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本届县、乡选举工作从1987年3月上旬开始试点，7月下旬全面铺开，到11月底完成，全省79个县（市、区）和1964个乡（镇）全部选出人大代表，并召开新一届人民代表大会第一次会议。中共中央要求，这次县、乡换届选举要体现政治体制改革的精神，扩大民主，实行差额选举，通过换届选举，进一步加强县、乡两级政权建设。1987年1月，中共福建省委转发省人大常委会党组《关于县、乡两级人大换届选举工作有关问题的意见》，对这项工作作了全面部署。省六届人大常委会第23次会议，对本省《直接选举实施细则》作了修改，决定成立省选举工作委员会（下设选举工作办公室），加强对换届选举工作的具体指导。中共各地市县委都把换届选举工作作为一件大事来抓。省选举工作委员会配合各地市在7县1镇先行试点。全省绝大多数县（市、区），也先在一个乡或选区搞试点。
  本届约有85%的选民参加推荐代表候选人的活动，第一轮提名为应选名额的3.9倍，其中由选民10人以上联名推荐的代表候选人占90%，参选率达97.84%。全省共选出县级人大代表19981名，乡级人大代表68517名。县级代表中，民主党派和无党派人士占37.6%，妇女占22.9%；乡级代表中，分别占48%和21%。县级人大代表中，初中以上文化程度占74.9%，55岁以下占％.5%。各地按《地方组织法》规定，县、乡两级政权机关领导副职全部实行差额选举。有40个县（市、区）和550个乡（镇）的正职实行差额选举，分别占全省县、乡总数的50%和57%。选举产生的正、副县（市）、区长平均年龄43岁，大专以上文化程度的占73.6%；正、副乡（镇）长平均年龄37岁，高中以上文化程度的占72%。全省有13名副县长和99名正、副乡长由代表10人以上联合提名当选；有1名县人大常委会主任、16名正、副乡长和416名县、乡人大代表是从非候选人中直接投票选出的。从这一届开始，乡镇人大主席团设立专职常务主席，全省964个乡、镇人大主席团，有953个推选了常务主席，占98%。其中435个乡镇设立专职常务主席，有的乡镇人大主席团配备专职秘书，为乡镇人大开展日常工作创造条件。
  这次县、乡换届选举取得很大成绩，但也出现一些问题：一是选举基础工作不平衡，有的地方存在赶时间、赶进度的情况，工作做得比较浮；二是有的地方干部考核工作缓慢，造成选举工作被动；三是有的县级国家机关领导结构不够合理，全省有20个县（市）、区人大常委会正、副主任没有非中共人士，在364名正、副县长中，妇女仅22名，比上届减少54%；四是个别地方发生一些违法事件，如撕票、涂票、废票等问题，均已及时纠正或处理。