武夷精舍是朱子创建的第三所书院，在今武夷山景区五曲隐屏峰下。淳熙九年（1182）七月，朱子在浙东提举任上弹劾唐仲友受挫，次年正月奉祠而归武夷，建此书院，四月落成，此即朱子所言“经始于淳熙癸卯之春，其夏四月暨望堂成，而始来居之”①。

朱子《行视武夷精舍作》诗夹注自述书院建造始末云：武夷溪凡九曲，多急流乱石。此第五曲，水特深阔平缓，绿漪可爱。……峰下小山重复，中有平地数十丈，乔木长藤，茂林修竹交相蔽隐。旧无人迹，乾道己丑，予舟过而乐之。及今始能卜筑，以酬曩志。……方经始时，予以病不能来。至是送别山西，始自新村买舟以来，视所缚屋三间，制度殊草草。然背负大隐屏，面直溪南大山，左有魏王上升峰，右有钟模、三教等石，极为雄胜。②由此可知，在朱子之前，精舍故址还是“旧无人迹”的“蔽隐”之处，乾道五年（1169）朱子舟行过此，已有卜筑之意。十三年后，此愿方得以实现。然其规模，不过是草屋三间而已，故可在两三个月之内完工。

精舍营建之时，其友人赵汝愚正官福建安抚使，故命崇安县令、县丞以官帑相助营建，但被朱子婉言谢绝。朱子说：适闻崇安宰丞同到精舍，云被使檄有所营造，不知果然否？此是私家斋舍，不当恩烦官司。不唯在熹私义有所不安，加以踪迹孤危，动辄得谤，今更坐役官司起造屋宇，此正是好题目，彼等所日夜窥伺而不可得者。侍郎见念之悉，岂当以此祸饷之乎？春间在彼，亦有朋友数人欲为营葺，已定要束矣。……官司为之，于义既不可，于事亦不便。盖其一则必有骚扰，其二则不能如法，万一为之，自此熹更不敢入精舍矣。③由上文可知，赵汝愚之外，当时还有几位友人欲岀资营造，也被朱子谢绝。文中所言“日夜窥伺”的“彼等”，指的是唐仲友姻戚，时任宰相的王淮、吏部尚书郑丙等，当时正在朝中掀起一股反“道学”逆流。朱子不愿因此而授人以柄，更不愿因此而连累朋友。

对精舍的创建始末，朱子的友人，曾先后担任过建安知县和建宁知府的韩元吉有《武夷精舍记》，述此甚详：吾友朱元晦居于五夫山，在武夷一舍而近，若其后圃。暇则游焉，与其门生弟子挟书而诵，取古《诗》三百篇及楚人之词哦而歌之，潇洒啸咏，留必数日，盖山中之乐悉为元晦之私也。予每愧焉。

淳熙十年，元晦既辞使节于江东，遂赋祠官之禄，则又曰：“吾今营其地，果尽有山中之乐矣。”盖其游益数，而于其溪之五折负大石屏规之，以为精舍，取道士之庐犹半也。诛除草茅，仅得数亩。面势幽清，奇石佳木，拱揖映带，若阴相而遗我者。使弟子辈具畚镭，集瓦木，相率成之。元晦躬画其处，中以为堂，旁以为斋，高以为亭，密以为室，讲书肄业，琴歌酒赋，莫不在是。①朱子自撰《武夷精舍杂咏并序》描述了精舍的内部结构和外部环境，结合现存遗址来看，精舍面溪背山，占地约三亩。其原始格局大致为：隐屏峰下，两麓相拥之中，有居屋三间，名为“仁智堂”；堂左有“隐求室”，为朱子居室；右有“止宿寮”，奉迎亲友之用。山麓之外累石为门，称“石门坞”，坞内为生徒群居之所，称“观善斋二另有寒栖馆、晚对亭、铁笛亭等建筑。书院建成之时，四方学友士人云集，著名诗家词家陆游、辛弃疾、杨万里、袁枢等均有诗以记之。

精舍建成，南方各省的学子纷纷负笈前来从学。朱子为门人宿所“观善斋”题诗云：负笈何方来？今朝此同席。

日用无余功，相看俱努力。②其从学门人之盛，据朱子挚友、诗人陆游为朱子门人方仕繇撰写的墓志铭中，有“朱公之徒数百千人”①的说法。朱子本人则说“四方士友来者亦甚众”②。从淳熙十年到绍熙元年（1183—1190）朱子赴漳州任前的八年中，他主要在此聚徒讲学和从事学术活动。