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（一）第四次全国人口普查
  1989年5月9日国务院发出《关于进行第四次全国人口普查的通知》后，晋江县开始着手进行第四次人口普查。
  第四次人口普查的标准时间是1990年7月1日零时，普查项目共21项，比第三次人口普查增加户口性质、迁移状况及原因等两方面的内容。晋江县第四次人口普查的日常工作由县统计局主持。县政府决定成立晋江县第四次人口普查领导小组及其办公室，领导小组组长由副县长吴良良担任，成员23人，办公室设在县统计局内。
  1989年11月起，利用各种宣传媒介开展普查的宣传发动工作。
  1990年2月中旬至5月中旬，以公安部门为主，各级人口普查办公室参与，进行全省性的户口整顿。
  1990年3—6月，全省各级普查机构开始对普查人员进行培训。这次普查以村（居）委会所辖地域为单位划分普查区，在普查区内再划分调查小区。城镇实行切块划分，乡村按行政管辖区域划分。1990年6月25日，普查指导员、普查员进入调查小区入户摸底，编制户主姓名底册，安排入户登记时间。1990年6月29日、30日晚上，在公安、工商等有关部门的配合下，全县城镇普查员、普查指导员对没有固定居住点的外来流动人口进行突击清查登记。
  1990年7月1日开始，进行现场登记。登记结束后，对出生、死亡人口漏报现象进行重点复查补漏。8月初，开始第四次人口普查数据的手工汇总，到10月上旬完成。1992年3月，完成数据编码及其验收、录入、计算机汇总工作，录入前进行100％预审，录入后进行100％复录，发现差错进行100％核实更正。1991年12月，编印出版《晋江县1990年人口普查资料》。
  普查主要结果：1990年7月1日零时，全县总户数为183964户，其中家庭户181919户，集体户2045户；总人口931315人，家庭户人口903778人，集体户人口27537人。总人口中，常住本县，户口在本县的862598人，占92.62％；常住本县1年以上，户口在外县24624人，占2.64％；人住本县不满1年，离开户口登记地1年以上6510人，占0.70％；人住本县，户口待定35892人，占3.85％；原住本县，现在国外工作或学习，暂无户口1691人，占0.18％。全县汉族人口910945人，占97.81％；少数民族人口20370人，占全县总人口2.19％，分属27个少数民族。人口超百人的少数民族有回族、畲族、满族和壮族，这7个少数民族的人口20025人，占全市少数民族人口98.31％。全县总人口中，外国人加入中国籍694人。
  （二）第五次全国人口普查
  1999年下半年，根据1998年6月17日国务院发出《关于开展第五次全国人口普查的通知》和福建省人民政府关于开展第五次人口普查的总体部署，晋江市第五次人口普查工作正式组织实施。市政府发出《关于认真做好第五次全国人口普查工作的通知》，成立由李辉跃副市长担任组长的“晋江市第五次全国人口普查领导小组”，成员单位由公安、计生、统计、财政、宣传、教委、卫生、民政、广电、劳动、建委等19个部门组成。领导小组下设办公室，负责普查具体实施工作。1999年9月底，各镇人口普查领导小组全部组建，由镇（场）长担任组长，分管副镇长（副书记、党委秘书）担任办公室主任，抽调镇直有关部门人员专职参加普查办日常工作。2000年7月底，各建制村（居）相应成立以村（居）支书或村（居）主任担任主要领导职务的普查机构。
  本次人口普查经费采取“分级负担”的原则，市一级列入财政总预算的资金达298万元。各镇（场）基本上按人均不少于1元的标准下拨普查经费。2000年9月20日，完成所有普查指导员和普查员的选调工作。全市选调普查指导员和普查员5700多人，举办业务培训班50期，培训普查指导员1200多名，普查员4500多名。其中，由市人普办负责培训的普查指导员和普查员总人数1500多人。
  2000年11月1日，全市进入普查现场登记。11月24—25日，市人口普查领导小组19名成员和普查办全体工作人员分成四个检查组，分赴各镇进行检查，逐村进行复查，并在公安、工商等部门人员的配合下，重点对乡镇企业、“三资”企业、娱乐场所、建筑工地、出租私房等外来人员集中地进行全面清查、核对，发现错登、漏登，当场予以纠正、补登。
  2001年5月，初步形成全市的人口普查手工快速汇总数据。6月中旬，发表《晋江市第五次全国人口普查主要数据公报》。公报着重从总人口及分布、人口增长、家庭户、性别构成、年龄构成、民族构成、各种受教育程度人口以及城乡人口分布等方面内容进行说明。
  2002年底，第五次人口普查工作结束，历时4年。普查结果：2000年11月1日零时，全市总户数367489户，其中家庭户278862户，集体户88627户；总人口1479259人，家庭户人口1046296人，集体户人口432963人。总人口中，居住本乡镇、户口在本乡镇922454人，占62.36％；居住本乡镇半年以上、户口在外乡、镇、街道498476人，占33.70％；在本乡镇居住不满半年，离开户口登记地半年以上49559人，占3.35％；居住本乡镇户口待定7700人，占0.52％；原住本乡镇，现在国外工作或学习，暂无户口1070人，占0.07％。全市汉族人口1372717人，占97.42％；少数民族人口36389人，占全市总人口2.58％，分属36个少数民族。人口超500人的少数民族有回族、土家族、苗族、畲族、壮族、侗族、满族、布依族，这8个少数民族的人口共35173人，占全市少数民族人口96.66％。其他未识别的民族257人，外国人加入中国籍1人。