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1995年3月，县委办、县政府办批转县审计局《关于乡（镇）长离任进行经济责任审计的意见》，乡（镇）长离任审计制度进入试点阶段。1996年起，把审计对象扩大到县政府部门领导和国有企事业单位的厂长（经理）。1997一1998年，受县委组织部的委托，对27名乡（镇）长和9名局长进行离任经济责任审计，共查出违规金额1976万元，处理上缴县财政107万元；审计的36名领导干部中，3名升任职务、30名转任职务、3名被降职使用。对15名国有企事业的厂长（经理）进行审计，共查出违规金额561万元，处理上缴县财政82万元；审计后有1名升任职务、4名转任职务、10名被免职。
  1999年，县审计局总结出一套适合安溪具体情况的“三结合”审计方法，制定《安溪县关于任期经济责任审计规程》，对经济责任审计规程进行规范。安溪县经济责任审计的做法，得到审计署《审计工作通讯》的肯定和推广。2000年，制定《关于进一步贯彻执行中央经济责任审计两个暂行规定的实施意见》，就审计对象、审计程序、审计内设机构、联席会议制度和审计成果运用等方面进行规范。安溪县经济责任审计做法在全省经济责任审计工作会议上作专题经验介绍。
  2001年，县审计局探索常规审计和经济责任审计相结合的路子，对乡（镇）8名正职领导、县政府部门2名领导干部和国有企业8名经理进行离任审计，共查出违规金额1900万元，处理上缴县财政156万元。实行财政财务收支审计与届中经济责任审计相结合的方法在省委组织部《福建组工通讯》上刊登。省审计厅经济责任审计处和审计学会专门派人到安溪进行调研，并在全国审计学会上介绍安溪县经验。2002年起，将过去以离任审计为主转向离任审计与任中审计相结合，对县政府部门27名领导干部进行经济责任审计，查出各种违规金额2975.16万元，其中，直接责任金额2156.04万元、主管责任金额819.12万元。组织部门参考审计结果给予降职2人。安溪县审计局将经济责任审计与常规审计相结合的经验在全省经济责任审计工作会议上介绍。
  2003年，县审计局突出经济责任审计与财务收支审计相结合，按照“积极稳妥、量力而行、提高质量、防范风险”16个字方针，对县政府部门20名领导干部经济责任进行审计，查出违规金额835万元，管理不规范金额4378万元。在延伸村级财务收支审计时，查出某村一个村民由村委会开出票据向县水电局领取无电村补助款3万元未入账。此案移送司法机关进一步查处。2004一2005年，探索离任审计与任中审计相结合，以任中审计为主的经济责任审计模式，共对39个经济责任项目进行审计，查出违规金额706万元、管理不规范金额5308万元、损失浪费金额131万元，并查出国有资产增值单位5个、保值单位14个、减值单位1个。安溪县审计局的经验分别在全省经济责任审计联席会议、全国部分县级审计局长培训班上介绍。
  2006一2007年，县审计局按照“摸家底、揭隐患、促发展”的思路，不断地完善、深化以任中审计为主、离任审计为辅的工作机制，共完成经济责任审计项目14个（其中，党政领导15人、企业领导2人），查出违规金额737.19万元、管理不规范金额5143.52万元。组织部门参考审计结果给予免职2人。