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鲤城区植被属闽东南戴云山东部南亚热带雨林小区，典型原生植被为南亚热带雨林。由于自然因素及长期经济活动的影响，原生植被几乎破坏殆尽，仅清源山洞口、水流坑、弥陀岩周围及虹山乡的水尾等地局部有小片残迹可见。
  一、常绿阔叶林
  鲤城区有常绿阔叶林24058亩（1990年），除小面积为原生植被遭受破坏残留的次生林外，绝大部分为人工林，主要群落有七种：青冈栎、鹅掌柴群落分布于清源山洞口一带山沟坡地，属残存次生林；鹅掌柴、密花树、豺皮樟群落分布于清源山水流坑、弥陀岩、赐恩岩附近山地，属残存次生林；栲树、米槠群落分布于虹山乡苏山村口山坡地，属残存次生林；建楠、木荷群落分布于虹山乡水尾，属照叶林残迹；台湾相思树群落广泛分布于河市镇以南的近郊山地，多属萌芽次生林；木荷群落主要分布于罗溪林场和河市新庵岭，大部分为人工林；木麻黄群落分布在海拔50米以下的晋江下游和洛阳江的海滩、江岸和堤边，属人工防护林。
  二、暖性常绿针叶林
  主要群丛有四种，以马尾松林为主。马尾松林几乎遍布全区各地，面积达33万余亩，绝大部分为天然次生林；杉木林主要分布在马甲芦田深溪、罗溪林场和虹山白凤等立地条件较好的山地；建柏林仅分布在罗溪林场广桥场部和西岭；湿地松林分布较广。
  三、混交林
  多数系原生植被受破坏后阳性树种入侵生长形成的，主要群落有六种：杉木、马尾松混交林，分布于罗溪林场的樜溪、广桥和虹山的白凤、王坑后一带，系天然更新马尾松幼林；建柏、杉木混交林，仅小面积分布在罗溪林场场部、西岭；马尾松、油杉混交林，零星分布在河市、马甲一带，属天然次生林；马尾松、木荷混交林，分布在河市镇新庵岭、新告，为天然次生林；台湾相思树、马尾松混交林，主要分布在河市以南的近郊一带，多为天然次生林；麻栎、马尾松混交林，仅分布在河市镇新告一带，属天然次生林。
  四、竹林
  主要群落有二种：毛竹林分布在罗溪林场广桥和马甲镇芦田、新庵一带；青皮竹林主要分布于晋江下游沿岸的笋浯、新步、延陵一带沙壤地。
  五、灌草丛
  主要分布在水土流失严重、土壤瘦薄的山地，全区有280余亩，主要群丛有四种：芒萁骨灌丛，分布在鲤北荒山坡上；眉画草灌丛，分布在中部和南部山地立地条件差、土壤瘦薄、多碎石的地段上；桃金娘、小叶赤楠群丛，分布在中部和南部山地，属南亚热带中生性旱生性常绿灌丛；牡荆、黑面神、山芝麻群丛，分布在南部山地，属南亚热带中生性旱生性常绿灌丛。
  六、海岸植被
  有红树林的秋茄冬、大米草和互花大米草三种群丛，分布在城东镇前头村泉州湾岸段。
  七、沼生、湿生植被
  主要有三种群落：湿生草本植被，分布在狭小山沟和水沟两侧、池塘边缘、水田畦畔以及流水流经的地面；淡水湿生草本群落，分布在河流或淡水池沼中；半咸水湿生草本群落，分布在沿海与海洋港浦、沟渠两岸经潮水浸湿或咸淡水交替浸湿的半咸地带。