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宋代，地方的水利工程，是由地方上负有名望的人主持兴修，钱、谷、工料由受益户承担。县官卸任应将所兴修的水利，书于“印纸”，酌量旌赏，并由各路常平司委知州办理上报。南宋乾道九年（1173）十一月，要求加强维修管理，对地方官在水利方面的政绩，严格优奖劣罚。民国32年（1943）4月1日，政府颁布水利法，各级主管水利机关依法办理水权登记，杜绝水利纠纷。
  新中国成立后，晋江县水利工程管理归晋江县人民政府建设科兼管。1954年成立水利修建委员会，1956年成立水利局。是年，水利工程管养工作全面加强，健全管理机构，采取群众性管理与专门性的组织机构管理相结合的办法，并以石塔乡为群众性重点管养试验乡。专门性的管理有晋东灌区，各抽水站，双宅、群生、新南、林口等水库和罗溪灌区、马甲灌区。除原管的晋东灌区外，各站、水库灌区进行接管，组织专门机构。1957年，县水利局设立管养股，专门管理水利工程。是年1月7日，晋江专区水利委员会发出《采取措施，防止晋江下游防洪堤人为破坏现象的通知》。4月13日晋江县遵照通知，组织管理机构，具体划分地界，南岸东山至前墩及浮桥至乌石归晋江县管，确定晋江下游防洪堤的管理范围。1958年9月16日，晋江县兴修水利指挥部成立，全县开展群众性兴修水利工程运动，9座小（一）型水库及38座小（二）型水库工程相继建成。1960年，中型蓄水工程新垵水库工程建成。以后，水利工程的管理工作进入科学管理，大坝的渗漏、沉陷、位移的观测，土坝土堤的蚁穴防治都配备专人负责，进行观测，建立资料档案，同时对大坝安全的隐患，及时进行处理。1958年以后，水利工程的基本建设和管理，均由县水利局工务股和工管股分管，工程的勘查、设计和施工由工务股负责，施工质量的管理由工务股派员现场督查。工程竣工后，移交工管股立项管理。1964年，各乡、镇（场）所建立水利中心站，专门管理各乡、镇（场）的各类水利工程。中型水库、晋东防洪堤及跨乡、镇（场）工程由县水利局直接管理。各乡、镇（场）所属各类工程，由各乡、镇（场）自行管理。1978年山美水库灌区工程配套完成后，晋江县灌区的晋南、仕头、新华、长福、洪堀、后库分别设立专管机构，配备适当人员，逐年进行维修以及工程配套。1979年对小（二）型以上水库工程分期进行保坝加固。截止1988年，全县38座小（二）型以上水库完成保坝加固的25座，对13处重点堤防工程保堤加固，加高培厚，同时进行小（二）型以上水库安全状况体检，对病库、险库加强观察，汛期实行各级责任制，党、政领导包堤、包库，确保水利工程安全运行。