民国时期，县政府设建设科，主管农林水牧。中华人民共和国成立后，县人民政府设建设科，1956年2月改为农业科，1958年设立农林牧局，1968年改设农牧站，1971年改为农业局，主管农、林、牧业。1980年11月，农、林、牧分设至今。县农业局主管农业政策的贯彻落实，农业生产的计划安排，农业科技引进试验、示范、推广，农民科技人员培训以及农村合作经济的经营管理等。下辖7个场、站、公司、校、共有干部职工136人，其中科技人员52名。

县农业技术推广中心

1950年，成立县农业技术推广站，有职工11人。1956年增设大桥、位奇、陈户、花寨、双寨5个乡站，共有农技干部31名。1986年成立农业技术推广中心。全县除红寺湖乡外，其余9个乡皆成立了农技服务站，职工共38人。

种子公司 1965年设县种子站。1977年改为种子公司，年均经营种子150多万公斤，共有职工18人。

经营管理站和会计辅导站 1956年成立会计辅导队，1978年改为经营管理站。1984年成立会计辅导站，与经管站合署办公，共有职工6人。乡设经营管理会计辅导站，共招聘经管员、会计辅导员18人。

中央农业广播电视学校山丹分校、甘肃省农村应用技术广播电视学校山丹分校 分别于1981年和1984年成立，至1988年底，农广分校招收学员200人，16人取得中专文凭，13人被招聘为乡农技、农经员。农村应用技术广播学校招收学员2806人，有1084人领得合格证。

农村能源工作站 1984年成立。1987年农业部能源司把山丹县列为全国改灶试点县之一，省县投资25万元，民筹92万元，至1988年累计改灶2.5739万户，占全县总户数的96％。改炕5350铺，安装风力发电机33台。

良种繁殖场 1952年设立山丹县农场，1960年改为县园艺场，1963年定名山丹县良种繁殖场。1980年后年繁殖良种24万公斤左右，现有职工36人。

园艺场 1979年创建于山羊堡滩，有职工23名，耕地3200亩。至1988年，已建成防护林带300亩，栽植杨树12.5万株，定植果园面积1700亩。其中苹果108亩，2441株，现已结果的40亩；苹果梨1592亩，挂果的有200多亩。果品产量达4万多斤，拥有固定资产约100多万元。