山东境内的河流众多，比较重要的有黄河、运河、沂河、沐河、徒骇河、马颊河等，分属黄河、潍河、海河和边缘水系。

黄河，在山东属下游河段，自鲁西南东明县后双楼入境，向东北斜贯鲁西北平原，流经菏泽、泰安、聊城、济南、德州、惠民、东营等7个市地、21个县境，流程610余公里；河道上宽下窄，东明最宽处达20公里，位山以下有的不足1公里，最窄处仅300－400米。黄河径流量与中国其他江河相比，并不算多，每年平均约480亿立方米；但它的含沙量却高得惊人，平均每立方米河水含沙38公斤，最多时达650公斤，在世界各大河中居于首位。由于河道淤积，河床升高，有的地方河床高于河外平原，遂使黄河成为“地上悬河”，潜伏着极大危险。黄河历史上决口和改道极为频繁。新中国建立后，中国共产党和人民政府十分重视治黄工作，投资5.6亿元修建堤防、险口、控导工程、展宽工程和大小水库，开辟滞洪区，改变了历史上“黄河三年两决口”的状况，取得了三十六年伏秋大汛未决口的成就。随着黄河流域的开发和工农业生产的发展，黄河旧貌变新颜，已由千年害河逐渐变成造福于人民的益河。

山东运河，是京杭大运河流经山东的部分，纵贯整个鲁西大平原，全长560余公里，约占运河总长度（1750公里）的三分之一。山东运河，开凿于隋炀帝大业四年（六〇八年），经历了四次变迁：第一次是元朝忽必烈至元二十年（一二八三年）开济州运河；第二次是至元二十六年（一二八九年）开会通河；第三次是明嘉靖四十四年（一五六六年）开南阳新河；第四次是明万历年间开沥河。山东运河地处北方干旱地区，自然雨水缺乏，主要依靠大汶河、泗河济给。新中国建立前，山东运河除济宁以南还保持有限数量的民间航运外，济宁以北的河段，几乎全部干涸，而且有的地段连河道眉目也看不清楚了。新中国成立以后，山东人民在中国共产党和政府的领导下，开展了大规模治理运河的工程建设。东平以南，特别是济宁南北的运河，已修治一新。

沂河、沐河，是山东省南部两条较大的河流。沂河源于鲁中南山区的鲁山，经沂水、沂南、临沂、郯城等市县及江苏省的邳县、新沂县入骆马湖。沂河全长570余公里，20公里以上的支流有10余条，皆从右岸汇入，呈不对称的树枝状水系。沐河源于临朐县的沂山，流经沂水、莒县、莒南、临沐入江苏省境，全长400余公里，在临沐县境分成新、老两条沐河。老沐河经江苏省新沂县的新沂河入海；新沐河经大沙河故道至临洪口入海州湾。沐河在山东省境内与沂河平行纵贯鲁南，主要支流有浔河、袁公河和高榆河等，偏于左岸。

徒骇河，是鲁北平原最大排洪河系，源于河南省清丰县永顺沟，至沾化县入渤海，长410余公里。其主要支流有金线河、赵王河、苇河、七里河、赵牛河、土马河等。河口处低洼，滩地广布。马颊河也源于河南，由无棣县入渤海，长370余公里。

小清河，源于济南诸泉，向东北至寿光羊角沟流入莱州湾，全长230余公里。小清河水文变化稳定，可常年通航木船、拖轮，是山东省境内唯一的水陆联运、河海联运的河道。

总之，山东河流多为非常年水系，雨水多时河水多，雨水少时河水少，大旱之年则多干涸。所以山东河流能用于通航的极少。

山东湖泊主要分布在鲁中南山丘区与鲁西平原的接触带上，称为鲁西湖带，呈西北东南向。济宁以南称“南四湖”，济宁以北称“北五湖”。京杭运河自北而南从湖中穿过。另外，还有几个零星小湖泊，如济南的大明湖、章丘的白云湖、桓台的马踏湖等。

南四湖，由微山湖、昭阳湖、独山湖、南阳湖相连组成，是中国北方最大的淡水湖泊。湖身狭长，南北长126公里，东西最宽处22.5公里，最窄处3公里。在一般水位时，总面积为1240余平方公里。南四湖东依津浦铁路，西临苏鲁皖平原，南抵徐州，北达济宁。四湖之中，微山湖最大，540余平方公里，所以南四湖又通称为微山湖。湖区一般水深0.5－1米，最深处3米左右，湖底平坦，多淤泥，是重要的淡水养殖基地。湖里经济鱼类达60多种，水生植物也很丰富。

北五湖，由马场湖、蜀山湖、南旺湖、马踏湖、东平湖组成，除东平湖常年有水外，其余各湖已成为夏季积水的洼地。东平湖位于梁山、东平、平阴三县之间，南与运河相接，北经小清河水闸与黄河相通，是古梁山泊之余部，面积约100多平方公里，夏季水盛时可达150多平方公里，一般水深1－2米，最深处3.5米。东平湖除对调节黄河水量、灌溉农田、保证京杭运河通航有重要作用外，还是一个浅水富营养型淡水湖泊。它水质肥沃，水生动植物资源丰富，有鱼类50种，还盛产鳖、蟹、贝、螺、菱芡等。