委副书记、市长）为市委书记；7月，任命常委丁聪枝为市委副书记、陈健倩为常委，施并章任晋江市人大常委会党组书记，免去其市委常委、副书记职务；11月，市委常委周龙隆调离晋江另任，上级任命陈少华为市委常委。2003年3月，任命陈大庆为市委常委。
  书记：朱明（1998.11—2002.5） 龚清概（2002.5—2003.11）
  副书记：龚清概（1998.11—2002.5） 施并章（1998.11—2002.7） 吕炜民（1998.11—2003.11）
  陈长庚（1998.11—2003.11） 王景星（2000.8—2003.11） 周伯恭（2001.11—2003.11）
  丁聪枝（2002.7—2003.11）
  常委：朱明（1998.11—2002.5） 龚清概（1998.11—2003.11） 施并章（1998.11—2002.7）
  吕炜民（1998.11—2003.11） 陈长庚（1998.11—2003.11） 周伯恭（1998.11—2001.11）
  林进德（1998.11—2003.11） 丁聪枝（1998.11—2003.11） 陈贻萍（1998.11—2001.9）
  李建辉（1998.11—2003.11） 陈觉晓（1998.12—2003.11） 马莲（女，挂职，1998.12—2003.11）
  周龙隆（1998.12—2002.11） 吴清滨（1999.3—2001.8） 王景星（2000.8—2003.11）
  罗云（2001.2—2003.2） 王远东（2001.10—2003.11） 陈健倩（2002.7—2003.11）
  陈少华（2002.11—2003.11） 陈大庆（2003.3—2003.11）
  （五）中共晋江市第十届委员会
  2003年11月11日，中共晋江市第十届代表大会选举产生中共晋江市第十届委员会，任期2003年11月至2006年8月。有35人当选市委委员，6人当选市委候补委员。
  同日，中共晋江市第十届委员会第一次全体会议选举产生中共晋江市第十届委员会常务委员会，13人当选市委常委，龚清概当选市委书记，杨益民、王景星、周伯恭、丁聪枝、陈健倩等5人当选市委副书记。
  2005年6月，上级决定时任中共泉州市委副书记、晋江市委书记的龚清概不再兼任晋江市委书记一职，由泉州市委副书记李建国兼任晋江市委书记；10月，市委常委陈大庆调离晋江另任，上级任命连泉富为市委委员、常委。2006年5月，市委常委王远东调离晋江另任；7月，上级任命曾清金为市委委员、常委、副书记；免去周伯恭市委常委、副书记职务，随后任命其为中共晋江市政协党组书记；免去丁聪枝市委委员、常委、副书记职务，调离晋江另任。8月，李建国调任中共漳州市委委员、常委、副书记，上级决定晋江市委工作由市委副书记、市长杨益民主持；同月，任命杨益民为中共晋江市委书记。
  书记：龚清概（2003.11—2005.6） 李建国（2005.6—2006.8） 杨益民（2006.8—2006.8）
  副书记：杨益民（2003.11—2006.8） 王景星（2003.11—2006.8） 周伯恭（2003.11—2006.7）
  丁聪枝（2003.11—2006.7） 陈健倩（2003.11—2006.8） 曾清金（2006.7—2006.8）
  常委：龚清概（2003.11—2005.6） 李建国（2005.6—2006.8） 杨益民（2003.11—2006.8）
  王景星（2003.11—2006.8） 周伯恭（2003.11—2006.7） 丁聪枝（2003.11—2006.7）
  陈健倩（2003.11—2006.8） 曾清金（2006.7—2006.8） 李建辉（2003.11—2006.8）
  王远东（2003.11—2006.5） 陈少华（2003.11—2006.5） 陈大庆（2003.11—2005.10）
  洪于权（2003.11—2006.8） 朱新民（2003.11—2006.8） 高向荣（2003.11—2006.8）
  连泉富（2005.10—2006.8）
  （六）中共晋江市第十一届委员会
  2006年8月29日，中共晋江市第十一届代表大会选举产生中共晋江市第十一届委员会，任期由2006年8月开始。有33人当选市委委员，6人当选市委候补委员。同日，中共晋江市第十一届委员会第一次全体会议选举产生中共晋江市第十一届委员会常务委员会，9人当选市委常委，杨益民当选市委书记，3人当选市委副书记。
  2006年10月，上级任命李元巍、张永宁为市委委员、常委；11月，任命洪学谋为市委常委；12月，上级任命李建辉为市委委员、常委、副书记，王景星任市人大常委会党组书记，免去其市委委员、常委、副书记职务；2007年5月，市人武部政委连泉富退役，免去其市委委员、常委职务，上级任命叶荣宗为市委委员、常委。
  书记：杨益民（2006.8—）
  副书记：李建辉（2006.12—） 王景星（2006.8—2006.12） 陈健倩（2006.8—）
  曾清金（2006.8—）
  常委：杨益民（2006.8—） 李建辉（2006.12—） 王景星（2006.8—2006.12）
  陈健倩（2006.8—） 曾清金（2006.8—） 陈少华（2006.8—）
  洪于权（2006.8—） 朱新民（2006.8—） 高向荣（2006.8—）
  连泉富（2006.8—2007.5） 李元巍（2006.10—） 张永宁（2006.10—）
  洪学谋（2006.11—） 叶荣宗（2007.5—）
  二、工作机构
  1988年，中共晋江县委工作机构延续之前设置，由县委办公室、组织部、宣传部、统战部、对台部、政法委员会、县直属机关党委会及党史工作委员会、党校等构成。是年6月，县“五讲四美三热爱”活动委员会改称为县委精神文明建设领导小组，其办公室随之改称，并于1989年8月升格为正科（局）级工作机构；1989年10月，县委机要科改为县委机要局，定为副科（局）级行政机构，归县委办公室管理；1989年12月，县委党史委改称为县委党史研究室，为县委领导下的科研性质的科（局）级事业单位；1991年7月，设立县委社会治安综合治理委员会办公室，定为副科（局）级行政机构，与县委政法委合署办公。
  1992年5月，县委工作机构改为市委工作机构。至2007年，晋江市先后进行三轮党政机构改革，市委机构在历次机构改革中均有调整。
  1992年5月，晋江市被省委、省政府确定为全省县（市）级机构改革试点单位，并于1996年6月公布实施《晋江市党政机构改革方案》。作为党政机构改革的一个重要方面，市委机构改革以“理顺关系、调整结构，精简内设机构和人员，改善干部队伍结构，提高干部素质和工作效率”为目标，作如下调整：（1）纪律检查委员会机关与监察局合署办公。（2）设置市委工作部门7个：保留市委办公室（加挂市委政策研究室牌子）、组织部、宣传部、统战部（加挂市宗教事务局牌子）、政法委员会（社会治安综合治理委员会办公室与其机关合署办公）；台湾工作部更名为台湾工作办公室（加挂政府台湾事务办公室牌子）；撤销直属机关党委会，改设市直机关工作委员会，作为市委派出机构。（3）设置归口管理机构3个：市委机要局由市委办公室管理；精神文明建设领导小组办公室更名为精神文明建设办公室，由宣传部管理；市老干部局由组织部管理。（4）设置议事协调机构1个：撤销农村工作部，另设市委农村工作领导小组办公室，作为市委议事协调机构，并承担市委原农村工作部的职能和原市农业委员会的部分职能。在这轮机构改革中，市档案局与市档案馆合并，改为市委直属事业单位，保留市档案局牌子。1993年1月，市老干部局改称为市委老干部局，纳入市委工作机构序列；1995年5月，成立市委农村工作部，与市农业委员会实行“一套班子、两块牌子”。1998年10月，市委机构编制委员会办公室成立，加挂市人民政府机构编制办公室牌子。
  2002年4月，市委、市政府再次出台《晋江市党政机构改革方案》。在第二轮机构改革中，市委机构设置情况为：（1）市委工作部门9个：设置纪律检查委员会机关（归口管理），仍与监察局合署办公；保留市委办公室（仍挂市委政策研究室牌子，加挂保密委员会办公室、国家保密局牌子）、组织部、宣传部、统战部（不再挂市宗教事务局牌子，该局重新组建归政府序列）、政法委员会（综治办仍与其机关合署办公）、台湾工作办公室（仍挂政府台湾事务办公室牌子）、市直机关工作委员会；机构编制委员会办公室列入市委机构序列，加挂市人民政府机构编制办公室、事业单位登记管理局两块牌子，既是市委工作部门、又是政府工作部门。（2）部门管理结构3个：市委信访局（政府信访局）改列为市委机构序列，由市委办公室和市政府办公室共同管理、以前者为主；老干部局仍由组织部管理；精神文明建设办公室加挂精神文明建设指导委员会办公室牌子，仍由宣传部管理。（3）议事协调机构1个：保留市委农村工作领导小组办公室。
  2002年，晋江市被中央机构编制委员会办公室列为全国五个深化行政体制改革试点单位之一，适应完善社会主义市场经济体制和加入WTO后政府行为规范化的要求，以转变政府职能为先导、创新运行机制为主线、提高服务质量为核心，逐步推行政府职能转变、组织结构重组、工作流程再造、管理方式更新等改革措施。2004年，省委、省政府批准《晋江市创建公共行政体制改革试点方案》，并于是年8月全面实施。在这次改革中，市委设置党委工作部门7个：纪律检查委员会机关仍与市监察局合署办公；保留市委办公室（加挂政策研究室、保密委员会办公室、国家保密局、机要局牌子）、组织部、宣传部、统战部、政法委员会（综治办与其实行一个机构、两块牌子）、机构编制委员会办公室（加挂政府机构编制办公室、事业单位登记管理局牌子）。同时，把市委台湾工作办公室并入侨台外事局、市直机关工作委员会并入组织部、精神文明建设办公室并入宣传部、农村工作领导小组办公室并入农业局，保留上述机构的牌子；民族与宗教事务局再次并入统战部，保留政府机构的牌子；按有关规定设置老干部局、信访局，老干部局由市委组织部管理，信访局由市委办、政府办共同管理，以后者为主。
  2004年3月，为适应晋江非公有制经济迅速发展、非公经济组织党建工作亟须加强的需要，市委组建非公有制企业工作委员会，挂靠市委组织部，在市委的领导下统筹开展非公有制企业党建工作。其他工作机构延续至2007年不变。