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1997年10月，丰泽区人民检察院成立，内设办公室、刑事检察科、反贪污贿赂局、法纪检察科、民事行政检察科、控告申诉检察科、监察科等科室，有干警、职工33人。1998年，增设政工科。2000年，原刑事检察科分立为侦查监督科、公诉科，分别行使审查批捕、审查起诉职能。2003年，实行机构改革，增设职务犯罪预防科、行政装备科、司法警察大队（直属机构）、检察技术科，将法纪检察科更名为渎职侵权检察科。2004年，政工科升格为政治处，撤销检察技术科。2005年，渎职侵权检察科改为反渎职侵权局。至2007年，全院内设办公室、政治处、侦查监督科、公诉科、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、民事行政检察科、控告申诉检察科、职务犯罪预防科、行政装备科、法律政策研究室、监察科等12个处（室、局、科）和1个直属机构（司法警察大队）、1个派出机构，在编干警职工65人。
  根据《中华人民共和国人民检察院组织法》《人民检察院检察委员会条例》规定，区检察院设立检察委员会。检察委员会贯彻执行党的方针、政策和人民代表大会及其常务委员会决议、命令，承担讨论、决定、处理重大案件和疑难案件等职能。