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“文化大革命”全面开始。1966年5月到8月，晋江县“文化大革命”由学校向机关、城镇、农村全面展开。“造反派”“踢开党委闹革命”，党政机关均处于瘫痪状态。在“左”的思潮影响下，广大群众分裂为2大派，派性斗争日益严重。
  “三支两军”。1967年2月，中国人民解放军介入地方，对晋江县实行“三支两军”（支左、支工、支农、军管、军训）。同年7月，成立晋江县革命生产领导小组，取代晋江县党政机构职能，进行“抓革命、促生产”。实行“三支两军”，对稳定局势起了一定作用。
  建立革命委员会。1968年10月28日成立晋江县革命委员会（下称革委会）。总揽全县党政财文大权，所辖25个公社（镇、场）至1969年9月也全部成立革委会。1970年6月，成立中共晋江县革委会核心领导小组，各公社（镇、场）和县直机关单位也先后成立党的核心领导小组，以代表本地区、本部门党的领导。
  开展“斗、批、改”等运动。1969年夏，根据中央的部署，县革委会领导全县开展“斗、批、改”和“清理阶级队伍”、“一打三反”运动。同年10月，遵照毛泽东提出的建党“50字”方针，全县从机关到基层分期分批开展“整党建党”工作。1970年12月，中央揭发批判反革命分子陈伯达的罪行，1971年1月以后，党的各级领导机构逐步开展“批陈整风”运动。1971年“9·13”事件后，12月11日，中共中央将《粉碎林陈反党集团反革命政变的斗争》材料之一、二、三陆续下发。晋江县同全国一样，开展“批林整风”运动。
  全面整顿工作。1975年1月以后，中共晋江县委根据中央指示，对党、政等各级组织在政治上、思想上、组织上进行全面整顿。在整顿过程中，从增强党性、克服派性入手，认真落实干部政策，解放一大批干部，分配工作，调整和充实各级领导班子，党在各条战线的领导得到加强。同时抓工业、交通、农业及科技、文化教育的整顿。通过整顿，政治局面和经济状况开始好转。
  1976年，在所谓的“批邓、反击右倾翻案风”运动中，晋江县委在内坑召开会议，作出决议，在全县开展“反击右倾翻案风”运动，全面否定1975年整顿工作的成绩和调整充实后的领导班子。在组织上搞“突击入党”、“突击提干”，晋江县再次陷入混乱之中。广大党员、干部和群众以各种形式进行抵制。