福建省图书馆

水师旗营建造之初，有3座庙宇也同时兴建：一是天后宫，位于琴江北门外，坐东南，向西北。二是观音殿，位于鲤冈山脚下。三是毓麟宫，旗营内共有2座。在承惠街的由旗营左翼的子孙供奉，在南门边的一座由右翼的子孙供奉。
  三江口水师旗营内随着人口的增加，庙宇数量、种类也不断增多，鼎盛时达数十座，几乎每个路口都有一座庙。如阳春街的西岳庙、协府口的东岳庙、南门边的娘娘庙（村内共有3个）、真武街的真武庙、首里街的观音殿、马家巷的三宫堂（敬天、地、人三神）、泗洲街的泗洲庙（供文佛）、德化街的吕祖庙（吕洞宾）、莲惠街的娘娘庙、泗洲街与承惠街交界处的医宫庙等等。这些庙宇除了天后宫是本土的，其余皆为北方汉族普遍信奉的神灵。在水师旗营的众神之中，妈祖地位突出。据《琴江志·各庙考》记载：“又北门外左旁，亦有天后宫，原系奉协领彝公灵阿长生禄位，初名行台庙。道光间，上游水患漂来天后神像，乡人遂供像于行台前殿，将彝公移供天后座后。座后之上有楼，供奉文昌、朱文公、魁星，因更行台之名，亦称天后宫。”关于协领“彝公灵阿”，《琴江志·补录阙漏》有记：“萨秉阿、穆图善两将军均有惠政及于吾乡，官兵皆有去后之思，爰立长生禄位，供于道头天后宫内。”“彝公灵阿”即为萨秉阿。“国变后（即辛亥革命后），乡有无赖某某，将北门外左旁之天后庙、鲤冈麓之观音殿、殿后之五圣庙拆毁一空”。（《琴江志·各庙考》）因而，位于北门外左边的天后宫在民国时期便损毁湮灭了。
  位于旗营北门外右侧的天后宫门两侧立有两方清代石碑，记录水师旗营旗人和洋屿汉族信士捐修宫庙的情形。这次修葺宫庙的时间是光绪二十八年（1902年）四月，由旗营贾勋、宋庚禄主持，共收到捐款654496文。碑刻记载了这些钱款用在石料、锯工、修路、筑堤等方面的详细情况。碑刻记录下旗营的领催、骁骑校等官员参与修建的名录，其中包含了从旗营出外为官的人士。例如：光绪十六年（1890年）庚寅进士黄曾源（官至翰林院编修、五省监察御史光绪二年（1876年）丙子举人黄运乾、贾繁禧、刘元陛；同治十二年（1873年）癸寅举人李九烈等。旗营官兵无不敬奉妈祖，每位福州将军来三江口巡查时，首先要到天后宫行香，然后才能入行台。每年冬天，福州将军来水师旗营阅兵，这是当时旗营极为隆重的日子。水操是将军检阅的重点。将军自行辕，经大街，出北门后，要先到妈祖庙进香。阅兵的福州将军到紧挨八浆船坞和督捕厅的妈祖庙进完香后，坐在庙前的戏台上，面朝西北，观看从八浆船坞出发的水兵们演练水操。
  晋江衙口粘厝街的粘氏祖祠旁紧挨着的是保生大帝的供奉处，而村内香火最旺的丁王爷庙粘氏也顶礼膜拜。在龙湖的粘厝铺，村内除有分支于此的粘氏三房各一座祖庙之外，最大的庙宇是龙天堂三王府，内供“佛祖妈”（观音）、“天王”、“夫人妈”三位神佛。
  福州德政桥下所祀珠妈称刘氏夫人，供奉在旗人所祀的珠妈庙内，这里是旗营的范围。《重建珠妈祖庙碑记》记载：“国初，因乾隆己卯……闻府铁岭刘公祷于神，得安，任董事重修。”这位刘公是辽宁铁岭人，是清乾隆时期（1736－1795年）福州的一位地方官员或者是一位汉军八旗的将领，有一定的社会地位，遇到病或灾，祭拜了珠妈庙后“逢凶化吉”，于是亲自任董事重修了该庙。到了嘉庆己卯年（1819年），“疸疹”在旗营辖地内肆虐，旗营派镶红旗协领吉隆阿处理此事。吉隆阿邀集十余名旗营将领集资重修珠妈庙，不但翻修一新，还将庙宇的地盘“展拓周围各十数丈，廓然而大之”。旗人的两次修庙，尤其是嘉庆己卯年吉隆阿组织的那一次之后，旗人将珠妈庙视作自己的庙宇，开始在此中烧香拜神。道光四年（1824年），旗人又对珠妈庙进行一次修缮。除了拜神之外，这里还成为旗人聚会的场所，婚丧喜庆常在这里举办。珠妈庙与位于福州道山路乌山北入口处对面的八旗会馆（原为明代宦官花园“中使园”遗址，清初改建为八旗旅闽官员住宿所）并列成为清代福州旗人的两大会所。