清代以前，李侗的著述都以《延平答问》行世，而无“文集”之名。到了清初，出现了题为《李延平先生文集》的刻本。最早的是顺治十一年（1654）李孔文在延平刊刻的五卷本。此本即《四库全书总目》卷一百七十四所著录的《延平文集》三卷《附录》二卷。
李孔文（1609-1662），字葆初，号鹏飞。清初延平府永安县人，因从军而侨居江苏吴门。他是宋儒李侗的二十世裔长孙。顺治十一年（1654）在延平刻印宋李侗撰《李延平先生文集》五卷。
延平李侗研究会存《剑津李氏家谱》钞本，载李孔文之子宗显撰《葆初公传略》，载其生平颇详，可补史志之载缺。移录于下：
先君讳孔文，字葆初，号鹏飞。必荣公次子也。年十五失怙恃。喜读孙吴韬略，善骑射，杖策游东粤。中崇祯丙子科武闱副榜。初任军门守备，转游击，擢孝陵卫团练参将。会鼎革，谒豫王札，授水师都司，实授江南操院，赏功游击，委官粮饷一应加派，尽行汰革。民间有“赏功李爷不要钱，收租大耗全蠲免”之歌。湖广湖花山山寇作乱，奉命征剿，屡建奇功。值福建未靖，操院升浙闽总制，督师南下。先君弃官随征。招抚延平沙、尤、永三县。是时投诚官兵多拘执营伍，独输诚，先君尽给照身归乡乐业。路逢骷骨，出赀掩埋，时人德之。海寇数踞，奉命招抚，先君捧圣旨入海，指陈利害，勒令归降，逆颇有顺意，为协从所阻，先君入都复命，逢圣旨购求遗书，为远祖文靖公请袭，蒙礼部批本省督抚投进，候命未下。
先君以武将起家，戎马中手不释卷。至会宾客，恂恂若儒者，尤敬重文士。翻印《延平文集》行世。复修祠庙，纂辑族谱。万历己酉生，年五十四，康熙壬寅卒。
此本卷一、二为《答问》，卷三为书八篇、行状一篇，诗三首，均李侗所撰。后有附录22则，为后人所撰。卷四为朱熹撰《行状》、《宋史·李侗传》、祭文、挽诗、朱熹《竹林精舍告先圣文》、汪应辰撰《墓志铭》。卷五为宋、元、明三朝的请谥文、书院记、祠记等。
卷首有宋赵师夏、明弘治周木两篇旧序，其后有清周亮工序，题琅玡后学李佐圣、尼山嫡派后学孔兴训、南兰陵后学季芷、吴郡后学何棅、古娄后学盛交泰、延平后学林润芝和袭封衍圣公孔兴燮等序，共八篇新序，述李氏刊此书原委甚详。周亮工序云：“先生生平不务著述，卒后，考亭辑其问答遗言。厘为三卷，传之四百余年，岁久弗戒于火。其裔孙葆初，向侨吴门，以参戎入闽，修葺祠宇，重锓之，以惠后学，而以其别集二卷，附之于后。适余行部剑津，因得而稽阅之。”
《四库全书总目》有两处提到此书，均持批评态度。一条是在卷一百七十四《延平文集》的提要中说：“宋李侗撰。侗有朱子所辑《延平问答》，已著录。此本乃侗裔孙葆初更汇诗文一卷附缀于后，改题此名，故《宋志》不载。前三卷均标曰朱熹编，其实朱子惟编《问答》，未编诗文，特借以为重耳。后二卷为附录，则朱子所为《行状》之也。”
检阅此书，与馆臣所说有所不同，不止是“前三卷均标曰朱熹编”，而是五卷每卷前均题“宋门人元晦朱熹编、同邑后学林润芝汇辑，宋后学赵师夏校、裔孙光熙辑甫氏、明后学琴川周木校、二十代裔长孙孔文重订梓”。
另一条在卷九十二《延平答问》提要中说“后侗裔孙葆初，别掇拾侗之诸文，增入一卷，改题曰《延平文集》，且总题为朱子所编，殊失其旧。今仍录原本，而葆初窜乱之本别存目于集部焉。”
此书的主要编纂者应是延平林润芝。他在卷首《李延平先生文集小引》中说：
予既服膺先生斯道，每叹斯集之废阙。手录一编，订其讹舛，分其卷帙，广其见闻，贮之笥中，拟付枣梨。予友葆初君于从戎之际，皇皇于谱牒之是求，乃又殚心于文章理学，亟求镌以垂来祀，其志洵足尚矣。予嘉其请而乐观厥成，因系一言于简末。……顺治癸巳长至日同邑后学林润芝延年氏敬书。
林氏的用心良苦，但限于学识，在“分其卷帙”的处理上，殊为草草。《答问》为朱熹手辑，本不应改动，却将《答刘平甫》二书，移至卷三；卷三书八篇、行状一篇，诗三首，均为李侗本人所著，后面却又收后人所撰附录22则。较好的作法是，此附录22则应全部移到卷四，与其他后学所撰编为两卷作为《附录》，真正成为《四库全书总目》卷一百七十四所著录的那样《延平文集》三卷《附录》二卷。更为重要的是，朱熹只编有《答问》，而未编文集，而在全书每卷前均题“宋门人元晦朱熹编”；周木只编有《延平答问续录》，也与文集无关，在全书每卷前也题“明后学琴川周木校”；如此标示，有违基本的史实，其实大可不必。
以“文集”为书名的刻本，还有康熙四十八年（1709）正谊堂全书本《李延平集》四卷，现存为清同治五年（1866）福州正谊堂重刻本。《丛书集成初编》本就是据此排印的。
此本的编排有条有理，远胜于李孔文刻本。卷前仅有张伯行一序，后为《目录》、《宋史本传》和《年谱》。卷一所有内容均李侗本人所著。分别为书信八通、《吴方庆先生行状》、诗三首。卷二为答问上，卷三为答问下。卷四为附录22则，加上朱文公撰《李先生行状》、朱文公《祭李先生文》、朱文公《祭李先生诗》等。全书既名《李延平集》，就不是朱熹的《答问》原本，所以也就不提朱熹所编，这是此本胜于李孔文刻本之处。