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（一）税收征管
  1994年，为督促企业健全账证、巩固纳税申报制度，全市国税系统组织专管员2500多人次到企业辅导财会人员按增值税要求进行会计处理，帮助近5000户企业完善账证。自动申报制度也扩展到农村个体户。
  1996年，将税收收入计划落实到至专管员，加强收入进度的监控。对部分进度较慢的分局，实行局长挂钩直接抓的办法，保证各地均衡入库。按照总局提出“以建立纳税申报和优化服务为基础，以计算机网络为依托，集中征收，重点稽查”的新的征管模式，设计新的征管规程，开发征管应用软件。加大现代技术手段在征管中的应用。实现试点税收电脑与银行的联网和税款自动划解，减少其在途时间；试行全市征管资料集中统一电脑化管理，简称全市电脑信息库，实现信息共享。
  2004年，市国税局结合一般纳税人年审，开展增值税一般纳税人清理工作，首次采取手工年审和CTAIS系统年审同时运行的办法。全市应参加年审2638户，年审2638户，年审面100％，经年审不合格取消资格118户，年审合格和经整改后准予保留一般纳税人资格的企业2520户；开展对增值税一般纳税人的类别审定工作，共评选认定160户企业为2004—2005年甲类纳税企业；依靠CTAIS系统信息资源，以增值税、重点税源、重点行业为主，人机结合，确定重点评估对象，积极开展评估工作；按纳税人信用等级将纳税人16816户划分为A级176户、B级12844户、C级3224户、D级572户等四类企业，确定科学、实用的监控办法。
  2005年，全面推行税收管理员制度，按照“属地管辖、分类管理、因事设岗、责任到人、监控到户”的原则，对全市重新划分管理片区，全市共设置28个管理片区，明确每一片区、每一业户的责任人。明确税管员的工作职责，并签订税管员岗位责任状。按要求做到分局长、副分局长也分别管5—30户（改波纹线）以上重点税源企业。推行税管员下户核查制度，通过下户核查掌握纳税人生产经营、产品销售及资金运作和财务处理、进销项发票抵扣报税等实际情况及相关指标分析的基础上，结合增值税预报警系统和纳税评估系统，出台《关于加强重点税源企业纳税评估工作的意见》，按照评估分析、约谈辅导、调查核实、评定处理等程序，对纳税申报的真实性和准确性进行全面系统评估，做到有的放矢，有效管理。
  2007年，加强和改进内外资企业所得税管理做好新《企业所得法》实施前的准备工作，跟踪分析税源变化，加强对一个实体、多块执照享受政策优惠、未满经营期的清算结算工作，全面清理外资企业有关企业所得税优惠政策。针对房地产企业利用2008年新税制与旧税制的税率差进行避税的现象进行调研，加强房地产企业的预缴、结算管理。进一步完善台账管理制度，加强对弥补亏损、固定资产折旧、无形资产摊销、减免税、工效挂钩、非货币资产投资确认所得、广告费、投资抵免等跨年度延续性管理事项的台账管理。
  （二）税务登记
  1994年，市国税局认真做好纳税人的认定和税务登记工作。在深入调查的基础，全市共认定一般纳税人2206户，换发税务登记证4617户，并进行重新造册，统一编码，分户归档，规范资料管理。全市归属国税管征的内资企业4613户，涉外企业761户，个体工商户7890户，清理漏管户137户。
  1997年，全市办理税务登记证户数12481户，其中集体企业4544户，个体工商户7937户，“三资”企业873户。
  1998年，税务登记验证工作取得成效，全市办理税务登记验证户数7273户，其中企业2991户，个体工商户4232户。
  2001年，开展对全市纳税人的税务登记证进行全面验证工作，全市办理税务登记证户数16113户，应验证14843户，验证14756户，验证率99.4％。
  2005年，以换发税务登记证为契机，采取联合换证、办证，在规范操作流程上实行“八统一”：即统一纳税人识别号、统一税务登记表、统一税务登记证样式、统一税务附报资料、统一登记注册类型、统一纳税人开户银行账号、统一国、地税共管户数、统一违章处罚，从而实现信息共享，进一步完善“一户式”管理。同时还联手地税局加强非正常户和注销户管理，实行信息交换与反馈，全面准确地掌握纳税户籍情况。全市办理换证15123户，基本完成换证工作。
  2007年，重新对税务登记流程进行梳理，进一步加强与地税、工商等部门的配合，充分利用信息交换比对分析，查找户籍管理的差异信息，有重点地分地域、分行业进行核实，开展清理漏征漏管户，全年计清理353户。进一步规范“一户式”档案资料管理，按照一般纳税人、小规模纳税人、纯营业税户三大类分征收类、管理类进行细化，组织开展征管基础资料真实、准确性的督促检查，严防失真。
  （三）发票管理
  1994年，晋江市建立发票管理监督网络，加强专用发票的源头管理，以市局票证站为中心，建立起市局、基层、企业二级监督网络，形成从印制、保管、发售、使用、检查、缴销、违章处罚一系列有效的管理办法，对专用发票实行“五专四审三看”（即专人负责、专车运送、专柜存放、专簿记录、专项管理，企业自审、专管员初审、审核小组复审、异地交叉审核；一看真假性、二看合法性、三看合理性），有效保证进销发票的安全、正确、合理使用。开展打击伪造、倒卖、盗窃发票专项斗争。市国税局密切与政府、公安、检察、法院等部门联系，建立起专项打击小组，协调指挥“专打”工作，查获该项案件9起，其中增值税专用发票70份，普通发票317份，结案6起，补罚税款41.2万；未结3起，扣押财产130万元。
  1995年，加强发票管理，全面改革发票管理系统（硬件管理和软件管理），完成硬件建设，健全安全防盗系统，设置安全库门、通信设备、防暴照明、24小时录像闭路系统等，全面开发运行电脑管理发票逐步走向全市联网。
  1996年，巩固“以票管税”机制，推出发票硬、软件管理办法，健全安全系统，运行电脑管票系统，进行发票购领、发票发售、核销查询、修改、违章记录、报送月报表、发票存根联、抵扣联录入、代管代开专用发票及利用电脑与专人相结合的交叉审核，充分发挥电脑功能。
  1999年，所统计的1998年度全市使用发票的小规模纳税人1378户，一般纳税人1400户，计使用普通发票4479本，其中作废339份，截角99份；使用增值税专用发票手工版2380本，其中作废811份，截角891份；使用增值税专用发票电脑版34575份，其中作废819份，在检查中对违反发票管理规定的各种行为进行处理，共补罚税款15444元。
  2000年，全市使用增值税专用发票的近500户企业通过防伪税控系统开票。加油机税控装置的推广使用工作迈出实质性的一步，计算机运用覆盖税收征管的全过程，全市90％以上的税源实现电脑监控。
  2007年，严格执行修订后的《增值税专用发票使用规定》及专用发票最高开票限额审批权限下放的规定，组织开展废旧物资经营企业、专用发票最高开票限额为100万元的防伪税控企业、一机多票企业、发票使用疑问户等四类企业的开票情况及失控发票、存根联滞留票等二类发票的专项核查工作，提高增值税管理水平。
  （四）纳税服务
  2001年，举行“金税杯”歌咏比赛，以群众喜闻乐见的形式进行税收宣传；以办税服务大厅为窗口，进一步规范服务环境，服务质量，服务纪律，深入开展“创文明行口、建满意窗口”“青年文明号”等活动，巩固服务承诺，简化办税程序，为纳税人提供优质高效的服务。征收局设立“绿色窗口”，专为方便老龄人、残疾人、孕妇、下岗职工等办税而设，办税厅人员对该窗口的服务对象优先服务。
  2004年，按照“一窗式”的要求，重新整合办税服务厅功能，按申报征收、发票管理、纳税服务（全程服务）三大类设立服务窗口，在对外纳税服务平台上，从纳税咨询、政务公开、文书索取、政策公告、税银联网上提供一揽子优化服务；继续推行多元化申报，巩固税银联网缴库方式。
  2005年，开发“出口供货企业网上报备系统”，税收管理员通该系统对全市出口供货情况进行比对，加强跟踪监督管理，及时掌握出口供货企业和商贸出口企业经营行为的动态变化，为出口供货企业提供不规范的出口商贸企业情况，有效化解生产性出口供货企业虚开发票的风险，不断充实服务内容，更新服务手段，进一步优化纳税环境。
  2007年，加强办税服务厅建设，在各办税大厅设立“一站式”综合服务窗口，统一受理纳税人除申报征收和发票管理外的其他涉税事项。通过计算机网络统一登记台账、打印回执、一次性告知和进行内部传递，实行限时服务制度，实现“一个窗口办理、一条龙服务、一站式办结”的运作模式，最大限度方便纳税人办理涉税事务和进行税务咨询。
  （五）税收信息化建设
  为实现征管改革与会计改革同步进行，1993年起，市税务部门加速推进税收征管计算机化的进程，成立电脑开发领导小组，着手开发电脑应用技术，当年购进微机22台，培训操作人员。鉴于晋江纳税人零星分散，以及资金、人力技术条件，采取重点试行、逐步铺开。1994年，在纳税人较集中的涉外分局及安海、青阳、陈埭、磁灶等分局搞试点，开展微机信息管理、会计电算化监控。1995年，国税涉外分局、国税安海分局、地税安海分局、地税磁灶分局实行纳税申报卡（即电脑IC卡）制，电脑自动打印税票，并与收银窗口联网，实现税银一体化，实现纳税申报各环节的严密监控和快速反馈。每月电脑开票平均在1.1万份，方便纳税人，提高工作效率，初步改变税务专管员管户的传统，可腾出人力充实稽查力量。对增值税专用发票的领用、销存也实行微机管理。税收会计电算化的推行也进一步普及和提高，普遍使用汉字通用报表软件，向上级局报送软盘。1994年以来，加大开发电脑应用力度，成立电脑管理室，统一开发设计，硬件建设和软件技术攻关齐头并进。
  2001年，为推进税收信息电子化，晋江国税精心组织“金税工程”建设。开展有关业务知识培训，加强指导监督，并在对市国税局电脑硬件设备需求量等相关工作进行调查摸底后，作好数据录入工作，保证金税工程转如正常化、规范化的运行轨道，迈出税务信息化改革坚实的一步。
  2002年，市国税局认真开展CTAIS各项试点工作，在市局网页上建立“CTAIS应用系统”专栏，以此布置、指导各分局做好信息数据采集工作。举行计算机基础应用知识及CTAIS模拟系统操作应用培训与考试，至2002年底，全局人员基本掌握计算机基础应用及CTAIS模拟操作系统的应用，共完成13846户纳税人40000多份税务登记信息表及第二阶段30000多份静态数据采集表的填写、审核工作，并按要求逐户整理归类、录入工作。CTAIS系统于2003年上线，及时出台与CTAIS工程配套的《晋江市国税局CTAIS工程倒计时工作方案》。2003年4月4日，CTAIS系统在全市国税系统同步成功上线，顺利地将全市1.5万户纳税人导入信息化管理。
  2006年，全面推行中国税收征管综合系统V2.0版、税收管理员工作平台、综合纳税服务平台（以下简称“三大平台”），提高办税效率，节省纳税人的办税成本。设立市局投诉中心，设立举报电话，统一受理及落实处理纳税人投诉的内部办事效率、服务态度和廉政勤政等方面的问题。陈埭分局对辖区内所有纳税人的联系电话进行信息采集，设置短信平台，推行纳税提醒服务，设置“财务之家”QQ群推行咨询服务；青阳分局试行服务质量评价系统。