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1993—1997年，全省检察机关按照高检院、最高人民法院、公安部下发的《关于严格执行办案期限，切实纠正超期羁押问题的通知》，认真开展羁押期限监督。
  1998年6月，按照高检院《关于清理和纠正检察机关直接受理侦查案件超期羁押犯罪嫌疑人问题的通知》的要求，全省检察机关对本院超期羁押犯罪嫌疑人情况进行全面清理。省检察院根据省委领导的指示，对全省看守所超期羁押问题进行全面的调查，向省委政法委专题报告。
  1999年，全省检察机关贯彻高检院《关于继续清理和纠正超期羁押犯罪嫌疑人、被告人的通知》，要求于8月底前，对各地检察机关立案侦查和审查起诉阶段超期羁押案件纠正完毕，对公安、法院等机关办案中超期羁押三年以上案件督促纠正完毕，于11月底前，对公安、法院等机关办案中超期羁押五年以上案件督促纠正完毕。5月，省检察院就3名犯罪嫌疑人、被告人严重超期羁押问题报高检院监所检察厅协调。10月28日，.省检察院向省委政法委专题报告，请求协调解决犯罪嫌疑人、被告人涉嫌强奸、杀人，严重超期羁押、久押不决案件。
  2000年3月，省检察院对7名被告人抢劫、抢夺、故意伤害、盗窃案上诉省法院超期一案，向省法院提出书面纠正。6月，省检察院就3名被告人严重超期羁押问题向省委政法委专题报告。8月，省检察院针对省法院二审案件超期严重情况向省委政法委专题报告，建议专题研究省法院二审超期问题。9月，为了进一步贯彻落实中政委《关于严格依法办案，坚决纠正超期羁押问题的通知》和省委政法委《关于开展专项执法检查和治理工作的通知》，省检察院开展纠正超期羁押专项执法检查和治理工作。9月，省检察院对羁押超期一至三年的75人、三至五年的13人、五年以上的4人案件进行重点督办。
  2001年3月，针对办案机关执行换押证制度不落实、不规范，影响超期案件统计、掌握和监督问题，省检察院在全省范围内开展办案部门执行换押证制度专项检察。3月7日，省检察院下发《关于进一步清理和纠正超期羁押问题的通知》，加强对超期羁押重点案件督办工作，对超期五年以上、三年以上的案件分别由省检察院和市检察院负责，督促纠正，并于2001年5月底以前全部纠正完毕。3月12日，省检察院就3名被告人涉嫌强奸、故意杀人一案久押不决十年的案件再次向省委政法委专题报告，建议省委政法委主持协调督促解决。至年底，全省纠正超期一年以下的585人、一至三年28人、三年以上7人。
  2002年，省检察院针对全省超期羁押边清边超、前清后超现象比较突出的情况，把开展清理和纠正超期羁押专项行动作为省检察院重点督办事项，由分管检察长具体负责，并对三年以上超期羁押案件实行挂牌督办。5月23日，省检察院对2名犯罪嫌疑人超期羁押长期得不到解决情况向省委政法委作专题报告。11月11日，省检察院针对泉州市超期羁押一年以上个案问题突出成为全省清理纠正超期羁押案件工作难点的情况，向省人大常委会专题报告。1一9月，全省共有超期羁押犯罪嫌疑人、被告人3429人。其中公安机关超期1332人、检察机关超期340人、审判机关超期1757人。到当年9月，尚有超期羁押犯罪嫌疑人、被告人565人。其中公安机关超期190人、审判机关超期375人。超期不满—年530人，一至三年的18人，三至五年的17人。自开展专项行动起，全省检察机关全年共清理超期羁押三年以上案件13件21人，其中超期羁押五年以上案件得到全部纠正。惠安县看守所关押的4名犯罪嫌疑人，超期羁押长达十年，省检察院分管检察长带队3次深人当地协调解决，使这起案件得以进入审判程序。
  2003年5月，根据高检院部署，全省检察机关开展清理纠正超期羁押专项行动。全省全年纠正超期羁押三年以上10件21人，一至三年19件32人，一年以下1137人。截至12月12日，全省尚余超期羁押个案5件16人，其中超期羁押一至三年1件5人，一年以下4件11人。2003年7月、12月和2004年12月相继实现和保持全省检察环节、公安环节、法院环节办案无超期羁押。
  2004—2005年，全省检察机关在清理纠正超期羁押工作基础上，重点加强预防和纠正超期羁押长效机制建设，从制度上、机制上巩固清理纠正超期羁押工作成果。全省检察机关相继建立羁押期限告知制度、羁押期限通报制度、羁押期限预警制度和催办制度、定期核对羁押期限制度，与省公安厅、省法院联合制定《关于羁押犯罪嫌疑人、被告人实行换押制度的实施细则》，细化换押范围、完善换押程序，解决因不及时换押造成假性超期问题，羁押期限监督工作步人良性发展轨道。这两年，超期羁押发生数大幅减少。