2000年成立勘界工作领导小组，下设办公室（在区民政局内）。

2001年1月始，会同周边县、区全面进行边界勘定。年底，完成吉州区与青原区、吉水县、吉安县的行政区域80千米界线勘界工作。

2005年，完成吉州区与吉安县两地行政区域77.67千米界线的联检。

2006年，完成吉州区与吉水县两地行政区域边界线的联检和吉州区与青原区、吉安县的行政区域界线交会的联检。

2008年，与青原区、吉水县、吉安县开展对毗邻行政区域界线联合检查。

2011年2月，召开全区乡镇勘界工作会议，成立乡镇勘界工作领导小组，动员部署乡镇勘界工作。5月，兴桥镇开始试点乡镇勘界工作。

2010年11月至2012年年底，完成长塘镇、兴桥镇、樟山镇、曲濑镇、禾埠乡5个乡镇20条总长230.6千米的乡镇行政区域界线和4个三交点的勘定任务，并明确古南镇街道、永叔街道、文山街道、习溪桥街道、北门街道、白塘街道6个街道办事处的管辖范围。

古南镇街道：东邻赣江，南至神岗山，西与江西电线电缆有限责任公司和禾埠乡接壤，北与下田侯路和永叔街道为邻。

永叔街道：东邻赣江，南由下田侯路、高峰坡至太平桥与古南街道接壤；西从五岳观、赵公堂沿盘龙山至红卫垦殖场与禾埠乡、白塘街道交界；北沿中山西路、中山东路与文山街道毗邻。

文山街道：北起阳明路转人民路，南至中山路，东沿赣江边，西至吉州大道。

习溪桥街道：东邻赣江，东南接盐桥，南至人民路、阳明西路，西南接四方圆小区、白塘街道正丙角村、西溪山路，西北接凯震金鹭花园、白塘街道五里村，北至韶山西路、鹭洲东路，东北接白鹭洲、赣江。

北门街道：东邻赣江；南沿鹭洲东路，经马铺前路穿过井冈山大道至韶山西路，与习溪桥街道接壤；西至汽车大修厂与白塘五里行政村为邻；北与白塘街道高峰行政村毗邻。

白塘街道：北起吉安九中，南至古南塔，东至赣江边，西与兴桥镇交界。

樟山镇：东北面与吉水县金滩镇和黄桥镇毗邻，西与长塘镇交界，南面为吉州区工业园。

长塘镇：东接樟山，南接白塘，西和西南靠兴桥，北和西北接吉安县桐坪，东北邻吉水黄桥和西岭。

兴桥镇：东与白塘街道、禾埠乡为邻，南与曲濑镇交界，北与长塘镇、吉安县桐坪乡、固江镇接壤，西与吉安县梅塘乡隔河相望。

禾埠乡：北接兴桥镇，西与曲濑镇相邻，南接吉安县墩厚镇，东与青原区隔赣江相望。

曲濑镇：东接禾埠乡，南邻吉安县县城，西接吉安县梅塘镇，北连兴桥镇。

2012年9月20日，完成吉州区与吉水县两地行政区域44.66千米界线，自北向南走向，边界线从吉州区、吉安县、吉水县三县（区）边界线交会点界桩开始至吉州区、吉安县、吉水县三县（区）边界线交会点（赣江中心）结束，全线共埋设五个桩点，其中起点埋设一个三面型界桩，中间埋设一个双面型界桩，终点埋设三个同号单立三面界桩。边界线北段大部分地形以丘陵为主，居民地密集，新增地物较多，南段以赣江为界。