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晋江县税务的征收和管理机构历代均有变动。宋设都税务、外税务，元改晋江务，明设税课局，清代县长官亲理钱谷，设常关征商税。民国时期税务机构随财政体制分立，国税设晋江分局，省税设晋江税务局，县设税捐经征处。
  新中国成立后建立统一的税务机构，实行由当地人民政府和上级税务机关双重领导的管理制度。
  第一节 征收管理
  民国前期对物税仍沿袭设卡征收通行税为主，民国31年（1942）以后，货物税采取驻厂、查定、起运3种征收方法，晋江对卷烟驻厂、酒商查定。营业税通过商会分摊，所得税常以行业估计为主。国税局系中央派出单位，与地方政权不相隶属，遇事请求县政府协助，常是公文旅行，不了了之。因而盐税、分散农村的土糖、酒曲等逃漏较多，对农村小商店营业税也鞭长莫及。省税在民国24年以前基本上是全省承包、辗转分包，以后改包办为委办。县地方税凡属居民负担的房警捐、自治捐等由保甲长征收，其余税收由税捐处自征，乡村屠宰税、戏剧娱乐税等也经常变相承包。
  新中国建立后，征收管理工作是协调征纳关系，实施监督，发挥税收经济杠杆作用的重要环节。征管内容包括：
  征收方法。货物税仍采取驻厂、查定、起运3种方法，工商业税采取自报查帐、民主评议、定期定额。对私改造完成后，国营、集体企业成为课税主体，征收方法以自报核查为主。经济建设新时期，多条流通渠道、多种经济类型并存，强化管征措施，对重点产品辅以源头控制。对集体、乡镇企业普遍采取所得税定率征收。
  管理形式。晋江县自1952年8月执行华东区城镇税收专户管理起，逐渐形成一套行之有效的管理形式，概括为：乡税分片统管，城镇分经济性质、集体分经济类型和组织形式专管。对若干行业的国营、集体、个体按同业统管，有利于平衡税负。在不同时期和空间，根据现实情况灵活运用，全县不强求一致。
  税务登记。50年代，规定固定工商业在开、歇业前20天内报送税务部门备查，只登记不发证。1982年8月全县税务登记，填发《税务登记证》10043户。1987年7月第二次登记发证，实行亮证经营。
  纳税鉴定。始于1956年，以取代“查定”、“评议”的过渡办法，达到依率计征。纳税鉴定申报表由纳税单位将其经营内容填入，由征收单位填入适用税目税率、纳税环节、缴款期限等，发给纳税鉴定书。如遇有税制变更、经营项目变化，征纳双方及时通报，随时修补鉴定。
  纳税申报。有纳税义务的单位和个人，按税务机关规定申报。晋江除在税务所组设置申报站外，为便利群众，还在水陆交通要道、农贸市场、商业密集地段增设。申报项目历来有兴有革，主要包括企业每月（旬）营业额申报、临时商进市进场申报、坐商外销进站场申报、小商贩进货申报。
  纳税检查。包括专管员对业户帐面检查、帐外调查。每年不定期开展全面性纳税检查，发动企业自查互查，检查组复查。税务检查站（队）定点或流动检查，稽查队进行专题、专案稽查。
  护税协税。1957年以前征税对象是私营经济。店员职工、民兵、妇女会、积极分子充分发挥护税作用，摊贩管理会、交易所、工商联是得力协税单位。在社会主义建设新时期，司法部门协同整顿税收秩序，以法治税；金融、交通部门协税。1985年4月起先后派7名检察干部常驻税务局。1987年5月成立晋江县检察院驻税务局检察室，有力地打击偷税、抗税犯罪活动，保护合法经营。
  第二节 稽查管理
  一、发票管理
  1949年以前发货票，一般用便条书立，粘贴印花税票加盖销售方兑货章为凭，少数工商户自印发票。1950年12月，晋江开始实行统一发票，由税务局印制提供，分为坐商、行商两种。后来根据纳税户的需求和严密征管的需要，多次改革版面、调整品种，套印发票监制章。1981年起国营、供销社发票也套印发票监制章。1986年7月起，全省统一改用椭圆型发票专用章。发票是财务收支的合法凭证、会计核算的原始凭证，税务稽查的重要依据，全国通行，但无全国统一样式。一些违法犯罪分子乘机钻空，晋江自1985—1988年查获伪造、非法购销发票牟利、偷税，被追究刑事责任的有19人。
  二、利润监交
  监交国营企业利润工作，先后由财政、税务分管或共管。1957年6月起，县税务局开始监汇7个中央、省属国营企业，36个公私合营企业，完成全年监汇利润任务79.7万元。1960年税务局全面接办国营利润监交工作。1965年监交国营企业收入196.2万元，亏损拨补114万元，实入库82.2万元。“文化大革命”动乱期间，监交工作停顿。1977年第三季度税务局重新接办监交工作。1984年10月实行利改税第二步改革，监交工作终结。
  三、违章处理
  宋制，私制盐三斤处死。对私卖酒曲至15斤，私酒3斗者处极刑。元代对犯私盐者杖七十、徒二年、财产一半没官。明代，盐场灶丁夹带私盐出场及贩私盐者处绞刑。民国时期对高税率，易走漏的税种处罚从重，犯私盐不及300斤者处五等有期徒刑；偷漏烟酒税没收货件并处10倍罚锾；偷漏印花税处以40倍以上罚锾；偷漏地方税规定处罚5倍以下罚锾。老百姓对苛滥税捐难以负担，常抵制不缴，统治当局则采取派军警追缴，发“传票”传追、发“手令”拘拿等手段逼迫。乡镇保甲催迫地方杂捐则各行其是。
  新中国建立后，违章案件处理重在教育，50年代初，对初犯者一般只写悔过书，补税不加处罚。继而执行税法所附罚则，对偷、漏、欠、抗税者根据不同性质，区别处理，欠税逾期未缴、按日加收5‰滞纳金。对使用欺骗手段逃避纳税行为的偷税、拒绝履行纳税义务的抗税、承包者侵吞税款等违法行为，除限期补缴外，处以5倍以下罚金。对直接责任人加处罚款，情节严重的予以监居教育或追究刑事责任。1983年永宁一个体商贩连续12个月抗税不缴，予以监居教育后，清缴税款9000元，邻近欠税大户纷纷自动缴纳。罗山乡有砖瓦厂100多户，个人承包企业后税款有被侵吞，1983年3至8月，全乡只缴砖瓦税300元，对1家欠税重点户的责任人监居教育后，其他厂相继缴纳，9月份入库9000元，10月份入库1.8万元。缺塘一家副食品厂1985—1986年以多种手段偷税14万元，只报缴应税额的5.5％，偷税额占应税额94.5％，对直接责任人绳之以法。
  第三节 计会管理
  税务管理还包括税收计划、会计、统计和票证管理。1950年以后执行全国税务会计会议统一制订的管理规定。以后时松时紧，造成混乱。1975年以后逐渐恢复和健全。
  一、税收计划
  晋江编造税收计划的原则是以国民经济为依据，结合侨乡特点，积极可靠，留有余地。强调税源调查，既不是高不可攀，也不是唾手可得，必须经过一番努力才能达到，从而促进组织收入，挖掘税源潜力。
  二、会计统计
  按照国家和省统一制订的税收会计规章制度，建立税收会计帐表，将税款收入按期以密码电报及报表上报收入成果。
  税款征解入库。一般填用《专用缴款书》，由纳税人直接向银行缴纳，边远地区、小额税款、流动性税源则自征或委托代征，填开完税证征收现金，按日或按期汇总缴库。
  严格退税手续。纳税单位或纳税人申请退税，必须在缴税之日起1年内办理。经批准的退税，从退税通知下达之日起1个月内有效。批准的退税申请书，填开“收入退还书”，向金库办理退库。
  统计核算。分为税收、税源、税政3大类，建立统计指标，结合实际，保持资料积累连续性。汇编必经逻辑审查，排除虚假，纠正错征。按期向上级税务局及县计统部门报送统计报表。
  三、票证管理
  税票在填用前是无价证券，填用后既是完税凭证又是会统原始凭证，因而历来对税票的印制、保管、填写订有严格制度。民国时期，征收人员遗失税票，制度规定有定额按定额赔偿，无定额者每张赔100元。填票应盖公私章，民国25年（1936）3月上旬，晋江税务局填开的营业税票部分漏盖经收人私章，省财政厅审核退回；填票员扣罚1个多月工薪；局长苏鹤年“监督不周，予以警告处分”。
  1949年10月以后，晋江对税票领、用、存各环节订有规章，审核税票发现错征办理退补。以1985年为例，5月发现赤砂糖760吨错用土糖税率计征，少收税款7.6万元，遂追补入库。11月发现征收彩印公司《外国企业所得税》多征2万多元，即通知退还纳税单位。
  多渠道查对纳税人完税凭证，揭露利用税票侵吞税款，“文化大革命”动乱期间，监管制度被批判为“管卡压”、“不相信群众”而废弛，有人则乘机钻空，乱中取利。1977年起恢复对外查票发现：10年前有报称未填用的《完税证》“被抢”而征税中饱；有乘征纳关系打乱，一人管征多个公社而大肆贪污，以及征收企业、流动商贩、采取税票“大头小尾”手段贪污。改革开放以来，商品流通领域扩大，在晋江纳税的完税证流向全国。着重加强检查起运税票，1986年查获不法商贩利用个体户纳税的收据洗改另填，冒充外运商品的完税凭证，侵吞税款。