倭寇侵扰我国沿海地区由来已久。明初，那些由日本南朝失败的政客、武士、浪人与走私商人结合形成的所谓“矮寇”，“时出剿掠，扰濒海之民”，愈显猖獗。从洪武二年到三十一年（1369-1398年）的30年中，就达23次之多。

明太祖对倭寇的防范，除严厉执行“片板不许下海”的海禁政策外，还加强沿海要地的防御建设。洪武二十年（1387年），江夏侯周德兴奉命经略福建时，“凡选丁壮万五千余人，筑城一十六，增置巡检司四十有五。分隶诸卫，以为防御”。他在莆田的防倭建设有：

平海卫在县东90里，扼海上冲，北峙草屿、连盘，东控鹭鹚、乌丘，西挹湄洲，与琉球、日本相望。南有南哨沃，北风时可泊舟，莆藩篱喉舌也。洪武二十一年（1388）置卫筑城。城周860.7丈，高1.4丈，广1.8丈，群城门5个（东1、西2、南2），上各建楼。垛高0.6丈，计垛1310个，警铺30个。系周德兴拆镇海堤石移建的。城南俯北仰，三面环海，一面背山，筑台以了望海洋。驻官军5516名。

当年巍峨壮观的平海卫城，现在尚能依稀可辨其古城垣轮廓。城内还保存不少文物古迹，古城古风犹在。

莆禧千户所在县东90里的新安里（今忠门镇蒲禧村），东、南、北三面临海，与湄洲岛相望。两南有文甲沃，亦滨海要地，洪武二十一年置所（千户所）筑城。城周590丈，广1.2丈，高1.3丈，城门4个，上筑城楼，并筑有月楼，垛高0.6丈，计垛1249个。警铺20个。城外西面凿山为旱濠，长210丈，广2丈，深0.8丈，与三面临海相吻合。驻官军1220人。隶属平海卫。

民国二十八年（1939），城被拆毁。现存有原城墙1335米，还有东、北2座城门及月城。城内有城隍庙及天妃宫等文物古迹。

此外，洪武二十一年设置的巡检司有六处：

迎仙巡检司。在县东北40里的待贤里，前临海后负江，为滨海要地。宋初置司于施水亭，洪武二十一年移置于此。

冲沁巡检司。在县东40里的兴福里，三面阻海，与崎头、三江、沃港相接。旧置司于兴化县寻阳山下，洪武二十一年移置于此。

嵌头巡检司。在县东80里的武盛里，界于山海之间，为登涉要地。洪武二十一年移莆禧巡检司于此。

青山巡检司。在县东90里的奉国里，东、西、南三面阻海，夷舟多由此入，南日山峙其南，渡海不过50里，为郡之门户。洪武二十一年移南哨巡检司于此。

吉了巡检司。在县东南80里的新安里。前控南日，右引小屿，左带湄洲，迫临大海。宋时建寨名吉蓼，亦名极了，以莆地至此而极也。洪武二十一年置巡检司，改为今名。

小屿巡检司。在县南醴泉里小屿山下。洪武二十一年移仙游枫亭驿巡司于此。以上六处巡检司，各筑城，城周长150丈，广1.1丈，辟城门2个，建有城楼。警铺8个。设弓兵100名。如今，沧海桑田，这六处巡检司的所在地，已不复见其庐山真面目了。