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新中国成立初期，国家需要集中财力保证国民经济建设。国家集中统一管理粮食工作，实行统购统销。粮食企业的财政收支，包括流动资金和经营利润的拨缴、基本建设投资的拨款等，由粮食部统一管理，逐级汇总列入中央财政预算。各项财会规章制度由粮食部统一制定。
  “大跃进”时期，为发挥中央和地方两个积极性，根据中共中央1958年4月批准的《改进粮食体制的几项规定》，把中央集中管理改为购销差额管理，调拨包干。粮食部和财政部商定自1959年开始，把粮食企业财务收支下放省管理。粮食企业的盈亏、基本建设投资等预算调拨款项，均纳入地方财政预算；各项财会规章制度除必须由粮食部制定者外，均由省粮食厅会同财政厅制定。
  1961年重新实行高度集中统一的粮食管理体制。从1962年开始，粮食企业的财务收支重新收回粮食部集中统一管理，列入中央预算。
  “文化大革命”期间，粮食企业的财务收支，包括粮油超购加价款的支付，于1971年又下放地方管理，列入省级财政预算。这个做法增加地方财政负担，不利于贯彻多购一点的政策，并影响收购任务的完成。因此，1974年又改列入中央财政预算。
  1982年，省开始对地、市逐级实行粮油收购、销售、调拨包干的办法，粮食企业的财务仍列入省财政预算。由于管粮单位不管钱，权、责脱节，矛盾日益突出。根据中共中央《关于经济体制改革的决定》精神，为适应粮食流通体制的改革，搞活企业，提高经济效益，省人民政府批准从1985年开始，粮食企业财务下放至县，纳入县财政预算。
  列入地方财政预算作为政策性补贴的主要项目有：1.政策性亏损补贴；2.粮油提价补贴；3.生产资料价格补贴；4.议价转平价粮食差价地方补贴。粮食商业企业议价粮油经营利润实行“四五、五五”分成，即企业分成45％，财政分成55％；粮油工业企业实行利改税。在此基础上，1988年有4个工业企业实行第一轮承包经营责任制。
  1953年，国家制定全国统一的《国营粮食企业会计制度》，福建省结合省具体情况作了补充规定。晋江县粮食部门坚持执行制度，基本做到按照会计制度的规定进行会计核算，实行会计监督。与此同时，根据经济工作越做越细的要求，粮食企业不断改进和完善会计核算体制，主要是逐步把独立核算单位由大划小。中央粮食部成立后，实行政企合一的管理体制，粮食企业以县粮食局为独立核算单位，县局以下的企业为报帐单位。1957年，根据粮食部意见，基层粮食企业开始实行独立核算。之后由中心粮站核算改为按行政区域设置的粮站实行独立核算。至1988年底，晋江县基层独立核算单位计有27个，其中商业企业19个，粮油工业企业7个，饲料工业企业1个。
  县国营粮食商业企业1952—1988年平价粮油经营亏损计6787.68万元，1978—1988年粮油提价等政策性补贴计2599.75万元，1966—1988年粮油加价款计2524.39万元，1988年议价转平价粮食差价补贴计1085.86万元，1965—1988年议价粮油经营利润950.3万元。