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1949年9月9日，晋江县人民政府成立，县长由中共福建省委第五地方委员会任命。县人民政府设立秘书室、民政科、财粮科、建设科、文教科、支前办事处、公安局、税务办事处和地方税征收处、军管邮电、交通银行等机构。
  1952年7月，县第二届各界人民代表会议第一次会议，选举县长、副县长各1人。
  1955年12月，改县人民政府为县人民委员会（以下简称人委会），在县首届第二次人民代表大会上选举县人委会委员24人、县长1人、副县长4人。
  1955年12月至1966年4月，县人民代表大会先后选举5任县长、副县长和人委会委员。县人民委员会工作机构增至37个：办公室、文教局、卫生局、民政局、监察局、人事科（含编委会）、劳动局、公安局、华侨事务局、档案馆、计划委员会、物价委员会、统计局、工业局、手工业管理局、交通局、水电局、农业局、林业局、水产局、畜牧兽医局、气象站、财贸办公室、财政局、税务局、粮食局、物资局、商业局、供销合作总社、工商行政管理局、专卖事业管理局、建设科、科学技术委员会等。至“文化大革命”前除少数单位撤并外，没有多大变动。
  1966年“文化大革命”开始，县人委会工作被迫停止。
  1968年10月28日，县革命委员会（下简称革委会）成立，设主任1人，副主任、常委、委员若干人。革委会设直属机构3大组，即政治组（下设群工组、人民保卫组、组织组、宣文组，代替原县委组织部、宣传部、监委会、农村工作部、城镇政治部、统战部、党校和原县人委人事科、文教科、体委、民政科、工商科、侨务科、海防部、公检法以及共青团县委、妇联、工会、政协、工商联），办事组（代替原县委办公室、县人委办公室、档案馆），生产指挥组（下设工交组、财贸组、农林水组、民政卫生组，代替原县人委统计局、物资局、计委会、工交局、商业局、供销社、农业水电局、粮食局、财政局、人民银行、水产局、卫生科、邮电局、手联社、支前办、财委会、物委会、建设科、劳动科）。1969年11月，人民保卫组从政治组中分出，县革委会直属机构改为4大组。自1968年10月至1976年，县革委会主任更迭6次，由5人担任（均由上级直接任命）。1976年10月“文化大革命”结束，同年12月撤销县革委会“四大组”，恢复部、委、办、局设置。1978年3月，恢复人民代表大会制度，召开县第七届人民代表大会第一次会议，选举革委会主任1人，副主任8人。
  1980年12月，召开县第八届第一次人民代表大会，取消革委会，成立县人民政府，大会选举产生县长1人，副县长5人。同时，决定党政分开办公。至1988年12月底，县人民代表大会共选举3任县长、副县长。
  1988年，县政府共有工作机构45个（包括内含单位21个），并专门设立县地方志办公室为事业单位。