2000年以来，区政府投入大量的人力、财力、物力，加速公路、桥梁建设，至2012年，境内有高速公路58.41千米、国道5.16千米，、省道30.69千米、县道66.79千米、乡道185.84千米、村道584.10千米。农村公路总里程达836.73千米，其中四级以上公路里程598千米。
高速公路
昌泰高速公路 为赣粤高速公路一段，境内33.43千米，途经长塘镇、兴桥镇、曲濑乡，沥青混凝土路面，双向四车道，2001年6月开工，2003年6月建成通车。在吉州区城北、城南分别设置互通立交和收费站。
武吉高速公路 为大庆至广州高速公路在江西境内的一段，区境内长12.07千米，途经兴桥镇、曲濑乡，双向四车道，沥青混凝土路面，2008年6月建成通车。
抚吉高速公路 抚吉高速公路吉安段长12.92千米，途经樟山、长塘镇，2011年4月开工，2012年11月通车。
国道
境内国道为105国道（北京至珠海）的一段，长5.41千米。2009年，井冈山大道南延，105国道改道，缩短里程0.25千米，即境内国道5.16千米，为沥青路面，双向四车道。
省道
吉新公路（厚莲线） 从吉州城区至新余市区，全长98.46千米，境内长14.88千米。1997年元月至2000年，投资1600万元改建为二级公路。昌泰高速公路在吉州区长塘镇设置互通立交，收费站在吉新公路离城区7千米处。该段公路又称吉安北大道，2005年9月升级改造，连接城北方向4.76千米改造升级为双向6车道二级街道标准；连接收费站方向2.10千米改造升级为双向四车道一级公路，沥青砼路面，新的北连接线路全长6.86千米。2007年底建成通车。
吉莲公路（上吉线） 吉州城区至莲花县公路，全长137千米，境内长15.81千米。2002年，由吉安市交通局当业主，对吉莲公路吉州城区至安福段进行二级沥青改造。昌泰高速公路在吉州区兴桥镇境内设置互通立交，起点由五岳观南移至吉州区城南，直接与105国道相交，与吉安赣江大桥呈直线对应。互通立交进、出口，向东至105国道称吉安南大道（又称迎宾大道），改造为双向6车道城市Ⅱ级公路和双向四车道一级公路，沥青路面。
县道
朱北公路 位于吉水县朱山桥至吉州城区北门桥，全长17.82千米，境内11.05千米，省养县道。2001年9月，境内将四级公路改为二级公路，路基宽12米、路面宽9米，沥青路面。2006～2007年，北门桥至螺子山段改造成双向6车道城市Ⅱ级公路，沥青路面。2012年，投资约4000万元，对朱北公路东庆化工厂至樟山镇金牛广场段，按城市双向6车道标准进行改造。
西四乡联网公路 从樟山镇经长塘、兴桥镇、曲濑乡至禾埠乡小湖江，是全区乡镇之间连接的主要通道，全长42.75千米，路基宽7米、路面宽6米，水泥混凝土路面。1992年规划，并进行了测量设计，全长46.02千米，因工程巨大，地方财力有限，十余年来迟迟未能动工修建，只在1993年对兴桥至芒东塘6千米路段进行了四级砂石路改造。2004年，区委、区政府把西四乡联网公路列入交通部门的考核项目，投资2209.20万元，当年动工并完工。西四乡联网公路构建了吉州区农村公路主骨架，方便了沿线7万多群众出行。2011年，投资420万元，对小湖江至电缆厂段进行改造，长2.71千米、路基宽8米、路面宽7米、沥青路面。由区公路管理站负责养护管理。
双长公路 从吉水县双村至吉州区长塘镇，全长51.65千米，境内长7.45千米，原为砂石路，2003年改建成四级水泥混凝土路面，路基宽7米、路面宽6米，2005年底全国农村公路专项调查时进行路网优化，辖区内7.45千米中从长塘至官塘十字路口处的3.42千米并入西四乡联网公路，故现在双长线在吉州辖区内只有4.03千米。由区公路管理站负责养护管理。
乡道
2012年，全区有乡道43条，总长185.84千米，硬化138.50千米。主要乡道有：
官李公路 从长塘镇官塘至李家坊公路，全长10.73千米，2004年，改建成四级水泥混凝土路面，路基宽7米，路面宽6米。
曲上公路 从曲濑镇至上塘村委会，全长1.10千米。2003年昌泰高速公路修建跨泸水河公路大桥时，在主桥上挂建了4米宽的人行附桥。2004年，借助附桥，新修了这条公路，路基宽6米，路面宽4.50米，四级水泥混凝土路面。。终结了泸水河两岸群众靠人渡往来的历史。
黄上公路 吉州黄洲至上塘公路，与上塘同一个区域。该路起于黄洲，止于吉安县高塘的乌石村，全长6.40千米，其中黄洲至模下路段4.50千米，路基宽6米，路面宽4.50米，四级水泥混凝土路面，于2004年与曲上公路同时建设。
白城公路 白塘至城上公路，全长3.76千米，四级水泥混凝土路。该路起于白塘街道正丙角，与吉州大道相交（原为阳明西路口），终点在白塘街道城上村委会，途经兴桥镇江边村委会仁家村。1994年，对正丙角至江边村路段进行砂石路改造，改造里程3.27千米，投资14余万元。2004年进行水泥路改造时延伸至城上，同时把周边蔬菜基地水泥路支线改造并列建设，项目总里程5.469千米。
村道
2000年，全区7个乡（镇）112个行政村有66条村道，能晴雨通车的有28条计39.24千米，高级、次高级路面为零。2005年，全国农村公路卫星测量专项调查数据，全区6个乡（镇）（含白塘街道），96个行政村，共有村道200条，计300.37千米，其中：水泥路面村道53条计42.06千米，沥青路面1条计0.85千米。2005～2010年，通村公路大规模建设，村道由以前的200条增加到390条，计426.10千米。2010年，实现了100％的行政村通油（水泥）路。至2012年，全区村道584.10千米、硬化道468.60千米。