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检察统计工作最初由法律政策研究室负责，采用手工填录报表数据和汇总、人工上报的方式，报表使用高检院制定的《检察工作主要情况月报表（1986）》10种15张，1986年起实行统一管理、集中统计。
  1989年，高检院下发了《加强检察统计工作的规定》、《检察统计工作暂行规定》等，同时增加业务统计报表5张，使得报表数量增加至20张。省检察院也下发了相关的检察统计工作规定及通知，进一步规范并增强统计工作。
  1990—1991年，高检院将《检察工作主要情况月报表》增至17种23张，同时增加《检察统计非业务报表》8种24张，省检察院统计工作更加细化，将此项业务工作按高检院要求正式划归办公室管辖。
  1992年，省检察院统计科配备专职统计人员4名，承担着全省案件数据的汇总、审核、整理并上报的任务，并自上而下强调各分、市检察院配备一名专职统计员，各县（市、区）配备一名兼职统计员。在统计设备上，省检察院统计科配备2台计算机，并开始作为全国点对点通讯的试点单位，在全省范围内建立以统计电脑为基础的联网通讯，实现统计数据、信息数据的上下传输。
  1993年底，全省除个别县、市外，已经形成了较完备的3级点对点统计工作网络，省检察院与分、市检察院，分、市检察院与所辖区院之间均保持计算机网络畅通，报表数据采用人工填制，再输入到简单编制DOS版的计算机程序中，进行表间表内审核，结束了每月全省统计员集中会审的方式，扩大了统计范围，增加了刑检及自侦案件的台账。省检察院统计科开始在全省范围内组织相关的统计业务培训工作，统计工作进一步规范化、实效化。
  1994年，为规范统计工作流程、进一步提高统计数据质量，省检察院在省科委的星火计划立项，开始研发《检察工作辅助分析系统》软件，并与高检院办公厅使用的统计软件对接。
  1995年，全省各级检察院配备电脑99台。省检察院加大培训力度和范围，对系统内的统计员及内勤进行软件应用培训，提高全省统计队伍的工作能力。管理方面，省检察院采取一月一通报、一季度一会审的统计工作制度，保证了在全省统计员更换较多的情况下，26种统计报表及16种新的统计台账能及时、准确统计和上报。在软件研发上，配合研发组的技术人员，完成了《检察工作辅助分析系统》软件的测试、试运行工作，不断完善该软件。
  1996年5月，正式应用由福建省检察院参与研发的《检察工作辅助分析系统》（DOS版本）新程序，统计报表数据已由软件系统从录入的台账自动进行生成（不再采用手工录人报表数据的方式），使对报表、台账的统计更加规范、适用。同时，全省计算机已实现三级联网。报表和台账采用专线网络等报送方式进行传报。
  1997年，省检察院下发了《关于切实加强检察统计工作的意见》的通知，办公室统计科强化统计培训工作，举办培训班，提高各级检察院《检察工作辅助分析系统》的软件应用水平。
  1998年，《检察工作辅助分析系统》软件通过省科委计算中心评审验收。经逐步修改完善，应高检院要求更名为《检察机关案件管理系统》，面向全国推广使用。高检院的《检察工作主要情况月报表》变更为22种28张。
  1999年，根据高检院的部署，省检察院办公室开展为期一个月的全省统计执法大检查。通过自查、复查、抽查，纠正检查中发现的问题。
  2000年起，省检察院开始启用Windows版本的《检察机关案件管理系统》（AJGLxt—2000），报表和台账设置更加合理和规范，该系统逐步走向完善、规范。硬件方面，随着财政经费的许可以及电脑的普及，检察统计专用电脑也由最初的一个院一台（486机型、586机型）、一个部门一台发展到入手一台或两台。软件方面，为了适应和满足检察业务的不断变化和需求，以及《刑法》罪名的修正等，统计管理系统也随之不断更新和完善，功能也不断增强。
  2001年起，全省检察机关统计工作全面执行高检院制定的统计工作制度、案件登记卡、统计报表和填报说明。案件登记卡有《贪污贿赂案件登记卡》、《渎职侵权案件登记卡》、《审查批捕案件登记卡》、《审查起诉案件登记卡》、《刑事抗诉案件登记卡》等15类。统计报表有《贪污贿赂案件立案情况月报表》、《渎职、侵权案件立案情况月报表》、《审查逮捕情况月报表》、《审查起诉情况月报表》、《出庭公诉、起诉案件审判结果情况月报表》、《民事行政案件检察情况月报表》等28类。统计制度有《各类案件登记卡人工审核、检查细目》、《刑事抗诉案件检察统计填录细则》等。
  2002年，各地贯彻执行高检院印发的《检察统计工作实用手册》。
  2003年，检察统计方面新增了《人民监督员案件管理系统》。1月起，开始统一启用《检察机关案件管理系统》（V7.0—2003）。
  2005年，《人民检察院案件登记卡填录管理规定》等指导性文件在各级检察机关推行。
  1993—2005年，检察统计工作质量考核评比制度不断更新完善。1992年起，高检院、省检察院分别先后出台了3个版次（1992版、1999版、2003版）的检察统计质量考核评比标准。在全国的统计数据质量年度考评中，福建省的检察统计工作数据质量一直处于全国检察机关的前列，多次受到高检院办公厅的通报表彰。